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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003399; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00009551-RA_Salv SmilChr02G003399 ERF XP_057793859.1 MP00240 CCACCTCCACCGCCA

可能结合的靶基因

9978 个结合位点 6368 个候选靶基因 第 111 / 128 下载 TSV

上一页 111 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G002952 Chr07 NC_080393.1:29936880-29936894promoter 内 3734-3748 bp + 253 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 29928157-29936627(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGGCGGTGGAAGCTA
SmilChr07G004357 Chr07 NC_080393.1:56136985-56136999promoter 内 2680-2694 bp - 1307 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 56134223-56135678(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GTGGCACCACCGCCG
SmilChr03G000551 Chr03 NC_080389.1:5967329-5967343promoter 内 2532-2546 bp + 1455 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 5968798-5987336(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CAGCCACCACCGCAG
SmilChr08G000638 Chr08 NC_080394.1:4750587-4750601promoter 内 1775-1789 bp - 2212 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 4752813-4753571(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGTGCCTC
SmilChr08G000636 Chr08 NC_080394.1:4750587-4750601promoter 内 1350-1364 bp - 2637 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 4743391-4747950(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GAGGCACCACCGCCG
SmilChr04G002508 Chr04 NC_080390.1:40073403-40073417promoter 内 894-908 bp - 3093 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 40069828-40070310(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCACCTCCGCCACTT
SmilChr06G002881 Chr06 NC_080392.1:41631745-41631759promoter 内 641-655 bp - 3346 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 41620616-41628399(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCATCATCACCGCCG
SmilChr03G003665 Chr03 NC_080389.1:55499293-55499307promoter 内 606-620 bp - 3381 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 55493349-55495912(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GCGGCGGCACCGCCG
SmilChr03G001709 Chr03 NC_080389.1:22861850-22861864promoter 内 69-83 bp - 3918 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 22854749-22857932(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GCGGCGGCACCGCCG
SmilChr06G002748 Chr06 NC_080392.1:39934816-39934830promoter 内 3918-3932 bp + 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 39932646-39934747(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CAGCGGTGGCGTGGC
SmilChr02G003088 Chr02 NC_080388.1:51761619-51761633promoter 内 3860-3874 bp - 127 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 51760407-51761492(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CTGCTTCCACCGCTT
SmilChr06G002868 Chr06 NC_080392.1:41526587-41526601promoter 内 3781-3795 bp - 206 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 41524485-41526381(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CAGCATCCACCGTCA
SmilChr04G004140 Chr04 NC_080390.1:56180378-56180392promoter 内 3737-3751 bp + 250 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 56180642-56181443(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GCGGCGGCACCGCCG
SmilChr07G002970 Chr07 NC_080393.1:30221924-30221938promoter 内 3734-3748 bp + 253 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 30209884-30221671(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGGCGGTGGAAGCTA
SmilChr02G004737 Chr02 NC_080388.1:69585317-69585331promoter 内 3662-3676 bp - 325 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 69585656-69585774(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGGCGGTGGCGAAAC
SmilChr01G004405 Chr01 NC_080387.1:62154561-62154575promoter 内 3624-3638 bp + 363 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 62149137-62154198(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGGTGGTGGAGGTTG
SmilChr05G001499 Chr05 NC_080391.1:13757478-13757492promoter 内 3566-3580 bp + 421 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 13757913-13760567(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCACCTCCACCAACA
SmilChr03G002325 Chr03 NC_080389.1:36602353-36602367promoter 内 3501-3515 bp - 486 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 36602853-36603350(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGGTGGTGGAGGAGA
SmilChr04G002509 Chr04 NC_080390.1:40073403-40073417promoter 内 3462-3476 bp - 525 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 40073942-40076409(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AAGTGGCGGAGGTGG
SmilChr04G000780 Chr04 NC_080390.1:9554337-9554351promoter 内 3436-3450 bp - 551 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 9554902-9556651(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGGTGGTGGAGGAGA
SmilChr01G001267 Chr01 NC_080387.1:25354336-25354350promoter 内 3430-3444 bp - 557 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 25352681-25353779(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TCGAGGCCACCGCCG
SmilChr08G000045 Chr08 NC_080394.1:293268-293282promoter 内 3381-3395 bp - 606 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 292192-292662(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GCGGCGGCACCGCCG
SmilChr08G000637 Chr08 NC_080394.1:4750587-4750601promoter 内 3371-3385 bp - 616 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 4749063-4749971(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GAGGCACCACCGCCG
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SmilChr08G000563 Chr08 NC_080394.1:4082988-4083002promoter 内 3224-3238 bp - 763 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 4083765-4087386(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGCTGATC
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SmilChr03G000719 Chr03 NC_080389.1:8057798-8057812promoter 内 3219-3233 bp - 768 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 8058580-8060311(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGTGCCAC
SmilChr07G003176 Chr07 NC_080393.1:33813219-33813233promoter 内 3217-3231 bp - 770 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 33814003-33819576(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGGCGGTGGGGCTGA
SmilChr02G004659 Chr02 NC_080388.1:68999807-68999821promoter 内 3177-3191 bp + 810 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 68990617-68998997(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGAGATCC
SmilChr04G002483 Chr04 NC_080390.1:39666688-39666702promoter 内 3170-3184 bp - 817 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 39667519-39669989(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AAGTGGCGGAGGTGG
SmilChr04G001129 Chr04 NC_080390.1:16395584-16395598promoter 内 3139-3153 bp - 848 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 16393353-16394736(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCCTCCACCGCGA
SmilChr03G002388 Chr03 NC_080389.1:37811117-37811131promoter 内 3102-3116 bp - 885 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 37807486-37810232(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GCGGCGGCACCGCCG
SmilChr03G000997 Chr03 NC_080389.1:11318503-11318517promoter 内 3098-3112 bp - 889 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 11316122-11317614(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCCTCCACCGCGA
SmilChr03G000994 Chr03 NC_080389.1:11308615-11308629promoter 内 3096-3110 bp - 891 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 11306232-11307724(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCCTCCACCGCGA
SmilChr07G002851 Chr07 NC_080393.1:28663298-28663312promoter 内 3092-3106 bp - 895 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 28660894-28662403(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCCTCCACCGCGA
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SmilChr01G006103 Chr01 NC_080387.1:76534541-76534555promoter 内 3079-3093 bp - 908 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 76529367-76533633(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCCTCCACCGCGA
SmilChr03G003868 Chr03 NC_080389.1:57794563-57794577promoter 内 3077-3091 bp + 910 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 57795487-57797092(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TCTCTGCCACCGCTT
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SmilChr03G000926 Chr03 NC_080389.1:10603498-10603512promoter 内 3047-3061 bp - 940 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 10604452-10607730(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GGACGGTGGAGCGGG
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SmilChr08G002523 Chr08 NC_080394.1:24434927-24434941promoter 内 3012-3026 bp + 975 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 24435916-24440795(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CAAGCTCCACCGTCA
SmilChr02G003934 Chr02 NC_080388.1:61408282-61408296promoter 内 2998-3012 bp - 989 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 61409285-61410546(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGGCGGTGGCTCAGA
SmilChr01G000912 Chr01 NC_080387.1:19342279-19342293promoter 内 2991-3005 bp - 996 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 19343289-19350205(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGGGGTTC
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SmilChr04G001584 Chr04 NC_080390.1:26330996-26331010promoter 内 2830-2844 bp - 1157 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 26328461-26329839(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCCTCCACCGCGA
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SmilChr07G002922 Chr07 NC_080393.1:29604488-29604502promoter 内 2824-2838 bp + 1163 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 29605665-29606850(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCCTCCACCGCGA