转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 107 / 143 下载 TSV

上一页 107 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004739 Chr02 NC_080388.1:69591942-69591953promoter 内 3254-3265 bp - 736 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 69592689-69597641(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCCC
SmilChr01G002401 Chr01 NC_080387.1:41356542-41356553promoter 内 3252-3263 bp + 738 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 41357291-41358965(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGAA
SmilChr07G000057 Chr07 NC_080393.1:255094-255105promoter 内 3069-3080 bp + 921 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 246152-254173(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAACTGTCAA
SmilChr07G003054 Chr07 NC_080393.1:31888750-31888761promoter 内 2808-2819 bp - 1182 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 31889943-31893947(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCTG
SmilChr01G003168 Chr01 NC_080387.1:50478136-50478147promoter 内 2783-2794 bp + 1207 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 50470002-50476929(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCTA
SmilChr04G003977 Chr04 NC_080390.1:55232576-55232587promoter 内 2746-2757 bp - 1244 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 55229652-55231332(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTATT
SmilChr06G002947 Chr06 NC_080392.1:42272377-42272388promoter 内 2529-2540 bp + 1461 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 42273849-42273921(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTATT
SmilChr07G003966 Chr07 NC_080393.1:50482685-50482696promoter 内 2504-2515 bp + 1486 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 50473019-50481199(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCTA
SmilChr04G004114 Chr04 NC_080390.1:56053487-56053498promoter 内 2439-2450 bp + 1551 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 56046703-56051936(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTATA
SmilChr06G001897 Chr06 NC_080392.1:22739718-22739729promoter 内 2287-2298 bp - 1703 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 22741432-22742247(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTATA
SmilChr02G005307 Chr02 NC_080388.1:73989624-73989635promoter 内 2046-2057 bp - 1944 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 73985367-73987680(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAAA
SmilChr08G002235 Chr08 NC_080394.1:20463232-20463243promoter 内 1817-1828 bp - 2173 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 20465416-20471175(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCTA
SmilChr07G003525 Chr07 NC_080393.1:40397123-40397134promoter 内 1612-1623 bp - 2378 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 40399512-40400821(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTATA
SmilChr01G001183 Chr01 NC_080387.1:23898194-23898205promoter 内 1593-1604 bp + 2397 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 23890170-23895797(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTATA
SmilChr02G004259 Chr02 NC_080388.1:64807658-64807669promoter 内 1559-1570 bp - 2431 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 64803428-64805227(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAAA
SmilChr01G001453 Chr01 NC_080387.1:28214584-28214595promoter 内 1501-1512 bp + 2489 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 28212024-28212095(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTATG
SmilChr04G001816 Chr04 NC_080390.1:29647912-29647923promoter 内 1355-1366 bp + 2635 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 29650558-29652353(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAT
SmilChr03G004396 Chr03 NC_080389.1:62152338-62152349promoter 内 1193-1204 bp + 2797 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 62155146-62159512(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGCAAGCTGTA
SmilChr02G003759 Chr02 NC_080388.1:59236550-59236561promoter 内 1191-1202 bp + 2799 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 59239360-59240873(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAT
SmilChr01G005704 Chr01 NC_080387.1:73277410-73277421promoter 内 1135-1146 bp - 2855 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 73280276-73283307(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCCC
SmilChr01G001452 Chr01 NC_080387.1:28214584-28214595promoter 内 1131-1142 bp + 2859 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 28209347-28211725(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTATG
SmilChr07G000448 Chr07 NC_080393.1:3165476-3165487promoter 内 1104-1115 bp + 2886 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 3159616-3162590(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCCC
SmilChr02G003957 Chr02 NC_080388.1:61747567-61747578promoter 内 1080-1091 bp + 2910 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 61739925-61744657(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTACC
SmilChr05G002698 Chr05 NC_080391.1:30925837-30925848promoter 内 970-981 bp + 3020 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 30928868-30930991(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAAA
SmilChr07G004075 Chr07 NC_080393.1:52168403-52168414promoter 内 959-970 bp - 3031 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 52164743-52165372(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGCAAGCTGTA
SmilChr07G001785 Chr07 NC_080393.1:15200812-15200823promoter 内 941-952 bp - 3049 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 15179214-15197763(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAT
SmilChr04G002574 Chr04 NC_080390.1:41052187-41052198promoter 内 907-918 bp + 3083 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 41048598-41049104(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTATA
SmilChr01G002272 Chr01 NC_080387.1:39492848-39492859promoter 内 744-755 bp + 3246 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 39488234-39489602(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCCC
SmilChr05G000993 Chr05 NC_080391.1:8048589-8048600promoter 内 734-745 bp - 3256 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 8051856-8053764(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAACTGTCAA
SmilChr07G002152 Chr07 NC_080393.1:19694119-19694130promoter 内 704-715 bp - 3286 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 19680598-19690833(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATACAGCTGAA
SmilChr03G004364 Chr03 NC_080389.1:61856977-61856988promoter 内 644-655 bp + 3346 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 61860334-61865240(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGCAAGCTGTA
SmilChr08G000329 Chr08 NC_080394.1:2307473-2307484promoter 内 495-506 bp - 3495 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 2302467-2303978(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAAA
SmilChr05G000990 Chr05 NC_080391.1:8048589-8048600promoter 内 316-327 bp - 3674 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 8042929-8044915(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAT
SmilChr04G004116 Chr04 NC_080390.1:56053487-56053498promoter 内 301-312 bp + 3689 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 56057187-56060150(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATACAGCTGAA
SmilChr07G003890 Chr07 NC_080393.1:48685786-48685797promoter 内 296-307 bp + 3694 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 48689491-48689818(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTACAGCTGAG
SmilChr08G000172 Chr08 NC_080394.1:1184398-1184409promoter 内 245-256 bp - 3745 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 1178688-1180653(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGAA
SmilChr02G000219 Chr02 NC_080388.1:2849359-2849370promoter 内 132-143 bp + 3858 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 2853228-2855703(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGAA
SmilChr02G003018 Chr02 NC_080388.1:50887656-50887667promoter 内 44-55 bp + 3946 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 50876103-50883710(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTATG
SmilChr07G001083 Chr07 NC_080393.1:7935553-7935564promoter 内 9-20 bp - 3981 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 7928740-7931572(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATACAGCTGAA
SmilChr08G000801 Chr08 NC_080394.1:5873801-5873812promoter 内 3325-3336 bp + 665 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 3 5874477-5875664(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGTACAGCTGGT
SmilChr08G003295 Chr08 NC_080394.1:34077635-34077646promoter 内 1641-1652 bp - 2349 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 3 34079995-34080725(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTATT
SmilChr04G000166 Chr04 NC_080390.1:1497876-1497887promoter 内 3871-3882 bp + 119 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 1491872-1497757(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCCG
SmilChr02G000139 Chr02 NC_080388.1:1867905-1867916promoter 内 3579-3590 bp - 411 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 1868327-1870030(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTAGCTGTCCG
SmilChr06G001856 Chr06 NC_080392.1:21923311-21923322promoter 内 3574-3585 bp - 416 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 21923738-21934985(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTATT
SmilChr06G001860 Chr06 NC_080392.1:22031402-22031413promoter 内 3421-3432 bp - 569 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 22031982-22033319(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTATT
SmilChr06G001855 Chr06 NC_080392.1:21917442-21917453promoter 内 3409-3420 bp - 581 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 21918034-21920525(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTATT
SmilChr06G001854 Chr06 NC_080392.1:21914502-21914513promoter 内 3405-3416 bp - 585 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 21915098-21917589(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTATT
SmilChr08G000963 Chr08 NC_080394.1:7169202-7169213promoter 内 2643-2654 bp - 1347 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 7170560-7172171(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTTAA
SmilChr02G000138 Chr02 NC_080388.1:1867905-1867916promoter 内 1714-1725 bp - 2276 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 1864280-1865629(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTAGT
SmilChr07G002759 Chr07 NC_080393.1:27427973-27427984promoter 内 1231-1242 bp - 2759 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 27420854-27425214(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTCAA