转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 103 / 143 下载 TSV

上一页 103 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000452 Chr01 NC_080387.1:9191619-9191630promoter 内 523-534 bp + 3467 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 9195097-9197295(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCAT
SmilChr03G001844 Chr03 NC_080389.1:25338342-25338353promoter 内 520-531 bp + 3470 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 25341823-25343163(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCAT
SmilChr07G003796 Chr07 NC_080393.1:46747472-46747483promoter 内 520-531 bp + 3470 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 46750953-46753136(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCAT
SmilChr01G000489 Chr01 NC_080387.1:9959344-9959355promoter 内 518-529 bp - 3472 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 9953698-9955872(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCAT
SmilChr04G001121 Chr04 NC_080390.1:16263332-16263343promoter 内 515-526 bp - 3475 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 16258367-16259857(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCAT
SmilChr06G002158 Chr06 NC_080392.1:29430778-29430789promoter 内 512-523 bp + 3478 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 29434267-29436312(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCAT
SmilChr01G006055 Chr01 NC_080387.1:76029959-76029970promoter 内 342-353 bp + 3648 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 76025012-76026311(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCCA
SmilChr03G004300 Chr03 NC_080389.1:61386565-61386576promoter 内 283-294 bp - 3707 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 61390283-61391915(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTATT
SmilChr07G004063 Chr07 NC_080393.1:51917826-51917837promoter 内 196-207 bp + 3794 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 51921631-51923358(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCAT
SmilChr01G003057 Chr01 NC_080387.1:49482447-49482458promoter 内 61-72 bp - 3929 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 49477247-49478518(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTATA
SmilChr01G005182 Chr01 NC_080387.1:69536407-69536418promoter 内 3471-3482 bp - 519 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 69536937-69538900(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCCG
SmilChr03G001027 Chr03 NC_080389.1:12004458-12004469promoter 内 2886-2897 bp - 1104 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 12002290-12003354(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATAACAGCTGTT
SmilChr02G003985 Chr02 NC_080388.1:62109864-62109875promoter 内 2764-2775 bp + 1226 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 62105829-62108638(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTAT
SmilChr03G001028 Chr03 NC_080389.1:12004458-12004469promoter 内 2119-2130 bp - 1871 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 12006340-12007381(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTAT
SmilChr02G001672 Chr02 NC_080388.1:30987273-30987284promoter 内 1780-1791 bp + 2210 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 30984290-30985063(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCTG
SmilChr04G003922 Chr04 NC_080390.1:54900074-54900085promoter 内 3973-3984 bp - 17 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 54898614-54900057(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCAAGCTGTA
SmilChr01G003796 Chr01 NC_080387.1:56342019-56342030promoter 内 3960-3971 bp - 30 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 56342060-56343178(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAGG
SmilChr04G002073 Chr04 NC_080390.1:33478924-33478935promoter 内 3884-3895 bp - 106 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 33477127-33478818(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGCC
SmilChr01G003876 Chr01 NC_080387.1:57028855-57028866promoter 内 3842-3853 bp - 148 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 57029014-57033755(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTAT
SmilChr05G000817 Chr05 NC_080391.1:6408180-6408191promoter 内 3747-3758 bp - 243 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 6399822-6407937(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCAAGCTGTA
SmilChr05G003162 Chr05 NC_080391.1:40407166-40407177promoter 内 3691-3702 bp + 299 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 40404370-40406867(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCCT
SmilChr06G003181 Chr06 NC_080392.1:44733621-44733632promoter 内 3445-3456 bp - 545 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 44734177-44735323(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCAG
SmilChr02G005360 Chr02 NC_080388.1:74318489-74318500promoter 内 3427-3438 bp + 563 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 74319063-74320542(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTACAGCTGAC
SmilChr03G002501 Chr03 NC_080389.1:39841209-39841220promoter 内 3307-3318 bp - 683 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 39841903-39857654(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTAT
SmilChr02G005169 Chr02 NC_080388.1:73017500-73017511promoter 内 3268-3279 bp - 722 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 73013770-73016778(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGCC
SmilChr08G001365 Chr08 NC_080394.1:10891023-10891034promoter 内 3223-3234 bp - 767 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 10891801-10894381(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTATG
SmilChr03G000521 Chr03 NC_080389.1:5607087-5607098promoter 内 3158-3169 bp + 832 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 5607930-5608882(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATACAGCTGGG
SmilChr01G005298 Chr01 NC_080387.1:70278930-70278941promoter 内 2997-3008 bp - 993 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 70279934-70281517(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCGG
SmilChr08G002997 Chr08 NC_080394.1:30069956-30069967promoter 内 2769-2780 bp - 1221 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 30071188-30077870(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCCG
SmilChr02G004517 Chr02 NC_080388.1:67695237-67695248promoter 内 2759-2770 bp - 1231 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 67696479-67700983(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAGG
SmilChr08G002689 Chr08 NC_080394.1:26500688-26500699promoter 内 2514-2525 bp - 1476 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 26494036-26499212(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTACAGCTGAC
SmilChr02G002663 Chr02 NC_080388.1:46125816-46125827promoter 内 2478-2489 bp - 1512 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 46127339-46128032(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCTG
SmilChr08G001363 Chr08 NC_080394.1:10891023-10891034promoter 内 2454-2465 bp - 1536 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 10885093-10889487(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATACAGCTGGG
SmilChr08G003012 Chr08 NC_080394.1:30233105-30233116promoter 内 2428-2439 bp + 1562 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 30229201-30231543(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCCG
SmilChr01G000112 Chr01 NC_080387.1:1907430-1907441promoter 内 2364-2375 bp - 1626 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 1909067-1909139(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTACT
SmilChr05G000956 Chr05 NC_080391.1:7706884-7706895promoter 内 2330-2341 bp + 1660 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 7702139-7705224(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCCG
SmilChr08G003631 Chr08 NC_080394.1:39608837-39608848promoter 内 2317-2328 bp - 1673 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 39610521-39610858(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTATG
SmilChr07G003274 Chr07 NC_080393.1:34505967-34505978promoter 内 2191-2202 bp - 1799 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 34507777-34507862(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTATG
SmilChr08G001981 Chr08 NC_080394.1:17523083-17523094promoter 内 2031-2042 bp - 1959 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 17525053-17528898(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAGG
SmilChr05G000893 Chr05 NC_080391.1:7067124-7067135promoter 内 1973-1984 bp + 2017 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 7062064-7065107(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCCG
SmilChr04G000172 Chr04 NC_080390.1:1543605-1543616promoter 内 1961-1972 bp + 2029 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 1539963-1541576(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCTG
SmilChr07G001224 Chr07 NC_080393.1:9382396-9382407promoter 内 1935-1946 bp - 2055 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 9378004-9380341(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTAGG
SmilChr04G001797 Chr04 NC_080390.1:29442217-29442228promoter 内 1908-1919 bp + 2082 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 29438872-29440135(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCTG
SmilChr01G005468 Chr01 NC_080387.1:71672936-71672947promoter 内 1899-1910 bp - 2091 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 71667769-71670845(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTAAA
SmilChr02G003419 Chr02 NC_080388.1:55418519-55418530promoter 内 1867-1878 bp + 2123 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 55413708-55416396(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCGG
SmilChr07G003275 Chr07 NC_080393.1:34505967-34505978promoter 内 1866-1877 bp - 2124 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 34508102-34508186(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTATG
SmilChr05G003050 Chr05 NC_080391.1:38271039-38271050promoter 内 1819-1830 bp + 2171 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 38273221-38273979(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTCAC
SmilChr05G002113 Chr05 NC_080391.1:22163408-22163419promoter 内 1731-1742 bp - 2259 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 22157781-22161149(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTCAT
SmilChr07G003276 Chr07 NC_080393.1:34505967-34505978promoter 内 1704-1715 bp - 2286 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 34508264-34508352(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTATG
SmilChr02G004019 Chr02 NC_080388.1:62502731-62502742promoter 内 1359-1370 bp - 2631 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 62498208-62500100(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCAAGCTGTA