转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 99 / 139 下载 TSV

上一页 99 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002639 Chr02 NC_080388.1:45800467-45800478promoter 内 2286-2297 bp + 1704 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 45794741-45798763(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCAACGTCAGGG
SmilChr03G000123 Chr03 NC_080389.1:1331377-1331388promoter 内 2270-2281 bp - 1720 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 1326611-1329657(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCGGACGTGGA
SmilChr03G004707 Chr03 NC_080389.1:64342988-64342999promoter 内 2238-2249 bp + 1752 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 64344751-64348496(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGCGGT
SmilChr03G004595 Chr03 NC_080389.1:63768843-63768854promoter 内 1745-1756 bp - 2245 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 63771099-63773539(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCACGTCACTG
SmilChr02G005359 Chr02 NC_080388.1:74312869-74312880promoter 内 1729-1740 bp - 2261 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 74307777-74310608(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACAGACGTGGT
SmilChr02G001172 Chr02 NC_080388.1:21540209-21540220promoter 内 1524-1535 bp + 2466 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 21542686-21544809(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGAGGC
SmilChr01G000464 Chr01 NC_080387.1:9522674-9522685promoter 内 1450-1461 bp - 2540 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 9525225-9527003(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCCCGTCAGCA
SmilChr03G002169 Chr03 NC_080389.1:33742564-33742575promoter 内 1229-1240 bp - 2761 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 33738165-33739803(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCTGACGTTGG
SmilChr03G000268 Chr03 NC_080389.1:3100572-3100583promoter 内 1149-1160 bp - 2841 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 3094510-3097731(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCTTGACGTGCC
SmilChr01G003469 Chr01 NC_080387.1:53233666-53233677promoter 内 1120-1131 bp - 2870 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 53236547-53239556(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCCCGTCAGCA
SmilChr02G001887 Chr02 NC_080388.1:34174396-34174407promoter 内 982-993 bp + 3008 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 34177415-34179319(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCGGACGTGGT
SmilChr01G002173 Chr01 NC_080387.1:37817663-37817674promoter 内 906-917 bp - 3084 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 37813497-37814579(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCTGACGTTGG
SmilChr03G000277 Chr03 NC_080389.1:3160940-3160951promoter 内 737-748 bp - 3253 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 3155663-3157687(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCTTGACGTGCC
SmilChr01G000631 Chr01 NC_080387.1:14187451-14187462promoter 内 701-712 bp - 3289 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 14190751-14204563(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCCCGTCAGCA
SmilChr02G004231 Chr02 NC_080388.1:64505883-64505894promoter 内 559-570 bp + 3431 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 64501118-64502452(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCTCGTCAGCA
SmilChr03G004705 Chr03 NC_080389.1:64342988-64342999promoter 内 505-516 bp + 3485 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 64335662-64339503(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCGCGTCAGCA
SmilChr04G001413 Chr04 NC_080390.1:22986971-22986982promoter 内 462-473 bp - 3528 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 22990510-22995892(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCCGTA
SmilChr03G000803 Chr03 NC_080389.1:9190995-9191006promoter 内 343-354 bp + 3647 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 9184666-9187348(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCTCGTCAGCA
SmilChr02G004504 Chr02 NC_080388.1:67569418-67569429promoter 内 3921-3932 bp + 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 67569498-67573393(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGGGACGTGGG
SmilChr03G002736 Chr03 NC_080389.1:43494827-43494838promoter 内 3601-3612 bp - 389 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 43490514-43494438(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGTGACGTGCA
SmilChr03G002752 Chr03 NC_080389.1:43747320-43747331promoter 内 3342-3353 bp - 648 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 43741341-43746672(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGTGACGTGCA
SmilChr02G001759 Chr02 NC_080388.1:32343284-32343295promoter 内 3208-3219 bp + 782 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 32344077-32354199(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACTGACGTGAA
SmilChr01G000758 Chr01 NC_080387.1:16648486-16648497promoter 内 2987-2998 bp + 1003 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 16649500-16652729(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCTGACGTGAA
SmilChr03G002408 Chr03 NC_080389.1:38269570-38269581promoter 内 1750-1761 bp + 2240 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 38271821-38274358(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCTGACGTGAG
SmilChr01G006168 Chr01 NC_080387.1:77173063-77173074promoter 内 1651-1662 bp - 2339 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 77167156-77170724(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACTGACGTGAA
SmilChr03G002584 Chr03 NC_080389.1:41102881-41102892promoter 内 1386-1397 bp - 2604 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 41105496-41109137(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCACGTCAGTC
SmilChr04G001449 Chr04 NC_080390.1:23813558-23813569promoter 内 1182-1193 bp - 2808 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 23810666-23810750(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACTGACGTGAG
SmilChr01G002965 Chr01 NC_080387.1:48535026-48535037promoter 内 721-732 bp + 3269 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 48524866-48531757(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCACGTCAGAT
SmilChr02G000430 Chr02 NC_080388.1:5506843-5506854promoter 内 435-446 bp + 3555 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 5510409-5511098(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGTGACGTGCT
SmilChr03G000113 Chr03 NC_080389.1:1241747-1241758promoter 内 396-407 bp + 3594 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 1245352-1248850(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCTGACGTTGA
SmilChr01G002035 Chr01 NC_080387.1:35987926-35987937promoter 内 109-120 bp + 3881 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 35982980-35984045(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCAACGTCAGCC
SmilChr01G005409 Chr01 NC_080387.1:71345050-71345061promoter 内 3983-3994 bp + 7 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 71341732-71345043(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCACGTCAGTC
SmilChr04G004053 Chr04 NC_080390.1:55707039-55707050promoter 内 3740-3751 bp - 250 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 55702812-55706789(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCTGACGTGAA
SmilChr01G002913 Chr01 NC_080387.1:47864648-47864659promoter 内 3659-3670 bp - 331 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 47859232-47864317(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACTGACGTGAA
SmilChr03G003029 Chr03 NC_080389.1:47217823-47217834promoter 内 3627-3638 bp + 363 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 47215559-47217460(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTCACGTCAGTG
SmilChr02G001119 Chr02 NC_080388.1:20155790-20155801promoter 内 3611-3622 bp + 379 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 20156180-20156251(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGTAGG
SmilChr01G001203 Chr01 NC_080387.1:24253201-24253212promoter 内 3514-3525 bp - 476 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 24250444-24252725(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCTGACGTGAA
SmilChr04G002732 Chr04 NC_080390.1:42973661-42973672promoter 内 3444-3455 bp + 546 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 42974218-42975671(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCTGACGTGAA
SmilChr04G002974 Chr04 NC_080390.1:46104446-46104457promoter 内 3412-3423 bp - 578 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 46102961-46103868(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGTAGG
SmilChr02G000794 Chr02 NC_080388.1:13110503-13110514promoter 内 3345-3356 bp - 645 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 13111159-13114865(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCACGTCAGTC
SmilChr04G003033 Chr04 NC_080390.1:46776967-46776978promoter 内 3333-3344 bp - 657 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 46777635-46778045(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCACGTCAGTC
SmilChr04G003344 Chr04 NC_080390.1:50090957-50090968promoter 内 3127-3138 bp + 863 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 50091831-50102391(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACTGACGTGAT
SmilChr03G003030 Chr03 NC_080389.1:47217823-47217834promoter 内 3022-3033 bp + 968 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 47218802-47222273(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACTGACGTGAA
SmilChr04G003892 Chr04 NC_080390.1:54715138-54715149promoter 内 2902-2913 bp + 1088 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 54716237-54718448(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCTGACGTAGA
SmilChr02G001118 Chr02 NC_080388.1:20155790-20155801promoter 内 2759-2770 bp + 1231 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 20154472-20154559(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCTACGTCAGCT
SmilChr02G005144 Chr02 NC_080388.1:72843745-72843756promoter 内 2708-2719 bp - 1282 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 72840117-72842463(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCTGACGTGAG
SmilChr03G003778 Chr03 NC_080389.1:56927776-56927787promoter 内 2614-2625 bp - 1376 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 56925858-56926400(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACTGACGTGAT
SmilChr02G002652 Chr02 NC_080388.1:45977041-45977052promoter 内 2566-2577 bp - 1424 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 45972579-45975617(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGCG
SmilChr02G003374 Chr02 NC_080388.1:54883132-54883143promoter 内 2542-2553 bp + 1448 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 54884591-54887300(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCTGACGTGAA
SmilChr02G002188 Chr02 NC_080388.1:39079391-39079402promoter 内 2361-2372 bp + 1629 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 39076725-39077762(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCAACGTCAGCC