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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 106 / 148 下载 TSV

上一页 106 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G004072 Chr04 NC_080390.1:55810266-55810279promoter 内 738-751 bp - 3250 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 55813529-55815622(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGCGCAT
SmilChr03G002196 Chr03 NC_080389.1:34581305-34581318promoter 内 679-692 bp - 3309 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 34577229-34577996(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGACTTCACGTGT
SmilChr01G003422 Chr01 NC_080387.1:52867499-52867512promoter 内 670-683 bp - 3318 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 52862402-52864181(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CAACGCACACGTGG
SmilChr02G003253 Chr02 NC_080388.1:53822775-53822788promoter 内 616-629 bp - 3372 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 53826160-53831016(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAAGGTCA
SmilChr06G002951 Chr06 NC_080392.1:42319760-42319773promoter 内 603-616 bp - 3385 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 42323158-42324536(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCGCGTGACCGGTC
SmilChr03G000247 Chr03 NC_080389.1:2920677-2920690promoter 内 503-516 bp + 3485 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 2924175-2925187(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATAATATCACGTGG
SmilChr02G000343 Chr02 NC_080388.1:4466670-4466683promoter 内 464-477 bp + 3524 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 4470207-4470950(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AACCTGTCACGTGT
SmilChr06G002331 Chr06 NC_080392.1:33770150-33770163promoter 内 346-359 bp - 3642 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 33773805-33791814(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGAATTCAC
SmilChr06G001447 Chr06 NC_080392.1:15271863-15271876promoter 内 233-246 bp - 3755 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 15275631-15279571(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTATTTAA
SmilChr02G003420 Chr02 NC_080388.1:55418002-55418015promoter 内 154-167 bp + 3834 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 55421849-55423989(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TATAGTACACGTGG
SmilChr07G001623 Chr07 NC_080393.1:13616773-13616786promoter 内 101-114 bp + 3887 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 13608651-13612886(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAACATCA
SmilChr04G000107 Chr04 NC_080390.1:947840-947853promoter 内 3166-3179 bp - 822 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 9 948675-952430(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTCATCG
SmilChr02G002748 Chr02 NC_080388.1:47507480-47507493promoter 内 2947-2960 bp - 1041 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 3 47502410-47506439(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTTGATACACGTGG
SmilChr07G003809 Chr07 NC_080393.1:46945299-46945312promoter 内 3867-3880 bp - 121 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 46934050-46945178(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CTTATCCCACGTGG
SmilChr02G004996 Chr02 NC_080388.1:71795265-71795278promoter 内 3608-3621 bp - 380 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 71795658-71799342(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAAATGAA
SmilChr03G001122 Chr03 NC_080389.1:12919072-12919085promoter 内 3384-3397 bp + 604 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 12919689-12925466(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATAGTACCACGTGG
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SmilChr05G003702 Chr05 NC_080391.1:50111524-50111537promoter 内 2790-2803 bp - 1198 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 50112735-50115205(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTATTTTT
SmilChr07G000833 Chr07 NC_080393.1:5927524-5927537promoter 内 2776-2789 bp + 1212 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 5920437-5926312(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGAGATCG
SmilChr03G001121 Chr03 NC_080389.1:12919072-12919085promoter 内 2763-2776 bp + 1225 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 12913771-12917847(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGTACTAT
SmilChr02G003838 Chr02 NC_080388.1:60070097-60070110promoter 内 2740-2753 bp - 1248 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 60067055-60068849(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATAGTACCACGTGG
SmilChr07G001200 Chr07 NC_080393.1:9118626-9118639promoter 内 2312-2325 bp - 1676 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 9115439-9116950(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTAGTCTCACGTGA
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SmilChr01G003138 Chr01 NC_080387.1:50169181-50169194promoter 内 1396-1409 bp + 2592 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 50165129-50166589(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGTCTAA
SmilChr06G003128 Chr06 NC_080392.1:44158995-44159008promoter 内 1385-1398 bp + 2603 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 44155512-44156392(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAATCCAT
SmilChr03G002628 Chr03 NC_080389.1:41707919-41707932promoter 内 1227-1240 bp + 2761 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 41710693-41718773(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAAAGTTCACGTGT
SmilChr05G003674 Chr05 NC_080391.1:49718780-49718793promoter 内 992-1005 bp + 2996 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 49721789-49721927(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAAAGTTCACGTGC
SmilChr07G000835 Chr07 NC_080393.1:5927524-5927537promoter 内 566-579 bp + 3422 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 5930959-5935826(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGATCTCCACGTGG
SmilChr02G005526 Chr02 NC_080388.1:75331846-75331859promoter 内 358-371 bp + 3630 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 75327165-75328216(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACTAGTT
SmilChr01G002731 Chr01 NC_080387.1:45664183-45664196promoter 内 3982-3995 bp + 6 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 45664202-45666868(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCTTTCCACGTGG
SmilChr08G001185 Chr08 NC_080394.1:9497110-9497123promoter 内 3967-3980 bp + 21 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 9496325-9497089(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTATCTT
SmilChr05G001482 Chr05 NC_080391.1:13592606-13592619promoter 内 3958-3971 bp - 30 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 13592649-13593918(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTTCTAA
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SmilChr01G005301 Chr01 NC_080387.1:70298301-70298314promoter 内 3936-3949 bp - 52 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 70298366-70299252(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAACTCAG
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SmilChr07G001332 Chr07 NC_080393.1:10290524-10290537promoter 内 3809-3822 bp + 179 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 10290716-10296401(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CAAGATACACGTGG
SmilChr01G004003 Chr01 NC_080387.1:58430418-58430431promoter 内 3786-3799 bp - 202 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 58430633-58431337(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAGACAG
SmilChr07G001125 Chr07 NC_080393.1:8435902-8435915promoter 内 3776-3789 bp + 212 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 8436127-8437492(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GACTATTCACGTGG
SmilChr01G000446 Chr01 NC_080387.1:9134982-9134995promoter 内 3718-3731 bp - 270 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 9131813-9134712(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTTTGGTCACGTGA
SmilChr01G000447 Chr01 NC_080387.1:9145432-9145445promoter 内 3718-3731 bp - 270 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 9140781-9145162(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTTTGGTCACGTGA
SmilChr08G001012 Chr08 NC_080394.1:7602828-7602841promoter 内 3684-3697 bp - 304 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 7603145-7607790(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGATGTT
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SmilChr03G000880 Chr03 NC_080389.1:9998351-9998364promoter 内 3534-3547 bp + 454 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 9998818-10003304(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGATAACACGTGG
SmilChr08G001013 Chr08 NC_080394.1:7602828-7602841promoter 内 3514-3527 bp - 474 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 7603315-8010990(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGATGTT
SmilChr03G002155 Chr03 NC_080389.1:33511499-33511512promoter 内 3512-3525 bp - 476 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 33510235-33511023(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TATATGTCACGTGT