靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。
下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。
| 转录因子 ID | Family | Motifs | 候选靶基因 | 候选位点 | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| ARR-B | 1MP00010 |
8344 | 9778 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00059 |
8333 | 9940 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00296 |
8304 | 9873 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00114 |
8151 | 9897 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00408 |
8149 | 9902 | 查靶基因 | |
| Nin-like | 1MP00449 |
8096 | 9453 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00209 |
8083 | 9910 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00627 |
8075 | 9835 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00450 |
8044 | 9901 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00558 |
8044 | 9762 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00096 |
8019 | 9914 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00476 |
7981 | 9904 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00221 |
7965 | 9903 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00069 |
7882 | 9917 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00406 |
7839 | 9917 | 查靶基因 | |
| TALE | 1MP00670 |
7758 | 9906 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00555 |
7648 | 9805 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00021 |
7629 | 9812 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00132 |
7583 | 9926 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00609 |
7575 | 9941 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00529 |
7559 | 9247 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00510 |
7526 | 9799 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00058 |
7440 | 9855 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00303 |
7416 | 9868 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00565 |
7412 | 9785 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00026 |
7408 | 9854 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00071 |
7408 | 9764 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00033 |
7406 | 9827 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00074 |
7396 | 9969 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00216 |
7342 | 9832 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00539 |
7338 | 9848 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00574 |
7302 | 9846 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00464 |
7299 | 9864 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00315 |
7291 | 9567 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00525 |
7235 | 9838 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00171 |
7182 | 9833 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00506 |
7173 | 9818 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00272 |
7172 | 9889 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00184 |
7147 | 9840 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00647 |
7133 | 9953 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00485 |
7130 | 8059 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00134 |
7078 | 8676 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00312 |
7006 | 8490 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00564 |
6984 | 9893 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00022 |
6959 | 9720 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00040 |
6920 | 9919 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00151 |
6907 | 9976 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00455 |
6900 | 9792 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00482 |
6899 | 8940 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00291 |
6894 | 9321 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00307 |
6893 | 9755 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00195 |
6878 | 9832 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00388 |
6870 | 9774 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00318 |
6849 | 9413 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00633 |
6833 | 8026 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00308 |
6805 | 9826 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00082 |
6784 | 9435 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00080 |
6766 | 9850 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00028 |
6764 | 9024 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00191 |
6736 | 9690 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00081 |
6729 | 9942 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00500 |
6697 | 9681 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00452 |
6671 | 7783 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00531 |
6663 | 9784 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00200 |
6661 | 9930 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00034 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00660 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00055 |
6638 | 9685 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00634 |
6619 | 7771 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00035 |
6618 | 9903 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00568 |
6611 | 9696 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00039 |
6610 | 9936 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00284 |
6552 | 9774 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00422 |
6535 | 9791 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00153 |
6534 | 9706 | 查靶基因 | |
| YABBY | 1MP00620 |
6504 | 9844 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00169 |
6498 | 7295 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00252 |
6478 | 9780 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00108 |
6458 | 9810 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00062 |
6454 | 7249 | 查靶基因 | |
| RAV | 1MP00024 |
6450 | 9853 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00167 |
6439 | 9756 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00416 |
6433 | 9716 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00608 |
6398 | 9817 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00240 |
6368 | 9978 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00607 |
6362 | 9718 | 查靶基因 | |
| Dof | 1MP00402 |
6278 | 9875 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00409 |
6252 | 8429 | 查靶基因 | |
| GRAS | 1MP00611 |
6232 | 9807 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00648 |
6170 | 9939 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00120 |
6144 | 7514 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00251 |
6140 | 9713 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00077 |
6125 | 9815 | 查靶基因 | |
| GATA | 1MP00130 |
6015 | 9821 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00508 |
5979 | 7481 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00260 |
5932 | 9706 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00013 |
5927 | 9712 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00299 |
5919 | 9699 | 查靶基因 |
输入: SmilChr02G003399; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90
| TF ID | 新 Gene ID | 家族 | Protein | Motif | 共识序列 |
|---|---|---|---|---|---|
SMil_00009551-RA_Salv |
SmilChr02G003399 |
ERF | XP_057793859.1 |
MP00240 |
CCACCTCCACCGCCA |
9978 个结合位点 6368 个候选靶基因 第 113 / 128 下载 TSV
| 靶基因 | 染色体 | 最佳结合位点 | 链方向 | 靶基因上游距离 | 结合可能性 | 启动子命中位点 | 基因区间 | TF | Motif | 匹配序列 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SmilChr06G000451 |
Chr06 | NC_080392.1:3662197-3662211promoter 内 986-1000 bp |
+ | 3001 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 3651918-3659196(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGGCGGTGGCATTGA |
SmilChr05G001009 |
Chr05 | NC_080391.1:8289651-8289665promoter 内 969-983 bp |
- | 3018 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 8283766-8286633(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CAACTTCCACCGCTG |
SmilChr06G000682 |
Chr06 | NC_080392.1:6045894-6045908promoter 内 894-908 bp |
- | 3093 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 6035134-6042801(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TCTCCTCCACCACCA |
SmilChr02G004660 |
Chr02 | NC_080388.1:68999807-68999821promoter 内 877-891 bp |
+ | 3110 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 69002931-69006333(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
GGATCTCCACCGCCG |
SmilChr01G004475 |
Chr01 | NC_080387.1:62867093-62867107promoter 内 874-888 bp |
- | 3113 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 62870220-62872210(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGGCGGTGGTGTGCG |
SmilChr01G003632 |
Chr01 | NC_080387.1:54838800-54838814promoter 内 819-833 bp |
- | 3168 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 54841982-54845695(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGGCGGAGGAGGTGG |
SmilChr07G000994 |
Chr07 | NC_080393.1:7234617-7234631promoter 内 810-824 bp |
+ | 3177 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 7230476-7231440(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
AAGTGGCGGAGGTGG |
SmilChr08G000044 |
Chr08 | NC_080394.1:293268-293282promoter 内 805-819 bp |
- | 3182 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 288764-290086(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
GCGGCGGCACCGCCG |
SmilChr03G003664 |
Chr03 | NC_080389.1:55481673-55481687promoter 内 802-816 bp |
- | 3185 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 55484872-55486992(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGTCGGTGGAGATGA |
SmilChr08G002062 |
Chr08 | NC_080394.1:18485590-18485604promoter 内 746-760 bp |
- | 3241 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 18488845-18492567(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TGTTGGTGGAGGTGG |
SmilChr06G000673 |
Chr06 | NC_080392.1:5960372-5960386promoter 内 721-735 bp |
- | 3266 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 5963652-5967204(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
ATGCGGTGGCCGTGG |
SmilChr05G000874 |
Chr05 | NC_080391.1:6934554-6934568promoter 内 707-721 bp |
+ | 3280 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 6929936-6931274(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TGGCGGTGGGGCTGC |
SmilChr07G002482 |
Chr07 | NC_080393.1:23468218-23468232promoter 内 707-721 bp |
+ | 3280 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 23471512-23474009(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CCATCTCCACCGATG |
SmilChr08G003701 |
Chr08 | NC_080394.1:41454115-41454129promoter 内 649-663 bp |
+ | 3338 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 41457467-41460905(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TCGTCGGCACCGCCG |
SmilChr03G001330 |
Chr03 | NC_080389.1:15548027-15548041promoter 内 604-618 bp |
- | 3383 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 15544519-15544644(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TGGCTTCCACCGCCA |
SmilChr01G003669 |
Chr01 | NC_080387.1:55104095-55104109promoter 内 601-615 bp |
- | 3386 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 55107495-55110325(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TGGCGGTGCTGCTGG |
SmilChr04G004138 |
Chr04 | NC_080390.1:56180378-56180392promoter 内 599-613 bp |
+ | 3388 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 56174932-56176990(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGGCGGTGCCGCCGC |
SmilChr01G002159 |
Chr01 | NC_080387.1:37600942-37600956promoter 内 461-475 bp |
+ | 3526 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 37593727-37597416(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
GGGCGGTGGCGGGTT |
SmilChr08G000589 |
Chr08 | NC_080394.1:4389614-4389628promoter 内 418-432 bp |
- | 3569 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 4384753-4386045(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CCGCATCCACCGCGA |
SmilChr02G000094 |
Chr02 | NC_080388.1:1237846-1237860promoter 内 404-418 bp |
- | 3583 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 1230404-1234263(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CAGCCACCACCGCAG |
SmilChr01G002864 |
Chr01 | NC_080387.1:47233055-47233069promoter 内 398-412 bp |
- | 3589 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 47228093-47229466(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
GCTCGGCCACCGCCC |
SmilChr02G001048 |
Chr02 | NC_080388.1:18537439-18537453promoter 内 350-364 bp |
- | 3637 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 18541090-18542998(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGGCGGTGGTCGACG |
SmilChr01G000913 |
Chr01 | NC_080387.1:19342279-19342293promoter 内 320-334 bp |
- | 3667 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 19345960-19346615(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGGCGGTGGGGGTTC |
SmilChr05G003961 |
Chr05 | NC_080391.1:53337316-53337330promoter 内 290-304 bp |
- | 3697 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 53341027-53349369(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
GGGCGGTGGCGGGTT |
SmilChr01G003885 |
Chr01 | NC_080387.1:57164420-57164434promoter 内 284-298 bp |
- | 3703 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 57168137-57170921(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TGGCGGTGGTGGACT |
SmilChr07G003448 |
Chr07 | NC_080393.1:38370748-38370762promoter 内 272-286 bp |
+ | 3715 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 38374477-38377729(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CCACCTCCACCGTGA |
SmilChr02G001662 |
Chr02 | NC_080388.1:30845353-30845367promoter 内 268-282 bp |
+ | 3719 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 30849086-30851629(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
GCTTGGCCACCGCCG |
SmilChr01G000615 |
Chr01 | NC_080387.1:13567882-13567896promoter 内 239-253 bp |
+ | 3748 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 13571644-13579885(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGGCCTCCACCGCGA |
SmilChr04G003403 |
Chr04 | NC_080390.1:50601319-50601333promoter 内 221-235 bp |
- | 3766 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 50605099-50605566(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGGCGGTGAAGGTGT |
SmilChr04G001891 |
Chr04 | NC_080390.1:30877129-30877143promoter 内 192-206 bp |
- | 3795 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 30880938-30891666(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGGCGGTGGTGCCAC |
SmilChr01G003650 |
Chr01 | NC_080387.1:54959512-54959526promoter 内 180-194 bp |
- | 3807 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 54963333-54970778(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGGCGGAGGAGGTGG |
SmilChr03G002153 |
Chr03 | NC_080389.1:33490143-33490157promoter 内 171-185 bp |
- | 3816 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 33483435-33486327(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CAGGCACCACCGCCC |
SmilChr02G003932 |
Chr02 | NC_080388.1:61408282-61408296promoter 内 165-179 bp |
- | 3822 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 61403860-61404460(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TCTGAGCCACCGCCA |
SmilChr03G000720 |
Chr03 | NC_080389.1:8057798-8057812promoter 内 148-162 bp |
- | 3839 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 8061651-8063327(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGGCGGTGGTGCCAC |
SmilChr04G001883 |
Chr04 | NC_080390.1:30778447-30778461promoter 内 137-151 bp |
- | 3850 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 30782311-30793000(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGGCGGTGGTGCCAC |
SmilChr03G003181 |
Chr03 | NC_080389.1:49268452-49268466promoter 内 107-121 bp |
- | 3880 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 49262696-49264572(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CAACTTCCACCGCTG |
SmilChr06G000267 |
Chr06 | NC_080392.1:1813102-1813116promoter 内 3580-3594 bp |
- | 407 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 4 | 1810106-1812695(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CTCTCTCCACCGCCC |
SmilChr08G003180 |
Chr08 | NC_080394.1:32522051-32522065promoter 内 2585-2599 bp |
- | 1402 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 3 | 32514703-32520649(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TCAGATCCACCGCCG |
SmilChr03G004355 |
Chr03 | NC_080389.1:61769611-61769625promoter 内 646-660 bp |
- | 3341 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 3 | 61772966-61776806(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TGGCGGTGATGATGG |
SmilChr03G004356 |
Chr03 | NC_080389.1:61769611-61769625promoter 内 615-629 bp |
- | 3372 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 3 | 61772997-61773938(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TGGCGGTGATGATGG |
SmilChr07G001030 |
Chr07 | NC_080393.1:7522312-7522326promoter 内 3160-3174 bp |
- | 827 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 2 | 7520520-7521485(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TCAGATCCACCGCCG |
SmilChr08G001628 |
Chr08 | NC_080394.1:13473811-13473825promoter 内 1620-1634 bp |
- | 2367 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 2 | 13476192-13477889(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGGCGGTGCCGCCGA |
SmilChr07G001582 |
Chr07 | NC_080393.1:13026536-13026550promoter 内 197-211 bp |
+ | 3790 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 2 | 13030340-13032589(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CATCCTCCACCACCG |
SmilChr08G003380 |
Chr08 | NC_080394.1:35444311-35444325promoter 内 3878-3892 bp |
- | 109 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 35444434-35454844(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
GGGCGGTGGAGAGAG |
SmilChr08G003959 |
Chr08 | NC_080394.1:47466158-47466172promoter 内 3802-3816 bp |
+ | 185 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 47466357-47468016(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TCGCCACCACCGCGG |
SmilChr02G004298 |
Chr02 | NC_080388.1:65348231-65348245promoter 内 3749-3763 bp |
+ | 238 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 65344753-65347993(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
GGGCGGTGGAGAGAG |
SmilChr05G000508 |
Chr05 | NC_080391.1:3932734-3932748promoter 内 3648-3662 bp |
- | 339 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 3933087-3933249(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
CGGCGGTGGCTCTGT |
SmilChr07G002297 |
Chr07 | NC_080393.1:21265201-21265215promoter 内 3634-3648 bp |
- | 353 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 21265568-21273929(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TGGCGGTGGTCGACG |
SmilChr02G001899 |
Chr02 | NC_080388.1:34279763-34279777promoter 内 3617-3631 bp |
+ | 370 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 34280147-34282700(+) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
TCAGATCCACCGCCG |
SmilChr04G001829 |
Chr04 | NC_080390.1:29821313-29821327promoter 内 3613-3627 bp |
+ | 374 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 29818404-29820939(-) |
SMil_00009551-RA_Salv |
MP00240 |
GGGCGGTGGAGAGAG |