转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 102 / 136 下载 TSV

上一页 102 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005090 Chr02 NC_080388.1:72490273-72490283promoter 内 866-876 bp + 3125 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 72493408-72500890(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACTTCAGCGCC
SmilChr08G002082 Chr08 NC_080394.1:18716101-18716111promoter 内 772-782 bp - 3219 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 18712436-18712882(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGC
SmilChr04G001482 Chr04 NC_080390.1:24257620-24257630promoter 内 765-775 bp + 3226 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 24253149-24254394(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr02G002512 Chr02 NC_080388.1:43577183-43577193promoter 内 764-774 bp + 3227 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 43572007-43573956(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACGG
SmilChr03G004726 Chr03 NC_080389.1:64454513-64454523promoter 内 718-728 bp - 3273 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 64448037-64451240(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGC
SmilChr03G002469 Chr03 NC_080389.1:39161496-39161506promoter 内 691-701 bp - 3300 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 39164806-39166432(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr01G002497 Chr01 NC_080387.1:42783822-42783832promoter 内 685-695 bp + 3306 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 42787138-42790359(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGC
SmilChr05G000867 Chr05 NC_080391.1:6862169-6862179promoter 内 684-694 bp + 3307 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 6865486-6866897(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACTTCAGCGCC
SmilChr02G005287 Chr02 NC_080388.1:73896660-73896670promoter 内 594-604 bp - 3397 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 73892448-73893263(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGC
SmilChr02G003191 Chr02 NC_080388.1:53072801-53072811promoter 内 578-588 bp + 3413 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 53067817-53069388(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr03G000762 Chr03 NC_080389.1:8719499-8719509promoter 内 545-555 bp + 3446 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 8714701-8716053(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr06G002390 Chr06 NC_080392.1:34713985-34713995promoter 内 543-553 bp - 3448 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 34717443-34721915(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGGA
SmilChr02G001866 Chr02 NC_080388.1:33890068-33890078promoter 内 536-546 bp + 3455 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 33893533-33894546(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCTTCAGCGCG
SmilChr08G003669 Chr08 NC_080394.1:40582015-40582025promoter 内 527-537 bp + 3464 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 40578449-40578551(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr04G001620 Chr04 NC_080390.1:26968643-26968653promoter 内 493-503 bp - 3498 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 26960806-26965145(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCATG
SmilChr05G001082 Chr05 NC_080391.1:8991681-8991691promoter 内 492-502 bp - 3499 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 8995190-8998111(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr04G002855 Chr04 NC_080390.1:44665799-44665809promoter 内 489-499 bp - 3502 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 44669311-44670917(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGGA
SmilChr08G003876 Chr08 NC_080394.1:45929333-45929343promoter 内 465-475 bp - 3526 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 45924850-45925807(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGC
SmilChr02G004292 Chr02 NC_080388.1:65274376-65274386promoter 内 446-456 bp + 3545 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 65269765-65270831(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr08G003732 Chr08 NC_080394.1:42146766-42146776promoter 内 443-453 bp - 3548 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 42150324-42154725(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr01G001446 Chr01 NC_080387.1:28155621-28155631promoter 内 428-438 bp + 3563 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 28159194-28169998(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGC
SmilChr06G002639 Chr06 NC_080392.1:37996844-37996854promoter 内 412-422 bp - 3579 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 38000433-38001640(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr08G002291 Chr08 NC_080394.1:21403223-21403233promoter 内 409-419 bp + 3582 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 21390780-21399641(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CATGCTGAGCG
SmilChr02G002324 Chr02 NC_080388.1:40925237-40925247promoter 内 396-406 bp + 3595 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 40920720-40921642(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGGA
SmilChr08G002265 Chr08 NC_080394.1:20907186-20907196promoter 内 388-398 bp + 3603 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 20910799-20913071(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGC
SmilChr07G001407 Chr07 NC_080393.1:10940494-10940504promoter 内 339-349 bp - 3652 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 10944156-10949833(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr03G003146 Chr03 NC_080389.1:48762201-48762211promoter 内 334-344 bp - 3657 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 48765868-48767042(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr04G002263 Chr04 NC_080390.1:36622749-36622759promoter 内 331-341 bp - 3660 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 36616235-36619089(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGC
SmilChr07G003310 Chr07 NC_080393.1:35114259-35114269promoter 内 314-324 bp - 3677 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 35107084-35110582(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGC
SmilChr07G002270 Chr07 NC_080393.1:20921932-20921942promoter 内 304-314 bp - 3687 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 20925629-20930583(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAAGT
SmilChr08G000460 Chr08 NC_080394.1:3293173-3293183promoter 内 298-308 bp + 3693 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 3296876-3301848(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCACAGCGCG
SmilChr01G000648 Chr01 NC_080387.1:14471975-14471985promoter 内 296-306 bp + 3695 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 14465091-14468280(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr01G000314 Chr01 NC_080387.1:6061300-6061310promoter 内 287-297 bp - 3704 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 6065014-6066013(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr08G003945 Chr08 NC_080394.1:47241504-47241514promoter 内 285-295 bp - 3706 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 47234707-47237798(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACTTCAGCGCC
SmilChr01G000567 Chr01 NC_080387.1:11746195-11746205promoter 内 252-262 bp + 3739 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 11739553-11742456(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr04G001572 Chr04 NC_080390.1:26096977-26096987promoter 内 237-247 bp + 3754 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 26092027-26093223(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACGG
SmilChr05G001046 Chr05 NC_080391.1:8628636-8628646promoter 内 235-245 bp + 3756 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 8623771-8624880(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr05G003063 Chr05 NC_080391.1:38484323-38484333promoter 内 220-230 bp - 3771 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 38488104-38489132(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr06G001117 Chr06 NC_080392.1:11236521-11236531promoter 内 200-210 bp + 3791 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 11240322-11243031(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGC
SmilChr05G003247 Chr05 NC_080391.1:41870703-41870713promoter 内 196-206 bp - 3795 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 41849494-41866908(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGTCAGCGCT
SmilChr01G004968 Chr01 NC_080387.1:67780933-67780943promoter 内 195-205 bp + 3796 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 67784739-67791410(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCACAGCGCG
SmilChr07G003784 Chr07 NC_080393.1:46432223-46432233promoter 内 186-196 bp + 3805 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 46427057-46428418(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr03G003222 Chr03 NC_080389.1:49893777-49893787promoter 内 166-176 bp - 3825 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 49888345-49889952(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGTCAGCGCT
SmilChr06G001132 Chr06 NC_080392.1:11359994-11360004promoter 内 153-163 bp + 3838 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 11363842-11366486(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGC
SmilChr08G002479 Chr08 NC_080394.1:23703400-23703410promoter 内 121-131 bp + 3870 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 23698479-23699530(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr04G000005 Chr04 NC_080390.1:87017-87027promoter 内 119-129 bp - 3872 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 80344-83145(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGC
SmilChr01G004502 Chr01 NC_080387.1:63132459-63132469promoter 内 111-121 bp + 3880 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 63125172-63128579(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAAGT
SmilChr08G003940 Chr08 NC_080394.1:47125656-47125666promoter 内 86-96 bp - 3905 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 47129571-47130631(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGA
SmilChr03G002087 Chr03 NC_080389.1:32163436-32163446promoter 内 45-55 bp + 3946 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 32156574-32159490(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCT
SmilChr03G003316 Chr03 NC_080389.1:51397753-51397763promoter 内 37-47 bp - 3954 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 51401717-51409726(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACGG