转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000162; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008183-RA_Salv SmilChr04G000162 MYB XP_057807467.1 MP00134 TCCACCTACCACCAC

可能结合的靶基因

8676 个结合位点 7078 个候选靶基因 第 112 / 142 下载 TSV

上一页 112 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G006174 Chr01 NC_080387.1:77248529-77248543promoter 内 3781-3795 bp - 206 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 77248749-77252889(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TGATTGGTAGGTAAC
SmilChr03G000330 Chr03 NC_080389.1:3747381-3747395promoter 内 3706-3720 bp - 281 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 3743835-3747100(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATCACCTACCTAAAA
SmilChr02G001905 Chr02 NC_080388.1:34347808-34347822promoter 内 3675-3689 bp + 312 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 34345531-34347496(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AAAATGGTAGGTACA
SmilChr03G000267 Chr03 NC_080389.1:3080443-3080457promoter 内 3669-3683 bp - 318 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 3079532-3080125(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATCACCTACCTAAAA
SmilChr03G000278 Chr03 NC_080389.1:3163352-3163366promoter 内 3666-3680 bp - 321 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 3160443-3163031(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATCACCTACCTAAAA
SmilChr06G000894 Chr06 NC_080392.1:8450265-8450279promoter 内 3597-3611 bp + 390 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 8445897-8449875(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTTGTGGTAGTTGTT
SmilChr06G000073 Chr06 NC_080392.1:557891-557905promoter 内 3461-3475 bp + 526 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 558431-560792(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CACACCTACTAGCAT
SmilChr08G001981 Chr08 NC_080394.1:17524504-17524518promoter 内 3452-3466 bp - 535 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 17525053-17528898(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TAGTAAGTAGGTGGA
SmilChr07G000421 Chr07 NC_080393.1:2916570-2916584promoter 内 3406-3420 bp + 581 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 2910059-2915989(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTCTAGGTAGGTGTT
SmilChr01G000712 Chr01 NC_080387.1:15892066-15892080promoter 内 3308-3322 bp + 679 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 15892759-15905581(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TATACCTACCGAAAT
SmilChr08G003978 Chr08 NC_080394.1:47861188-47861202promoter 内 3266-3280 bp + 721 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 47861923-47867821(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTCACCTACTCACTC
SmilChr08G003644 Chr08 NC_080394.1:39920714-39920728promoter 内 3101-3115 bp - 886 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 39918819-39919828(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACACCTACCTAATG
SmilChr03G000266 Chr03 NC_080389.1:3080443-3080457promoter 内 3002-3016 bp - 985 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 3077461-3079458(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATCACCTACCTAAAA
SmilChr03G000122 Chr03 NC_080389.1:1322663-1322677promoter 内 2974-2988 bp - 1013 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 1323690-1324707(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTTTAGGTAGGTGAT
SmilChr04G003663 Chr04 NC_080390.1:53090323-53090337promoter 内 2887-2901 bp - 1100 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 53087306-53089223(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCACCTAACTTAAC
SmilChr03G001521 Chr03 NC_080389.1:18656353-18656367promoter 内 2862-2876 bp - 1125 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 18652653-18655228(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACACCTACCTGATG
SmilChr05G002790 Chr05 NC_080391.1:32643014-32643028promoter 内 2742-2756 bp + 1245 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 32638802-32641769(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCGAAAGTAGGTGCA
SmilChr06G000147 Chr06 NC_080392.1:1030459-1030473promoter 内 2672-2686 bp + 1315 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 1023494-1029144(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAGGTGGTAGGAGGG
SmilChr02G005235 Chr02 NC_080388.1:73545979-73545993promoter 内 2671-2685 bp - 1316 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 73542925-73544663(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TGTACCTACCGTTAA
SmilChr07G000843 Chr07 NC_080393.1:6007685-6007699promoter 内 2663-2677 bp + 1324 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 6009023-6013361(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTTACCTACCTGTTA
SmilChr02G004555 Chr02 NC_080388.1:68083334-68083348promoter 内 2585-2599 bp + 1402 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 68078785-68081932(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTGAAAGTAGGTGCA
SmilChr05G002268 Chr05 NC_080391.1:24397283-24397297promoter 内 2577-2591 bp + 1410 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 24390986-24395873(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAGTGAGTAGGTGAA
SmilChr05G000174 Chr05 NC_080391.1:1375474-1375488promoter 内 2561-2575 bp - 1426 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 1371204-1374048(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AACACCTACCGTAGT
SmilChr08G003086 Chr08 NC_080394.1:31090668-31090682promoter 内 2557-2571 bp + 1430 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 31088197-31089238(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AAAATGGTAGGTACA
SmilChr04G000681 Chr04 NC_080390.1:7903639-7903653promoter 内 2458-2472 bp + 1529 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 7905182-7906160(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACTACCTACCGTTAG
SmilChr05G004392 Chr05 NC_080391.1:57366240-57366254promoter 内 2425-2439 bp + 1562 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 57363760-57364678(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GATATAGTAGGTGGT
SmilChr05G001253 Chr05 NC_080391.1:10662316-10662330promoter 内 2417-2431 bp + 1570 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 10663900-10666679(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GACACCTACCTCGTT
SmilChr04G001998 Chr04 NC_080390.1:32336740-32336754promoter 内 2373-2387 bp - 1614 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 32335047-32335126(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GGCACCTACCGTTGG
SmilChr08G002488 Chr08 NC_080394.1:23785785-23785799promoter 内 2269-2283 bp - 1718 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 23787517-23789223(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCGGAGTAGGTGTG
SmilChr01G003750 Chr01 NC_080387.1:55872809-55872823promoter 内 2238-2252 bp + 1749 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 55874572-55875555(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACCACCTACTGCTGA
SmilChr07G000341 Chr07 NC_080393.1:2316627-2316641promoter 内 1997-2011 bp - 1990 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 2312536-2314637(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AATACCTACCCTCAC
SmilChr07G001736 Chr07 NC_080393.1:14749865-14749879promoter 内 1854-1868 bp + 2133 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 14752012-14752611(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTTACCTACCATGGA
SmilChr04G003425 Chr04 NC_080390.1:50845826-50845840promoter 内 1817-1831 bp - 2170 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 50848010-50851163(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TGAAAGTTAGGTGGA
SmilChr05G004393 Chr05 NC_080391.1:57366240-57366254promoter 内 1816-1830 bp + 2171 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 57368425-57372651(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACCACCTACTATATC
SmilChr07G001677 Chr07 NC_080393.1:14218978-14218992promoter 内 1815-1829 bp + 2172 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 14216306-14216806(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGAGTAGTAGGTGTA
SmilChr02G003107 Chr02 NC_080388.1:52043792-52043806promoter 内 1774-1788 bp - 2213 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 52039649-52041579(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CACACCTACTAACAT
SmilChr07G002631 Chr07 NC_080393.1:25388142-25388156promoter 内 1735-1749 bp - 2252 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 25384769-25385890(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CACACCTACTCTCAC
SmilChr07G002429 Chr07 NC_080393.1:22612140-22612154promoter 内 1711-1725 bp + 2276 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 22606680-22609864(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AAGCAGGTAGGTATA
SmilChr07G003566 Chr07 NC_080393.1:41653066-41653080promoter 内 1698-1712 bp - 2289 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 41655369-41656204(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AAAATGGTAGGTACA
SmilChr04G001742 Chr04 NC_080390.1:28700715-28700729promoter 内 1693-1707 bp + 2294 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 28694936-28698421(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCATTGGTAGGTACA
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SmilChr05G000628 Chr05 NC_080391.1:4740954-4740968promoter 内 1580-1594 bp - 2407 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 4735616-4738547(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AACACCTACCAAAAG
SmilChr06G000845 Chr06 NC_080392.1:7991631-7991645promoter 内 1544-1558 bp + 2443 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 7985661-7989188(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTGGGTGTAGGTGGA
SmilChr08G001860 Chr08 NC_080394.1:15970910-15970924promoter 内 1460-1474 bp + 2527 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 15973451-15976484(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATCACCTACTCCACC
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SmilChr02G002821 Chr02 NC_080388.1:48307356-48307370promoter 内 1401-1415 bp - 2586 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 48309956-48312817(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAAGTGGTAGTTACT
SmilChr01G004125 Chr01 NC_080387.1:59735803-59735817promoter 内 1375-1389 bp + 2612 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 59738429-59750632(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCACCTACTCTTGC
SmilChr01G005550 Chr01 NC_080387.1:72296570-72296584promoter 内 1310-1324 bp + 2677 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 72292723-72293893(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCTCTGGTAGGTGTT
SmilChr02G001044 Chr02 NC_080388.1:18509175-18509189promoter 内 1230-1244 bp + 2757 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 18501069-18506418(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CGATAGGTAGGTGAT
SmilChr01G002244 Chr01 NC_080387.1:38984810-38984824promoter 内 1198-1212 bp - 2789 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 38980095-38982021(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TATACCTACCGAAAT