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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002885; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022980-RA_Salv SmilChr01G002885 ERF XP_057767601.1 MP00151 ATGGACGGTGGAGG

可能结合的靶基因

9976 个结合位点 6907 个候选靶基因 第 111 / 139 下载 TSV

上一页 111 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G000085 Chr06 NC_080392.1:626196-626209promoter 内 255-268 bp - 3733 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 617296-622463(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GAGGACGGTGTTGT
SmilChr03G002453 Chr03 NC_080389.1:38904862-38904875promoter 内 210-223 bp - 3778 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 38894974-38901084(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGCACCGG
SmilChr04G002688 Chr04 NC_080390.1:42302165-42302178promoter 内 155-168 bp + 3833 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 42306011-42310324(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TGGGACGGTGAGAG
SmilChr06G001283 Chr06 NC_080392.1:13423997-13424010promoter 内 141-154 bp + 3847 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 13418809-13420150(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCACCACCGTCTTC
SmilChr02G004378 Chr02 NC_080388.1:66127755-66127768promoter 内 84-97 bp - 3904 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 66131672-66136901(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCGGAGCCGTCCAA
SmilChr01G003877 Chr01 NC_080387.1:57077336-57077349promoter 内 3737-3750 bp - 251 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 57063543-57077085(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GAAGGCGGTGGAGG
SmilChr02G004126 Chr02 NC_080388.1:63508296-63508309promoter 内 2975-2988 bp + 1013 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 3 63509322-63511553(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GAAGGCGGTGGAGG
SmilChr07G000765 Chr07 NC_080393.1:5365905-5365918promoter 内 3749-3762 bp + 239 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 5366157-5366912(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGAGCGAG
SmilChr03G002635 Chr03 NC_080389.1:41916239-41916252promoter 内 3616-3629 bp + 372 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 41916624-41920663(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GAAGGCGGTGGAGG
SmilChr01G003047 Chr01 NC_080387.1:49450961-49450974promoter 内 3528-3541 bp - 460 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 49448957-49450501(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GGCGACGGTGACGG
SmilChr03G002846 Chr03 NC_080389.1:45015554-45015567promoter 内 3497-3510 bp - 491 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 45016058-45021155(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACTCCACCGGCGAC
SmilChr06G002447 Chr06 NC_080392.1:35211763-35211776promoter 内 3459-3472 bp + 529 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 35212305-35214171(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGAGGGAA
SmilChr03G004745 Chr03 NC_080389.1:64557960-64557973promoter 内 3174-3187 bp + 814 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 64553849-64557146(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CCTCCACCGCCTTC
SmilChr05G001394 Chr05 NC_080391.1:12508920-12508933promoter 内 3027-3040 bp - 961 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 12509894-12510662(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ACGCCACCGTCTCC
SmilChr02G001990 Chr02 NC_080388.1:35993612-35993625promoter 内 2906-2919 bp - 1082 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 35994707-35997326(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTTCCACCGCCCTG
SmilChr01G005489 Chr01 NC_080387.1:71831086-71831099promoter 内 2813-2826 bp - 1175 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 71825897-71829911(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 ATGGACGGTGATTT
SmilChr07G000764 Chr07 NC_080393.1:5365905-5365918promoter 内 2573-2586 bp + 1415 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 5363679-5364490(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CTCGCTCCGTCCAC
SmilChr05G002657 Chr05 NC_080391.1:30074122-30074135promoter 内 2532-2545 bp - 1456 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 30071236-30072666(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GGCGACGGTGGAGA
SmilChr01G000996 Chr01 NC_080387.1:21005176-21005189promoter 内 1674-1687 bp - 2314 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 21001451-21002862(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GAAGGCGGTGGAGG
SmilChr03G004746 Chr03 NC_080389.1:64557960-64557973promoter 内 1389-1402 bp + 2599 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 64560572-64576340(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GAAGGCGGTGGAGG
SmilChr01G002875 Chr01 NC_080387.1:47348290-47348303promoter 内 1337-1350 bp - 2651 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 47343786-47345639(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GACGACGGTGGCTG
SmilChr05G004179 Chr05 NC_080391.1:55700466-55700479promoter 内 1190-1203 bp + 2798 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 55703277-55705843(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GATGGCGGTGGAGC
SmilChr05G004177 Chr05 NC_080391.1:55700466-55700479promoter 内 1080-1093 bp + 2908 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 55694135-55697558(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GCTCCACCGCCATC
SmilChr04G001662 Chr04 NC_080390.1:27596276-27596289promoter 内 1066-1079 bp - 2922 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 27592220-27593354(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GGTGGCGGTGGAGA
SmilChr07G000766 Chr07 NC_080393.1:5365905-5365918promoter 内 933-946 bp + 3055 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 5368973-5369456(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGAGCGAG
SmilChr02G001088 Chr02 NC_080388.1:19586316-19586329promoter 内 3957-3970 bp - 31 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 19582600-19586285(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGAGAGTG
SmilChr06G002332 Chr06 NC_080392.1:33839075-33839088promoter 内 3886-3899 bp - 102 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 33818395-33838973(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 GTGGACGGAGGAAT
SmilChr02G002475 Chr02 NC_080388.1:43115159-43115172promoter 内 3876-3889 bp + 112 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 43114958-43115047(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCAGCTCCGTCCAT
SmilChr04G001139 Chr04 NC_080390.1:16803831-16803844promoter 内 3863-3876 bp - 125 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 16803969-16804074(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CACTCTCCGTCCAC
SmilChr03G001033 Chr03 NC_080389.1:12031381-12031394promoter 内 3827-3840 bp - 161 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 12031555-12031661(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CACTCTCCGTCCAC
SmilChr01G000080 Chr01 NC_080387.1:1457378-1457391promoter 内 3826-3839 bp + 162 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 1457111-1457216(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CACTCTCCGTCCAC
SmilChr01G001144 Chr01 NC_080387.1:23382665-23382678promoter 内 3826-3839 bp + 162 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 23382398-23382503(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CACTCTCCGTCCAC
SmilChr02G001347 Chr02 NC_080388.1:25178157-25178170promoter 内 3826-3839 bp + 162 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 25177889-25177995(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CACTCTCCGTCCAC
SmilChr03G001620 Chr03 NC_080389.1:20735226-20735239promoter 内 3826-3839 bp + 162 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 20734958-20735064(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CACTCTCCGTCCAC
SmilChr03G001694 Chr03 NC_080389.1:22458328-22458341promoter 内 3826-3839 bp - 162 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 22458503-22458609(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CACTCTCCGTCCAC
SmilChr04G001453 Chr04 NC_080390.1:23917813-23917826promoter 内 3826-3839 bp - 162 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 23917988-23918094(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CACTCTCCGTCCAC
SmilChr05G002889 Chr05 NC_080391.1:34666393-34666406promoter 内 3826-3839 bp - 162 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 34666568-34666674(+) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 CACTCTCCGTCCAC
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SmilChr02G001447 Chr02 NC_080388.1:27140133-27140146promoter 内 3798-3811 bp + 190 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 27137826-27139943(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TGTCCACCGCCCCC
SmilChr02G002474 Chr02 NC_080388.1:43115159-43115172promoter 内 3722-3735 bp + 266 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 43114805-43114893(-) SMil_00022980-RA_Salv MP00151 TCAGCTCCGTCCAT
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