转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G003441; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00014538-RA_Salv SmilChr07G003441 NAC XP_057773618.1 MP00108 TTAAGTAAT

可能结合的靶基因

9810 个结合位点 6458 个候选靶基因 第 11 / 130 下载 TSV

上一页 11 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004040 Chr01 NC_080387.1:58819451-58819459promoter 内 3225-3233 bp - 768 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 58820227-58822393(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr02G002822 Chr02 NC_080388.1:48335735-48335743promoter 内 3211-3219 bp - 782 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 48336525-48342033(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr01G004139 Chr01 NC_080387.1:59895682-59895690promoter 内 3199-3207 bp - 794 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 59891649-59894888(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G005452 Chr02 NC_080388.1:74862639-74862647promoter 内 3194-3202 bp + 799 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 74863446-74865599(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G005166 Chr02 NC_080388.1:72997931-72997939promoter 内 3189-3197 bp - 804 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 72994608-72997127(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr01G003889 Chr01 NC_080387.1:57204134-57204142promoter 内 3186-3194 bp + 807 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 57204949-57209344(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G004202 Chr02 NC_080388.1:64311929-64311937promoter 内 3185-3193 bp - 808 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 64311031-64311121(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G004999 Chr02 NC_080388.1:71813775-71813783promoter 内 3177-3185 bp + 816 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 71810471-71812959(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr01G000465 Chr01 NC_080387.1:9534931-9534939promoter 内 3175-3183 bp + 818 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 9535757-9539133(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr01G001979 Chr01 NC_080387.1:35191719-35191727promoter 内 3151-3159 bp + 842 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 35189026-35190877(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr02G002274 Chr02 NC_080388.1:40206053-40206061promoter 内 3151-3159 bp + 842 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 40198518-40205211(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr02G001770 Chr02 NC_080388.1:32455386-32455394promoter 内 3136-3144 bp - 857 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 32453541-32454529(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr01G005757 Chr01 NC_080387.1:73657265-73657273promoter 内 3133-3141 bp + 860 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 73658133-73660972(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G004212 Chr02 NC_080388.1:64381462-64381470promoter 内 3129-3137 bp - 864 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 64377780-64380598(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G000770 Chr02 NC_080388.1:12673224-12673232promoter 内 3125-3133 bp + 868 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 12674100-12676684(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G004772 Chr02 NC_080388.1:69891259-69891267promoter 内 3125-3133 bp + 868 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 69892135-69895808(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G003983 Chr02 NC_080388.1:62075405-62075413promoter 内 3117-3125 bp - 876 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 62076289-62077850(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr01G001693 Chr01 NC_080387.1:31146892-31146900promoter 内 3108-3116 bp - 885 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 31147785-31148333(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr01G000315 Chr01 NC_080387.1:6072375-6072383promoter 内 3107-3115 bp - 886 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 6069699-6071489(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G003418 Chr02 NC_080388.1:55409973-55409981promoter 内 3099-3107 bp + 894 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 55406754-55409079(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr01G002030 Chr01 NC_080387.1:35870816-35870824promoter 内 3098-3106 bp - 895 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 35869139-35869921(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr01G000554 Chr01 NC_080387.1:11520796-11520804promoter 内 3085-3093 bp - 908 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 11517300-11519888(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G002863 Chr02 NC_080388.1:48804011-48804019promoter 内 3074-3082 bp - 919 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 48796898-48803092(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr01G001189 Chr01 NC_080387.1:24046854-24046862promoter 内 3073-3081 bp + 920 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 24044763-24045934(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr02G003832 Chr02 NC_080388.1:59963957-59963965promoter 内 3063-3071 bp - 930 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 59958803-59963027(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr03G000540 Chr03 NC_080389.1:5866825-5866833promoter 内 3058-3066 bp + 935 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 5867768-5915015(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr01G002209 Chr01 NC_080387.1:38425611-38425619promoter 内 3051-3059 bp + 942 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 38418887-38424669(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr01G001963 Chr01 NC_080387.1:34963970-34963978promoter 内 3050-3058 bp + 943 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 34961171-34963027(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr03G000591 Chr03 NC_080389.1:6574688-6574696promoter 内 3048-3056 bp - 945 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 6572757-6573743(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr01G000223 Chr01 NC_080387.1:3956702-3956710promoter 内 3045-3053 bp + 948 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 3953812-3955754(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr03G000491 Chr03 NC_080389.1:5262375-5262383promoter 内 3036-3044 bp + 957 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 5263340-5269150(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr01G003504 Chr01 NC_080387.1:53620663-53620671promoter 内 3034-3042 bp + 959 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 53617154-53619704(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr01G000245 Chr01 NC_080387.1:4549669-4549677promoter 内 3031-3039 bp - 962 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 4546194-4548707(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G004201 Chr02 NC_080388.1:64311929-64311937promoter 内 3028-3036 bp - 965 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 64310854-64310964(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr01G005492 Chr01 NC_080387.1:71840973-71840981promoter 内 3025-3033 bp - 968 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 71834680-71840005(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr01G000265 Chr01 NC_080387.1:5116130-5116138promoter 内 3015-3023 bp + 978 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 5117116-5122012(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr01G002859 Chr01 NC_080387.1:47165648-47165656promoter 内 3008-3016 bp - 985 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 47164582-47164663(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G003605 Chr02 NC_080388.1:57302000-57302008promoter 内 3000-3008 bp - 993 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 57303001-57304523(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr02G003974 Chr02 NC_080388.1:61982990-61982998promoter 内 2971-2979 bp + 1022 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 61976230-61981968(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr02G000384 Chr02 NC_080388.1:4792928-4792936promoter 内 2968-2976 bp + 1025 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 4793961-4795480(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G005264 Chr02 NC_080388.1:73739611-73739619promoter 内 2956-2964 bp + 1037 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 73734651-73738574(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr02G002674 Chr02 NC_080388.1:46334446-46334454promoter 内 2946-2954 bp - 1047 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 46335501-46337831(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr02G003471 Chr02 NC_080388.1:56016351-56016359promoter 内 2936-2944 bp - 1057 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 56017416-56023072(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr01G003167 Chr01 NC_080387.1:50463944-50463952promoter 内 2931-2939 bp - 1062 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 50465014-50465975(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr03G000097 Chr03 NC_080389.1:1084618-1084626promoter 内 2920-2928 bp - 1073 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 1082174-1083545(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr01G005533 Chr01 NC_080387.1:72174686-72174694promoter 内 2912-2920 bp + 1081 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 72171487-72173605(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr02G001470 Chr02 NC_080388.1:27419454-27419462promoter 内 2911-2919 bp + 1082 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 27420544-27430032(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAAT
SmilChr02G005400 Chr02 NC_080388.1:74561118-74561126promoter 内 2911-2919 bp - 1082 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 74562208-74563463(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr01G001807 Chr01 NC_080387.1:33004295-33004303promoter 内 2908-2916 bp + 1085 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 32999788-33003210(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA
SmilChr02G004597 Chr02 NC_080388.1:68494411-68494419promoter 内 2908-2916 bp + 1085 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 2 68488056-68493326(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAA