转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 97 / 149 下载 TSV

上一页 97 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000317 Chr03 NC_080389.1:3625869-3625879promoter 内 3-13 bp + 3988 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 3629867-3633029(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTAAGCTGTCG
SmilChr03G000907 Chr03 NC_080389.1:10402119-10402129promoter 内 3960-3970 bp - 31 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 10399492-10402088(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTAAGCTGTCG
SmilChr01G003052 Chr01 NC_080387.1:49472296-49472306promoter 内 3945-3955 bp + 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 49470488-49472250(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTC
SmilChr07G001113 Chr07 NC_080393.1:8233616-8233626promoter 内 3902-3912 bp - 89 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 8233715-8233786(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAA
SmilChr04G000095 Chr04 NC_080390.1:867979-867989promoter 内 3900-3910 bp - 91 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 868080-869279(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGA
SmilChr05G002143 Chr05 NC_080391.1:22597678-22597688promoter 内 3884-3894 bp + 107 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 22597795-22597990(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTAAGCTGTCG
SmilChr01G002459 Chr01 NC_080387.1:42230468-42230478promoter 内 3810-3820 bp + 181 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 42230659-42233117(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAAGCTGTCG
SmilChr05G001566 Chr05 NC_080391.1:14326468-14326478promoter 内 3809-3819 bp - 182 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 14326660-14326730(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTA
SmilChr03G001182 Chr03 NC_080389.1:13574384-13574394promoter 内 3807-3817 bp + 184 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 13574578-13577024(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTAAGCTGTCG
SmilChr03G001686 Chr03 NC_080389.1:22235778-22235788promoter 内 3807-3817 bp - 184 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 22235972-22236892(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGG
SmilChr05G001844 Chr05 NC_080391.1:18482655-18482665promoter 内 3807-3817 bp + 184 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 18480474-18482471(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCAC
SmilChr04G002584 Chr04 NC_080390.1:41241586-41241596promoter 内 3757-3767 bp + 234 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 41238639-41241352(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTC
SmilChr04G000517 Chr04 NC_080390.1:5699276-5699286promoter 内 3745-3755 bp + 246 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 5699532-5700239(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGCCA
SmilChr01G003119 Chr01 NC_080387.1:50004468-50004478promoter 内 3734-3744 bp - 257 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 50002361-50004211(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAAGCTGTCG
SmilChr07G000374 Chr07 NC_080393.1:2545458-2545468promoter 内 3716-3726 bp - 275 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 2545743-2549009(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAA
SmilChr04G002192 Chr04 NC_080390.1:35458624-35458634promoter 内 3641-3651 bp - 350 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 35458984-35459621(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGG
SmilChr04G000994 Chr04 NC_080390.1:13778016-13778026promoter 内 3633-3643 bp - 358 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 13778384-13779091(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTC
SmilChr02G004372 Chr02 NC_080388.1:66072785-66072795promoter 内 3571-3581 bp - 420 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 66071276-66072365(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCTAGCTGTCT
SmilChr01G003609 Chr01 NC_080387.1:54649879-54649889promoter 内 3545-3555 bp - 446 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 54650335-54651619(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGG
SmilChr01G002372 Chr01 NC_080387.1:40945476-40945486promoter 内 3542-3552 bp + 449 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 40945935-40950772(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCT
SmilChr02G001199 Chr02 NC_080388.1:22136612-22136622promoter 内 3536-3546 bp - 455 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 22137077-22137821(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGG
SmilChr06G002115 Chr06 NC_080392.1:28273223-28273233promoter 内 3516-3526 bp + 475 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 28273708-28273813(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGCCA
SmilChr04G000667 Chr04 NC_080390.1:7544472-7544482promoter 内 3493-3503 bp + 498 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 7541721-7543974(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGA
SmilChr05G000321 Chr05 NC_080391.1:2410652-2410662promoter 内 3426-3436 bp - 565 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 2403088-2410087(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGCCA
SmilChr07G000968 Chr07 NC_080393.1:7005227-7005237promoter 内 3416-3426 bp + 575 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 7002133-7004652(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAG
SmilChr01G003056 Chr01 NC_080387.1:49472296-49472306promoter 内 3401-3411 bp + 590 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 49471634-49471706(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTC
SmilChr01G002422 Chr01 NC_080387.1:41699588-41699598promoter 内 3393-3403 bp + 598 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 41698472-41698990(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGA
SmilChr05G000955 Chr05 NC_080391.1:7697228-7697238promoter 内 3338-3348 bp + 653 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 7697891-7702088(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCT
SmilChr03G004302 Chr03 NC_080389.1:61397280-61397290promoter 内 3329-3339 bp + 662 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 61397952-61398257(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGCCA
SmilChr02G001673 Chr02 NC_080388.1:30987274-30987284promoter 内 3295-3305 bp - 696 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 30987980-30989248(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGG
SmilChr05G004265 Chr05 NC_080391.1:56444119-56444129promoter 内 3279-3289 bp + 712 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 56439176-56443407(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGG
SmilChr07G000025 Chr07 NC_080393.1:116867-116877promoter 内 3201-3211 bp - 790 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 112773-116077(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCT
SmilChr01G004745 Chr01 NC_080387.1:65628639-65628649promoter 内 3192-3202 bp - 799 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 65626950-65627840(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGCCA
SmilChr01G003055 Chr01 NC_080387.1:49472296-49472306promoter 内 3181-3191 bp + 810 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 49471408-49471486(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTC
SmilChr02G001991 Chr02 NC_080388.1:36005424-36005434promoter 内 3144-3154 bp + 847 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 36006281-36008259(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCC
SmilChr04G004027 Chr04 NC_080390.1:55521617-55521627promoter 内 3128-3138 bp - 863 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 55517467-55520754(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGCCA
SmilChr03G000834 Chr03 NC_080389.1:9565438-9565448promoter 内 3016-3026 bp - 975 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 9563419-9564463(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTGAGCTGTCG
SmilChr01G004337 Chr01 NC_080387.1:61493297-61493307promoter 内 2980-2990 bp + 1011 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 61489743-61492286(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGA
SmilChr03G003642 Chr03 NC_080389.1:55100010-55100020promoter 内 2977-2987 bp - 1014 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 55097370-55098996(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTAAGCTGTCG
SmilChr04G002917 Chr04 NC_080390.1:45367286-45367296promoter 内 2974-2984 bp + 1017 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 45368313-45368873(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAAGCTGTCG
SmilChr01G003054 Chr01 NC_080387.1:49472296-49472306promoter 内 2871-2881 bp + 1120 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 49471092-49471176(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTC
SmilChr06G002240 Chr06 NC_080392.1:31721472-31721482promoter 内 2826-2836 bp - 1165 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 31719294-31720307(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCC
SmilChr01G001392 Chr01 NC_080387.1:27376375-27376385promoter 内 2819-2829 bp - 1172 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 27372506-27375203(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCTAGCTGTCT
SmilChr01G002800 Chr01 NC_080387.1:46490997-46491007promoter 内 2807-2817 bp + 1184 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 46492191-46494360(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGCCA
SmilChr04G000900 Chr04 NC_080390.1:11622144-11622154promoter 内 2760-2770 bp - 1231 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 11623385-11626005(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAA
SmilChr05G004128 Chr05 NC_080391.1:55195074-55195084promoter 内 2736-2746 bp - 1255 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 55196339-55198776(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTC
SmilChr04G001130 Chr04 NC_080390.1:16407572-16407582promoter 内 2733-2743 bp - 1258 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 16402897-16406314(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCC
SmilChr01G003053 Chr01 NC_080387.1:49472296-49472306promoter 内 2717-2727 bp + 1274 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 49470939-49471022(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTC
SmilChr01G000521 Chr01 NC_080387.1:10651749-10651759promoter 内 2700-2710 bp + 1291 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 10653050-10653156(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAAGCTGTCG
SmilChr01G001508 Chr01 NC_080387.1:28909631-28909641promoter 内 2680-2690 bp - 1311 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 28910952-28915196(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAG