转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G002364; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00006712-RA_Salv SmilChr05G002364 WRKY XP_057809766.1 MP00069 AGTCAACG

可能结合的靶基因

9917 个结合位点 7882 个候选靶基因 第 100 / 158 下载 TSV

上一页 100 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002896 Chr01 NC_080387.1:47662303-47662310promoter 内 779-786 bp + 3215 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 47656766-47659088(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 TGTTGACT
SmilChr01G000983 Chr01 NC_080387.1:20838692-20838699promoter 内 738-745 bp + 3256 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 20841955-20843842(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr02G003812 Chr02 NC_080388.1:59747269-59747276promoter 内 729-736 bp - 3265 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 59740148-59744004(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr04G002168 Chr04 NC_080390.1:35031210-35031217promoter 内 726-733 bp + 3268 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 35026911-35027942(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 TGTTGACT
SmilChr05G001514 Chr05 NC_080391.1:13897061-13897068promoter 内 675-682 bp - 3319 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 13889456-13893742(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr01G005947 Chr01 NC_080387.1:75197093-75197100promoter 内 663-670 bp - 3331 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 75200431-75203186(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 TGTTGACT
SmilChr03G003515 Chr03 NC_080389.1:53745424-53745431promoter 内 660-667 bp + 3334 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 53748765-53751784(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr06G001704 Chr06 NC_080392.1:19582828-19582835promoter 内 637-644 bp - 3357 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 19586192-19593453(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 TGTTGACT
SmilChr03G000466 Chr03 NC_080389.1:5003523-5003530promoter 内 634-641 bp + 3360 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 4977151-5000163(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 TGTTGACT
SmilChr02G000571 Chr02 NC_080388.1:8065305-8065312promoter 内 632-639 bp - 3362 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 8068674-8071081(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 TGTTGACT
SmilChr02G001949 Chr02 NC_080388.1:35154276-35154283promoter 内 632-639 bp + 3362 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 35157645-35158717(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr07G003004 Chr07 NC_080393.1:30845428-30845435promoter 内 613-620 bp - 3381 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 30848816-30849862(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 TGTTGACT
SmilChr01G002770 Chr01 NC_080387.1:46148936-46148943promoter 内 609-616 bp - 3385 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 46144436-46145551(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr07G003527 Chr07 NC_080393.1:40461960-40461967promoter 内 599-606 bp + 3395 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 40455504-40458565(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 TGTTGACT
SmilChr03G004034 Chr03 NC_080389.1:59330679-59330686promoter 内 587-594 bp + 3407 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 59334093-59343941(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr01G006091 Chr01 NC_080387.1:76393667-76393674promoter 内 542-549 bp + 3452 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 76397126-76481394(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr05G003936 Chr05 NC_080391.1:53133218-53133225promoter 内 527-534 bp - 3467 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 53128145-53129751(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr06G000656 Chr06 NC_080392.1:5767768-5767775promoter 内 527-534 bp - 3467 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 5763483-5764301(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr04G001740 Chr04 NC_080390.1:28652661-28652668promoter 内 524-531 bp + 3470 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 28643947-28649191(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 TGTTGACT
SmilChr02G001341 Chr02 NC_080388.1:24985532-24985539promoter 内 515-522 bp - 3479 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 24989018-24994857(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 TGTTGACT
SmilChr04G000589 Chr04 NC_080390.1:6556079-6556086promoter 内 494-501 bp + 3500 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 6559586-6578686(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr06G001130 Chr06 NC_080392.1:11343789-11343796promoter 内 488-495 bp - 3506 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 11335997-11340283(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr02G002759 Chr02 NC_080388.1:47641064-47641071promoter 内 486-493 bp - 3508 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 47631726-47637556(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr04G003573 Chr04 NC_080390.1:52153472-52153479promoter 内 480-487 bp - 3514 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 52149441-52149958(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr01G001335 Chr01 NC_080387.1:26534301-26534308promoter 内 474-481 bp - 3520 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 26537828-26539671(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 TGTTGACT
SmilChr07G003066 Chr07 NC_080393.1:32171801-32171808promoter 内 471-478 bp - 3523 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 32175331-32178766(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 TGTTGACT
SmilChr04G001452 Chr04 NC_080390.1:23874613-23874620promoter 内 451-458 bp - 3543 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 23868397-23871070(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr05G001491 Chr05 NC_080391.1:13676892-13676899promoter 内 435-442 bp + 3559 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 13680458-13683035(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr06G001423 Chr06 NC_080392.1:15027579-15027586promoter 内 421-428 bp + 3573 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 15031159-15033826(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr06G001424 Chr06 NC_080392.1:15056571-15056578promoter 内 420-427 bp + 3574 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 15060152-15062818(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr01G002771 Chr01 NC_080387.1:46149009-46149016promoter 内 393-400 bp - 3601 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 46152617-46155559(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 TGTTGACT
SmilChr07G000175 Chr07 NC_080393.1:1097674-1097681promoter 内 345-352 bp - 3649 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 1101330-1105769(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 TGTTGACT
SmilChr07G002020 Chr07 NC_080393.1:18147201-18147208promoter 内 299-306 bp + 3695 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 18150903-18151876(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr02G000973 Chr02 NC_080388.1:17013680-17013687promoter 内 243-250 bp + 3751 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 17017438-17018094(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr01G002008 Chr01 NC_080387.1:35636718-35636725promoter 内 232-239 bp + 3762 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 35628980-35632956(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 TGTTGACT
SmilChr01G002011 Chr01 NC_080387.1:35668378-35668385promoter 内 229-236 bp + 3765 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 35660641-35664613(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 TGTTGACT
SmilChr02G004586 Chr02 NC_080388.1:68355967-68355974promoter 内 223-230 bp - 3771 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 68346493-68352196(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr03G000212 Chr03 NC_080389.1:2468311-2468318promoter 内 210-217 bp - 3784 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 2472102-2472657(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 TGTTGACT
SmilChr05G001387 Chr05 NC_080391.1:12444073-12444080promoter 内 199-206 bp + 3795 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 12447875-12452029(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr05G002520 Chr05 NC_080391.1:28060083-28060090promoter 内 161-168 bp - 3833 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 28046281-28056250(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr04G000275 Chr04 NC_080390.1:2537492-2537499promoter 内 158-165 bp - 3836 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 2533575-2533656(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr03G003720 Chr03 NC_080389.1:56219347-56219354promoter 内 106-113 bp - 3888 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 56212604-56215459(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA
SmilChr01G001105 Chr01 NC_080387.1:22630809-22630816promoter 内 74-81 bp + 3920 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 22623892-22626889(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 TGTTGACT
SmilChr03G003070 Chr03 NC_080389.1:47700381-47700388promoter 内 43-50 bp + 3951 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 47695414-47696430(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 TGTTGACT
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SmilChr02G005511 Chr02 NC_080388.1:75234995-75235002promoter 内 3992-3999 bp - 2 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 75235004-75238347(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 TGTTGACT
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SmilChr07G001573 Chr07 NC_080393.1:12973774-12973781promoter 内 3992-3999 bp - 2 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 12973783-12976106(+) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 TGTTGACT
SmilChr07G002803 Chr07 NC_080393.1:28032335-28032342promoter 内 3992-3999 bp - 2 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 28030817-28032333(-) SMil_00006712-RA_Salv MP00069 AGTCAACA