转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023584-RA_Salv SmilChr05G001518 WRKY XP_057765511.1 MP00455 AACGTTGACTATT

可能结合的靶基因

9792 个结合位点 6900 个候选靶基因 第 107 / 138 下载 TSV

上一页 107 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002728 Chr03 NC_080389.1:43340849-43340861promoter 内 2138-2150 bp - 1851 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 43342712-43343830(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAAAGG
SmilChr01G002625 Chr01 NC_080387.1:44533033-44533045promoter 内 2119-2131 bp + 1870 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 44534915-44543927(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAGTTTGACTAAC
SmilChr02G004576 Chr02 NC_080388.1:68264287-68264299promoter 内 2009-2021 bp + 1980 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 68256724-68262307(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAATGGA
SmilChr02G004583 Chr02 NC_080388.1:68330450-68330462promoter 内 1857-1869 bp - 2132 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 68312853-68328318(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TAAGTTGACTGTA
SmilChr01G005166 Chr01 NC_080387.1:69429155-69429167promoter 内 1596-1608 bp - 2393 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 69431560-69432940(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAGAGTCAACAAA
SmilChr02G000015 Chr02 NC_080388.1:111531-111543promoter 内 1583-1595 bp - 2406 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 113949-117234(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAGAGTCAACATT
SmilChr02G005554 Chr02 NC_080388.1:75504030-75504042promoter 内 1470-1482 bp - 2519 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 75506561-75509709(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAATCT
SmilChr02G004657 Chr02 NC_080388.1:68987145-68987157promoter 内 1466-1478 bp - 2523 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 68983438-68984622(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATGTTGACTTCA
SmilChr01G004647 Chr01 NC_080387.1:64552140-64552152promoter 内 1416-1428 bp + 2573 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 64548769-64549567(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAAAGG
SmilChr02G002516 Chr02 NC_080388.1:43662098-43662110promoter 内 1336-1348 bp - 2653 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 43657037-43659445(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATGTTGACTCTC
SmilChr02G004800 Chr02 NC_080388.1:70188757-70188769promoter 内 1276-1288 bp - 2713 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 70191482-70192438(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACAAGTCAACTAG
SmilChr02G005572 Chr02 NC_080388.1:75600883-75600895promoter 内 1263-1275 bp + 2726 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 75603621-75605872(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAGGTTGACTCCA
SmilChr03G003410 Chr03 NC_080389.1:52441563-52441575promoter 内 1246-1258 bp + 2743 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 52436007-52438820(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAAAGG
SmilChr03G003280 Chr03 NC_080389.1:50800099-50800111promoter 内 1215-1227 bp + 2774 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 50802885-50804174(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATGTTGACTTCA
SmilChr03G004392 Chr03 NC_080389.1:62102554-62102566promoter 内 1212-1224 bp - 2777 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 62099029-62099777(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTGTTGACTCTG
SmilChr03G001362 Chr03 NC_080389.1:15978552-15978564promoter 内 1190-1202 bp - 2799 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 15981363-15983113(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTTAGTCAATGCT
SmilChr02G000409 Chr02 NC_080388.1:5101147-5101159promoter 内 1164-1176 bp + 2825 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 5096352-5098322(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAGAGTCAACCTG
SmilChr02G000342 Chr02 NC_080388.1:4452171-4452183promoter 内 1139-1151 bp + 2850 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 4447221-4449321(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGAAGTCAACTCA
SmilChr02G003987 Chr02 NC_080388.1:62122851-62122863promoter 内 1071-1083 bp - 2918 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 62125781-62129586(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGTAGTCAACCAA
SmilChr02G003458 Chr02 NC_080388.1:55874468-55874480promoter 内 1055-1067 bp + 2934 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 55869100-55871534(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTAGTCAAATGT
SmilChr02G005556 Chr02 NC_080388.1:75512916-75512928promoter 内 955-967 bp - 3034 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 75515962-75517432(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGCAGTCAACTTC
SmilChr03G003499 Chr03 NC_080389.1:53602770-53602782promoter 内 927-939 bp - 3062 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 53605844-53609669(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTAGTCAACTTA
SmilChr01G005115 Chr01 NC_080387.1:68928008-68928020promoter 内 896-908 bp + 3093 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 68919466-68924915(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAAAGG
SmilChr03G002541 Chr03 NC_080389.1:40572344-40572356promoter 内 819-831 bp - 3170 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 40575526-40577406(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAAAGG
SmilChr03G002268 Chr03 NC_080389.1:35810636-35810648promoter 内 699-711 bp - 3290 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 35806557-35807346(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGATTTGACTAGT
SmilChr02G004245 Chr02 NC_080388.1:64642601-64642613promoter 内 661-673 bp + 3328 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 64645941-64648038(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTGTTGACTCTT
SmilChr03G004182 Chr03 NC_080389.1:60536199-60536211promoter 内 542-554 bp + 3447 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 60539658-60542483(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCCATTGACTATT
SmilChr03G003150 Chr03 NC_080389.1:48861896-48861908promoter 内 509-521 bp + 3480 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 48857319-48858416(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTTAGTCAATGCT
SmilChr03G003154 Chr03 NC_080389.1:48904797-48904809promoter 内 509-521 bp - 3480 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 48908289-48909386(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTTAGTCAATGCT
SmilChr01G002660 Chr01 NC_080387.1:44858569-44858581promoter 内 507-519 bp + 3482 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 44846835-44855087(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAATGT
SmilChr02G005419 Chr02 NC_080388.1:74650435-74650447promoter 内 495-507 bp - 3494 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 74643948-74646941(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCTTTTGACTATT
SmilChr02G004639 Chr02 NC_080388.1:68835984-68835996promoter 内 475-487 bp - 3514 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 68839510-68851822(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAATCT
SmilChr03G002246 Chr03 NC_080389.1:35399850-35399862promoter 内 457-469 bp - 3532 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 35403394-35403909(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATAAGTCAACTTA
SmilChr01G002688 Chr01 NC_080387.1:45110459-45110471promoter 内 446-458 bp - 3543 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 45104700-45106916(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCAGTTGACTTAC
SmilChr02G003568 Chr02 NC_080388.1:56860750-56860762promoter 内 374-386 bp + 3615 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 56856467-56857135(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTTAGTCAATGCT
SmilChr01G002620 Chr01 NC_080387.1:44464567-44464579promoter 内 319-331 bp - 3670 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 44468249-44469037(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTTAGTCAATGCT
SmilChr02G003172 Chr02 NC_080388.1:52821321-52821333promoter 内 291-303 bp + 3698 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 52825031-52826664(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCTTTTGACTATT
SmilChr02G005570 Chr02 NC_080388.1:75600883-75600895promoter 内 285-297 bp + 3704 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 75592284-75597179(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGGAGTCAACCTC
SmilChr01G001531 Chr01 NC_080387.1:29300699-29300711promoter 内 251-263 bp - 3738 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 29304449-29306676(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGTAGTCAACTGA
SmilChr02G003688 Chr02 NC_080388.1:58284707-58284719promoter 内 229-241 bp - 3760 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 58274625-58280947(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TAAGTTGACTAAT
SmilChr02G003040 Chr02 NC_080388.1:51142537-51142549promoter 内 165-177 bp + 3824 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 51146373-51148060(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TAAGTTGACTGGA
SmilChr03G002895 Chr03 NC_080389.1:45681292-45681304promoter 内 149-161 bp + 3840 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 45672567-45677452(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAATCT
SmilChr03G001095 Chr03 NC_080389.1:12637706-12637718promoter 内 125-137 bp - 3864 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 12641582-12642288(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTAGTCAACTAG
SmilChr01G002415 Chr01 NC_080387.1:41528812-41528824promoter 内 7-19 bp + 3982 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 41532806-41533526(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCTTTTGACTATT
SmilChr02G004963 Chr02 NC_080388.1:71553898-71553910promoter 内 2859-2871 bp - 1130 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 71547117-71552768(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGTGTTGACTCCA
SmilChr03G002240 Chr03 NC_080389.1:35290945-35290957promoter 内 2289-2301 bp + 1700 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 35288443-35289245(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTGAGTCAACATC
SmilChr02G002493 Chr02 NC_080388.1:43371196-43371208promoter 内 3732-3744 bp + 257 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 43367254-43370939(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATCAGTCAACTTA
SmilChr01G005040 Chr01 NC_080387.1:68340219-68340231promoter 内 3651-3663 bp + 338 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 68336672-68339881(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATAGTCAACTTA
SmilChr01G003128 Chr01 NC_080387.1:50115724-50115736promoter 内 3343-3355 bp - 646 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 50116382-50117713(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTAGTCAAAAGC
SmilChr03G001551 Chr03 NC_080389.1:19539831-19539843promoter 内 3304-3316 bp + 685 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 19540528-19540599(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATTTTGACTAGA