转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G002953; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011004-RA_Salv SmilChr04G002953 ARF XP_057809314.1 MP00033 TTTGTCGGC

可能结合的靶基因

9827 个结合位点 7406 个候选靶基因 第 100 / 149 下载 TSV

上一页 100 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000422 Chr04 NC_080390.1:4490728-4490736promoter 内 1255-1263 bp - 2738 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 4481287-4487990(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr04G002273 Chr04 NC_080390.1:36869170-36869178promoter 内 1252-1260 bp - 2741 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 36862516-36866429(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr02G000315 Chr02 NC_080388.1:3970830-3970838promoter 内 1248-1256 bp - 2745 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 3973583-3976334(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr03G003116 Chr03 NC_080389.1:48286655-48286663promoter 内 1244-1252 bp + 2749 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 48289412-48291694(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr02G005495 Chr02 NC_080388.1:75108690-75108698promoter 内 1226-1234 bp + 2767 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 75104660-75105923(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr01G002484 Chr01 NC_080387.1:42564451-42564459promoter 内 1203-1211 bp + 2790 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 42567249-42570302(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr02G005472 Chr02 NC_080388.1:74978919-74978927promoter 内 1177-1185 bp + 2816 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 74981743-74983403(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr01G002029 Chr01 NC_080387.1:35868332-35868340promoter 内 1168-1176 bp - 2825 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 35864563-35865507(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr01G000942 Chr01 NC_080387.1:19947749-19947757promoter 内 1126-1134 bp + 2867 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 19950624-19953254(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr03G000869 Chr03 NC_080389.1:9875665-9875673promoter 内 1086-1094 bp + 2907 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 9870410-9872758(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr02G000457 Chr02 NC_080388.1:6098325-6098333promoter 内 1047-1055 bp - 2946 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 6101279-6102811(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr04G000871 Chr04 NC_080390.1:11026970-11026978promoter 内 956-964 bp - 3037 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 11022968-11023933(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr04G001660 Chr04 NC_080390.1:27562203-27562211promoter 内 928-936 bp + 3065 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 27565276-27583680(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr01G001932 Chr01 NC_080387.1:34479396-34479404promoter 内 907-915 bp + 3086 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 34482490-34484538(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr02G001262 Chr02 NC_080388.1:23122856-23122864promoter 内 899-907 bp + 3094 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 23125958-23126782(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr01G003573 Chr01 NC_080387.1:54299365-54299373promoter 内 897-905 bp - 3096 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 54294405-54296269(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr02G004450 Chr02 NC_080388.1:66860836-66860844promoter 内 894-902 bp + 3099 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 66852740-66857737(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr02G005303 Chr02 NC_080388.1:73975103-73975111promoter 内 889-897 bp + 3104 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 73969792-73971999(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr01G003560 Chr01 NC_080387.1:54210046-54210054promoter 内 834-842 bp + 3159 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 54203024-54206887(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr02G004019 Chr02 NC_080388.1:62503342-62503350promoter 内 751-759 bp - 3242 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 62498208-62500100(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr01G004159 Chr01 NC_080387.1:60086103-60086111promoter 内 744-752 bp + 3249 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 60080427-60082854(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr01G001902 Chr01 NC_080387.1:34126028-34126036promoter 内 743-751 bp + 3250 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 34129286-34130890(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr01G004752 Chr01 NC_080387.1:65695449-65695457promoter 内 698-706 bp + 3295 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 65687230-65692154(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr04G002561 Chr04 NC_080390.1:40919985-40919993promoter 内 695-703 bp + 3298 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 40923291-40924443(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr02G001422 Chr02 NC_080388.1:26823341-26823349promoter 内 689-697 bp + 3304 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 26826653-26827854(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr02G000505 Chr02 NC_080388.1:6963568-6963576promoter 内 672-680 bp + 3321 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 6957928-6960247(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr02G001007 Chr02 NC_080388.1:17751712-17751720promoter 内 659-667 bp - 3334 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 17755054-17762670(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr01G000097 Chr01 NC_080387.1:1706935-1706943promoter 内 643-651 bp - 3350 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 1710293-1712140(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr02G004481 Chr02 NC_080388.1:67275177-67275185promoter 内 604-612 bp + 3389 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 67268535-67271788(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr01G001347 Chr01 NC_080387.1:26740378-26740386promoter 内 598-606 bp - 3395 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 26733442-26736983(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr01G004602 Chr01 NC_080387.1:64002559-64002567promoter 内 597-605 bp + 3396 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 64005963-64007353(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr02G005056 Chr02 NC_080388.1:72265464-72265472promoter 内 597-605 bp - 3396 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 72268868-72276167(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr03G000546 Chr03 NC_080389.1:5925479-5925487promoter 内 589-597 bp - 3404 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 5920385-5922075(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr02G005582 Chr02 NC_080388.1:75639976-75639984promoter 内 560-568 bp + 3433 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 75643417-75647580(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr01G004013 Chr01 NC_080387.1:58548286-58548294promoter 内 553-561 bp - 3440 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 58544466-58544846(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr04G002642 Chr04 NC_080390.1:41801229-41801237promoter 内 518-526 bp + 3475 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 41804712-41806406(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr01G003323 Chr01 NC_080387.1:51934026-51934034promoter 内 514-522 bp - 3479 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 51929249-51930547(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr02G001420 Chr02 NC_080388.1:26823341-26823349promoter 内 507-515 bp + 3486 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 26818107-26819855(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr01G004299 Chr01 NC_080387.1:61177979-61177987promoter 内 498-506 bp + 3495 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 61172693-61174484(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr03G004312 Chr03 NC_080389.1:61500715-61500723promoter 内 468-476 bp + 3525 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 61492284-61497190(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr02G002513 Chr02 NC_080388.1:43628932-43628940promoter 内 452-460 bp - 3541 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 43632481-43634332(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr02G003426 Chr02 NC_080388.1:55469520-55469528promoter 内 440-448 bp - 3553 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 55461968-55465967(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr01G001858 Chr01 NC_080387.1:33539793-33539801promoter 内 414-422 bp + 3579 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 33530858-33536214(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr01G001647 Chr01 NC_080387.1:30536204-30536212promoter 内 347-355 bp + 3646 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 30530273-30532558(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr01G005385 Chr01 NC_080387.1:71145747-71145755promoter 内 312-320 bp - 3681 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 71149436-71150275(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr01G002397 Chr01 NC_080387.1:41304867-41304875promoter 内 304-312 bp + 3689 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 41301072-41301178(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr01G005994 Chr01 NC_080387.1:75533933-75533941promoter 内 292-300 bp - 3701 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 75537642-75537748(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 ACCGACAAA
SmilChr02G004862 Chr02 NC_080388.1:70754683-70754691promoter 内 281-289 bp - 3712 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 70749785-70750971(-) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr01G001860 Chr01 NC_080387.1:33554176-33554184promoter 内 273-281 bp + 3720 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 33557904-33559029(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT
SmilChr01G002525 Chr01 NC_080387.1:43221096-43221104promoter 内 266-274 bp + 3727 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 43224831-43231129(+) SMil_00011004-RA_Salv MP00033 TTTGTCGGT