转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 105 / 139 下载 TSV

上一页 105 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G003163 Chr03 NC_080389.1:49015800-49015811promoter 内 1262-1273 bp - 2728 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 49012268-49013072(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AATTGACGTGGT
SmilChr02G002972 Chr02 NC_080388.1:50262529-50262540promoter 内 1224-1235 bp + 2766 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 50265306-50267624(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AATTGACGTGGA
SmilChr01G000220 Chr01 NC_080387.1:3866896-3866907promoter 内 1186-1197 bp + 2804 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 3860587-3864092(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCATTT
SmilChr03G003418 Chr03 NC_080389.1:52524241-52524252promoter 内 960-971 bp + 3030 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 52527282-52529094(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AATTGACGTGGA
SmilChr02G003814 Chr02 NC_080388.1:59764574-59764585promoter 内 948-959 bp + 3042 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 59759174-59761532(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCAAAT
SmilChr01G003093 Chr01 NC_080387.1:49752351-49752362promoter 内 947-958 bp - 3043 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 49745754-49749308(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTCTGACGTCGA
SmilChr01G005627 Chr01 NC_080387.1:72730911-72730922promoter 内 935-946 bp + 3055 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 72733977-72737706(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACTGACGTGCA
SmilChr02G001594 Chr02 NC_080388.1:29707304-29707315promoter 内 923-934 bp - 3067 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 29710382-29711865(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATTT
SmilChr01G003788 Chr01 NC_080387.1:56269714-56269725promoter 内 911-922 bp + 3079 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 56263367-56266635(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCACGTCAGTG
SmilChr02G003786 Chr02 NC_080388.1:59523816-59523827promoter 内 911-922 bp + 3079 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 59518475-59520737(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCAAAT
SmilChr03G001649 Chr03 NC_080389.1:21447885-21447896promoter 内 763-774 bp - 3227 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 21427909-21444658(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATTTGACGTGGA
SmilChr01G000170 Chr01 NC_080387.1:2797619-2797630promoter 内 730-741 bp - 3260 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 2800890-2804009(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCACGTCAGAG
SmilChr05G000156 Chr05 NC_080391.1:1260969-1260980promoter 内 716-727 bp - 3274 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 1253918-1257695(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AATTGACGTGGA
SmilChr04G003071 Chr04 NC_080390.1:47251544-47251555promoter 内 646-657 bp + 3344 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 47254899-47266853(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AAATGACGTGGA
SmilChr03G001436 Chr03 NC_080389.1:17037243-17037254promoter 内 638-649 bp - 3352 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 17040606-17050113(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCATAT
SmilChr01G000705 Chr01 NC_080387.1:15835703-15835714promoter 内 631-642 bp + 3359 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 15830954-15832344(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATAT
SmilChr02G004420 Chr02 NC_080388.1:66522540-66522551promoter 内 570-581 bp + 3420 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 66525971-66527914(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACTGACGTGCA
SmilChr03G003888 Chr03 NC_080389.1:57956269-57956280promoter 内 561-572 bp + 3429 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 57959709-57961036(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AAATGACGTGGA
SmilChr01G005351 Chr01 NC_080387.1:70760635-70760646promoter 内 531-542 bp - 3459 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 70754586-70757176(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AATTGACGTGGA
SmilChr03G000003 Chr03 NC_080389.1:51415-51426promoter 内 513-524 bp + 3477 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 46777-47938(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTACT
SmilChr03G004201 Chr03 NC_080389.1:60632627-60632638promoter 内 507-518 bp - 3483 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 60636121-60638293(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CAGACGTCAGCT
SmilChr03G002281 Chr03 NC_080389.1:36001502-36001513promoter 内 501-512 bp - 3489 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 35996670-35998013(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATATGACGTGGA
SmilChr03G001906 Chr03 NC_080389.1:26650411-26650422promoter 内 489-500 bp - 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 26653923-26662440(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATTT
SmilChr03G003927 Chr03 NC_080389.1:58347798-58347809promoter 内 477-488 bp + 3513 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 58351322-58352302(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AAATGACGTGGA
SmilChr01G005497 Chr01 NC_080387.1:71877583-71877594promoter 内 436-447 bp - 3554 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 71870273-71874029(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AAATGACGTGGA
SmilChr01G002877 Chr01 NC_080387.1:47353192-47353203promoter 内 406-417 bp - 3584 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 47356787-47358080(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATTT
SmilChr03G002758 Chr03 NC_080389.1:43843964-43843975promoter 内 217-228 bp + 3773 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 43821928-43840191(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATTT
SmilChr03G004536 Chr03 NC_080389.1:63396688-63396699promoter 内 216-227 bp + 3774 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 63392106-63392914(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATAT
SmilChr01G000790 Chr01 NC_080387.1:17174839-17174850promoter 内 149-160 bp + 3841 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 17178691-17181537(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATTTGACGTGGT
SmilChr04G002144 Chr04 NC_080390.1:34471781-34471792promoter 内 145-156 bp + 3845 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 34456035-34467936(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATTT
SmilChr02G004337 Chr02 NC_080388.1:65614794-65614805promoter 内 140-151 bp - 3850 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 65618655-65619728(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCGACGTCAGAA
SmilChr04G002635 Chr04 NC_080390.1:41763012-41763023promoter 内 129-140 bp - 3861 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 41748520-41759151(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AAATGACGTGGA
SmilChr01G004357 Chr01 NC_080387.1:61763603-61763614promoter 内 94-105 bp - 3896 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 61756501-61759707(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AATTGACGTGGT
SmilChr04G002641 Chr04 NC_080390.1:41807745-41807756promoter 内 83-94 bp - 3907 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 41802279-41803838(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AAATGACGTGGT
SmilChr04G001241 Chr04 NC_080390.1:19504818-19504829promoter 内 62-73 bp - 3928 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 19508757-19509506(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCGACGTCAGAA
SmilChr03G002483 Chr03 NC_080389.1:39471372-39471383promoter 内 41-52 bp - 3949 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 39466613-39467423(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATATGACGTGGA
SmilChr01G006078 Chr01 NC_080387.1:76230944-76230955promoter 内 14-25 bp + 3976 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 76221765-76226968(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATTT
SmilChr01G000202 Chr01 NC_080387.1:3475070-3475081promoter 内 3943-3954 bp - 47 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 4 3470653-3475023(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGTGACGTGAT
SmilChr03G002043 Chr03 NC_080389.1:30913682-30913693promoter 内 3547-3558 bp + 443 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 4 30914136-30917306(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr03G002046 Chr03 NC_080389.1:30977157-30977168promoter 内 3547-3558 bp + 443 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 30977611-30980781(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr02G003195 Chr02 NC_080388.1:53115031-53115042promoter 内 1432-1443 bp + 2558 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 53109246-53112473(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCATTG
SmilChr02G004841 Chr02 NC_080388.1:70545272-70545283promoter 内 537-548 bp + 3453 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 70536269-70541819(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCATTG
SmilChr01G002731 Chr01 NC_080387.1:45664186-45664197promoter 内 3985-3996 bp + 5 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 45664202-45666868(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTTCCACGTGGC
SmilChr03G003472 Chr03 NC_080389.1:53209758-53209769promoter 内 3902-3913 bp + 88 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 53204994-53209670(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCCACA
SmilChr04G003450 Chr04 NC_080390.1:50996155-50996166promoter 内 3806-3817 bp + 184 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 50994832-50995971(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCACGTCACAG
SmilChr01G001496 Chr01 NC_080387.1:28809767-28809778promoter 内 3794-3805 bp - 196 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 28809974-28814378(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTGACGTCAGCT
SmilChr02G000401 Chr02 NC_080388.1:4954358-4954369promoter 内 3741-3752 bp + 249 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 4954618-4957897(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr04G001654 Chr04 NC_080390.1:27514882-27514893promoter 内 3732-3743 bp + 258 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 27513513-27514624(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCACGTCACAG
SmilChr03G001370 Chr03 NC_080389.1:16090346-16090357promoter 内 3639-3650 bp - 351 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 16086865-16089995(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG
SmilChr01G000457 Chr01 NC_080387.1:9341522-9341533promoter 内 3591-3602 bp + 399 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 9341932-9345111(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTG