转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 100 / 143 下载 TSV

上一页 100 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000902 Chr04 NC_080390.1:11748075-11748086promoter 内 724-735 bp + 3266 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 11742061-11744809(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAA
SmilChr01G001112 Chr01 NC_080387.1:22738540-22738551promoter 内 690-701 bp + 3300 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 22734524-22735240(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAA
SmilChr04G003594 Chr04 NC_080390.1:52365808-52365819promoter 内 638-649 bp - 3352 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 52369171-52376162(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCAA
SmilChr07G002676 Chr07 NC_080393.1:26172672-26172683promoter 内 605-616 bp - 3385 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 26167380-26169287(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAAAGCTGTA
SmilChr01G006012 Chr01 NC_080387.1:75694904-75694915promoter 内 604-615 bp - 3386 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 75698301-75699155(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCTA
SmilChr07G003652 Chr07 NC_080393.1:43437888-43437899promoter 内 567-578 bp + 3423 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 43441322-43442038(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAAAGCTGTA
SmilChr07G004651 Chr07 NC_080393.1:59339629-59339640promoter 内 540-551 bp + 3450 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 59326854-59336179(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTTAA
SmilChr08G001834 Chr08 NC_080394.1:15710489-15710500promoter 内 526-537 bp - 3464 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 15713964-15714861(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTAC
SmilChr03G000201 Chr03 NC_080389.1:2279184-2279195promoter 内 502-513 bp - 3488 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 2282683-2287094(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCTA
SmilChr03G004288 Chr03 NC_080389.1:61288386-61288397promoter 内 490-501 bp - 3500 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 61282888-61284886(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGGG
SmilChr04G000818 Chr04 NC_080390.1:10268191-10268202promoter 内 465-476 bp + 3525 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 10271727-10273562(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGGG
SmilChr03G002204 Chr03 NC_080389.1:34685514-34685525promoter 内 409-420 bp - 3581 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 34689106-34692549(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCTT
SmilChr04G001951 Chr04 NC_080390.1:31704022-31704033promoter 内 400-411 bp - 3590 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 31707623-31710548(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAA
SmilChr07G001586 Chr07 NC_080393.1:13106596-13106607promoter 内 384-395 bp - 3606 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 13110213-13111340(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAA
SmilChr06G000660 Chr06 NC_080392.1:5810187-5810198promoter 内 274-285 bp + 3716 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 5805804-5806471(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCTT
SmilChr06G001894 Chr06 NC_080392.1:22684586-22684597promoter 内 239-250 bp + 3751 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 22676724-22680835(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAA
SmilChr08G000897 Chr08 NC_080394.1:6645504-6645515promoter 内 157-168 bp + 3833 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 6636724-6641671(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCTT
SmilChr05G003343 Chr05 NC_080391.1:43981519-43981530promoter 内 59-70 bp + 3931 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 43985461-43987031(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAAAGCTGTA
SmilChr05G001595 Chr05 NC_080391.1:14666974-14666985promoter 内 32-43 bp + 3958 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 14662138-14663016(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTTAA
SmilChr02G003937 Chr02 NC_080388.1:61450627-61450638promoter 内 3976-3987 bp - 14 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 61449314-61450613(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAAAGCTGTA
SmilChr06G001435 Chr06 NC_080392.1:15161285-15161296promoter 内 3509-3520 bp + 481 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 15157014-15160804(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTATA
SmilChr02G000633 Chr02 NC_080388.1:9535582-9535593promoter 内 3261-3272 bp + 729 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 9536322-9536798(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCAG
SmilChr01G004165 Chr01 NC_080387.1:60157313-60157324promoter 内 3234-3245 bp + 756 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 60151027-60156557(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAACTGTCAA
SmilChr08G002726 Chr08 NC_080394.1:26889991-26890002promoter 内 3157-3168 bp + 833 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 26890835-26892570(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGTCCAGCTGTT
SmilChr06G003272 Chr06 NC_080392.1:45319789-45319800promoter 内 2834-2845 bp + 1156 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 45317026-45318633(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTACC
SmilChr01G003342 Chr01 NC_080387.1:52203285-52203296promoter 内 2430-2441 bp - 1560 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 52204856-52207135(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTTAA
SmilChr04G003437 Chr04 NC_080390.1:50918610-50918621promoter 内 2410-2421 bp - 1580 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 50915997-50917030(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGGT
SmilChr03G000707 Chr03 NC_080389.1:7870868-7870879promoter 内 2222-2233 bp + 1768 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 7864881-7869100(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTTAA
SmilChr02G005534 Chr02 NC_080388.1:75396933-75396944promoter 内 1523-1534 bp - 2467 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 75392178-75394466(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTAAC
SmilChr04G003542 Chr04 NC_080390.1:51776343-51776354promoter 内 707-718 bp + 3283 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 51769028-51773060(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTAA
SmilChr03G000463 Chr03 NC_080389.1:4960518-4960529promoter 内 693-704 bp - 3297 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 4952720-4957221(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGGT
SmilChr04G003438 Chr04 NC_080390.1:50918610-50918621promoter 内 677-688 bp - 3313 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 50921934-50925611(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTTAA
SmilChr01G003341 Chr01 NC_080387.1:52203285-52203296promoter 内 621-632 bp - 3369 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 52198054-52199916(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGGT
SmilChr02G005536 Chr02 NC_080388.1:75396933-75396944promoter 内 269-280 bp - 3721 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 75400665-75404228(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCTA
SmilChr02G003945 Chr02 NC_080388.1:61598633-61598644promoter 内 227-238 bp + 3763 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 61591200-61594870(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCACCTGTCAA
SmilChr08G002860 Chr08 NC_080394.1:28430211-28430222promoter 内 3969-3980 bp - 21 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 28429414-28430190(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAA
SmilChr03G000073 Chr03 NC_080389.1:912256-912267promoter 内 3950-3961 bp - 40 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 911287-912216(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAAAGCTGTA
SmilChr03G000182 Chr03 NC_080389.1:1945474-1945485promoter 内 3949-3960 bp + 41 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 1945526-1946420(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAAAGCTGTA
SmilChr08G003185 Chr08 NC_080394.1:32568811-32568822promoter 内 3942-3953 bp - 48 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 32568870-32568941(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAACTGTCAA
SmilChr08G002443 Chr08 NC_080394.1:23244456-23244467promoter 内 3860-3871 bp + 130 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 23244597-23246804(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAA
SmilChr01G005494 Chr01 NC_080387.1:71857580-71857591promoter 内 3847-3858 bp + 143 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 71853840-71857437(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAACTGTCAA
SmilChr01G001215 Chr01 NC_080387.1:24409070-24409081promoter 内 3827-3838 bp + 163 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 24409244-24415649(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAAC
SmilChr01G001173 Chr01 NC_080387.1:23788290-23788301promoter 内 3812-3823 bp + 178 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 23788479-23792190(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAAC
SmilChr02G005563 Chr02 NC_080388.1:75555845-75555856promoter 内 3704-3715 bp + 286 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 75556142-75559613(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAAAGCTGTA
SmilChr05G000389 Chr05 NC_080391.1:2922088-2922099promoter 内 3698-3709 bp - 292 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 2919259-2921796(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAA
SmilChr08G003688 Chr08 NC_080394.1:41203793-41203804promoter 内 3636-3647 bp - 354 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 41200216-41203439(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAA
SmilChr08G003184 Chr08 NC_080394.1:32568811-32568822promoter 内 3632-3643 bp - 358 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 32567777-32568453(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAA
SmilChr03G002422 Chr03 NC_080389.1:38475340-38475351promoter 内 3620-3631 bp + 370 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 38475721-38477405(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAA
SmilChr08G002250 Chr08 NC_080394.1:20738789-20738800promoter 内 3578-3589 bp - 412 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 20737399-20738377(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATACAGCTGAC
SmilChr01G004731 Chr01 NC_080387.1:65492299-65492310promoter 内 3554-3565 bp - 436 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 65492746-65494127(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCTA