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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G000478; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001018-RA_Salv SmilChr08G000478 GATA XP_057781809.1 MP00130 AGATCTAGATCTGAA

可能结合的靶基因

9821 个结合位点 6015 个候选靶基因 第 109 / 121 下载 TSV

上一页 109 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002707 Chr01 NC_080387.1:45340956-45340970promoter 内 768-782 bp + 3219 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 45344189-45344260(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTTTTTAGATCTAGG
SmilChr01G002932 Chr01 NC_080387.1:48090715-48090729promoter 内 766-780 bp - 3221 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 48093950-48097012(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATGAGATCTAAAGTA
SmilChr04G002575 Chr04 NC_080390.1:41056036-41056050promoter 内 757-771 bp - 3230 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 41052059-41052806(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GCGAATAGATCTGCT
SmilChr02G001688 Chr02 NC_080388.1:31115383-31115397promoter 内 745-759 bp + 3242 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 31111086-31112141(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTGAGATCTAGGAGT
SmilChr02G001449 Chr02 NC_080388.1:27184980-27184994promoter 内 735-749 bp - 3252 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 27179273-27181728(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AATTGTAGATCTGTT
SmilChr03G000868 Chr03 NC_080389.1:9865519-9865533promoter 内 722-736 bp - 3265 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 9868798-9874360(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCCATGGTC
SmilChr01G002930 Chr01 NC_080387.1:48090715-48090729promoter 内 683-697 bp - 3304 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 48082383-48087411(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TACTTTAGATCTCAT
SmilChr03G004405 Chr03 NC_080389.1:62217755-62217769promoter 内 668-682 bp - 3319 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 62221088-62224231(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCAGATCTCATAAT
SmilChr05G001501 Chr05 NC_080391.1:13766652-13766666promoter 内 654-668 bp - 3333 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 13769999-13773178(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GCCAGATCTACAGAT
SmilChr03G001186 Chr03 NC_080389.1:13613873-13613887promoter 内 650-664 bp - 3337 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 13617224-13618288(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AACAGATCTACAATT
SmilChr01G005565 Chr01 NC_080387.1:72442375-72442389promoter 内 574-588 bp + 3413 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 72445802-72448002(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AATTGTAGATCTGTT
SmilChr03G003175 Chr03 NC_080389.1:49198208-49198222promoter 内 571-585 bp - 3416 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 49201638-49202376(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTGAGATCTAAGCTC
SmilChr01G000768 Chr01 NC_080387.1:16809435-16809449promoter 内 551-565 bp + 3436 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 16812885-16820170(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CGATTTAGATCTCTT
SmilChr02G001793 Chr02 NC_080388.1:32715979-32715993promoter 内 514-528 bp - 3473 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 32711688-32712506(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GCGAATAGATCTGCT
SmilChr01G005894 Chr01 NC_080387.1:74875882-74875896promoter 内 489-503 bp - 3498 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 74870989-74872384(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AATTGTAGATCTGTT
SmilChr04G003827 Chr04 NC_080390.1:54363042-54363056promoter 内 483-497 bp - 3504 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 54366560-54368416(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GCGAGATCTAAAGTT
SmilChr02G004558 Chr02 NC_080388.1:68111073-68111087promoter 内 481-495 bp + 3506 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 68103579-68107567(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CATAGATCTAATTGT
SmilChr03G003477 Chr03 NC_080389.1:53307321-53307335promoter 内 468-482 bp - 3519 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 53310854-53316655(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AACAGATCTACAATT
SmilChr02G004340 Chr02 NC_080388.1:65641315-65641329promoter 内 459-473 bp - 3528 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 65644857-65647214(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TGGAGATCTAATTGC
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SmilChr03G000767 Chr03 NC_080389.1:8785072-8785086promoter 内 412-426 bp + 3575 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 8779824-8781497(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATTAGATCTAACTTA
SmilChr04G001318 Chr04 NC_080390.1:21234328-21234342promoter 内 401-415 bp + 3586 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 21237928-21241509(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GCGAATAGATCTGCT
SmilChr04G003457 Chr04 NC_080390.1:51061778-51061792promoter 内 383-397 bp - 3604 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 51056587-51058174(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTGGCTAGATCTGTG
SmilChr01G005310 Chr01 NC_080387.1:70352614-70352628promoter 内 297-311 bp - 3690 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 70348448-70348924(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GACCTTAGATCTGTG
SmilChr05G001197 Chr05 NC_080391.1:10063978-10063992promoter 内 241-255 bp - 3746 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 10067738-10071489(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATAAGATCTAAACGT
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SmilChr02G005514 Chr02 NC_080388.1:75254638-75254652promoter 内 220-234 bp - 3767 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 75249826-75250871(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AAATCTAGATCGAGA
SmilChr02G004745 Chr02 NC_080388.1:69659222-69659236promoter 内 164-178 bp - 3823 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 69663059-69666520(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TCCAGATCTAAGATA
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SmilChr04G001109 Chr04 NC_080390.1:15920378-15920392promoter 内 148-162 bp + 3839 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 15924231-15929789(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AATTGTAGATCTGTT
SmilChr03G002885 Chr03 NC_080389.1:45512958-45512972promoter 内 92-106 bp + 3895 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 45516867-45517284(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AATTCTAGATCCGCC
SmilChr04G002675 Chr04 NC_080390.1:42194019-42194033promoter 内 83-97 bp - 3904 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 42197937-42202533(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CGGAGATCTAAAAAC
SmilChr04G002850 Chr04 NC_080390.1:44601040-44601054promoter 内 43-57 bp + 3944 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 44596281-44597096(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTCAGATCTCCCTCC
SmilChr04G001106 Chr04 NC_080390.1:15844527-15844541promoter 内 18-32 bp - 3969 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 15838118-15840558(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGGCTGAGATCTGGT
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SmilChr03G002920 Chr03 NC_080389.1:45947232-45947246promoter 内 2198-2212 bp - 1789 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 3 45949035-45951510(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TCCAGATCTCCAATC
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SmilChr05G001407 Chr05 NC_080391.1:12677225-12677239promoter 内 3297-3311 bp - 690 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 2 12677929-12678639(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATGAGATCTAGGGCA
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SmilChr01G004639 Chr01 NC_080387.1:64428961-64428975promoter 内 1550-1564 bp - 2437 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 2 64425773-64426524(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACGACTAGATCGGAT
SmilChr04G003345 Chr04 NC_080390.1:50099787-50099801promoter 内 1195-1209 bp - 2792 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 2 50102593-50104370(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTAAGATCTAAATAG
SmilChr01G006131 Chr01 NC_080387.1:76825702-76825716promoter 内 1064-1078 bp + 2923 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 2 76828639-76833459(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GCTCCTAGATCTCGA
SmilChr01G003389 Chr01 NC_080387.1:52586314-52586328promoter 内 692-706 bp + 3295 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 2 52579152-52583019(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCTACGACA
SmilChr01G000248 Chr01 NC_080387.1:4674090-4674104promoter 内 590-604 bp + 3397 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 2 4670000-4670693(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TCCAGATCTCCACCA
SmilChr04G000422 Chr04 NC_080390.1:4491543-4491557promoter 内 434-448 bp - 3553 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 2 4481287-4487990(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGGTCTAGATCGAGT
SmilChr01G000969 Chr01 NC_080387.1:20533282-20533296promoter 内 23-37 bp + 3964 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 2 20528323-20529318(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTCAGATCGAGACTC
SmilChr01G002688 Chr01 NC_080387.1:45106999-45107013promoter 内 3904-3918 bp - 83 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 45104700-45106916(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGCAATAGATCTAAT
SmilChr03G003200 Chr03 NC_080389.1:49540973-49540987promoter 内 3899-3913 bp + 88 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 49541075-49543951(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AATACTAGATCGGAA
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SmilChr04G001033 Chr04 NC_080390.1:14668682-14668696promoter 内 3818-3832 bp - 169 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.3/ 100 1 14668865-14670340(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TACAGATCTACAACA