Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001961; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001298-RA_Salv SmilChr05G001961 MIKC_MADS XP_057766054.1 MP00077 TTCCAAAAATGGAAA

可能结合的靶基因

9815 个结合位点 6125 个候选靶基因 第 117 / 123 下载 TSV

上一页 117 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001455 Chr02 NC_080388.1:27222152-27222166promoter 内 3165-3179 bp - 822 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 27222988-27224878(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TATCCATTTCTAGTG
SmilChr01G004180 Chr01 NC_080387.1:60253553-60253567promoter 内 3162-3176 bp - 825 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 60242014-60252728(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 GGCCAAAAAAGGTTG
SmilChr01G001185 Chr01 NC_080387.1:23966549-23966563promoter 内 3124-3138 bp - 863 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 23967426-23968862(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TTATCATTTTTGGTC
SmilChr01G002092 Chr01 NC_080387.1:36938448-36938462promoter 内 3104-3118 bp - 883 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 36939345-36943434(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 AGTCCATTTGGGGTG
SmilChr02G001784 Chr02 NC_080388.1:32611440-32611454promoter 内 3102-3116 bp + 885 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 32612339-32619547(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TGATAAAAATGGAGA
SmilChr01G000008 Chr01 NC_080387.1:175432-175446promoter 内 3078-3092 bp + 909 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 170625-174523(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 GAGCTCCTTTTGGAT
SmilChr02G000359 Chr02 NC_080388.1:4634345-4634359promoter 内 3016-3030 bp + 971 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 4635330-4640870(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 CACCAAAAATCGAAG
SmilChr02G004261 Chr02 NC_080388.1:64820420-64820434promoter 内 3009-3023 bp + 978 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 64821412-64823701(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TCCCAAAAAGAAAAA
SmilChr01G003854 Chr01 NC_080387.1:56816002-56816016promoter 内 2923-2937 bp + 1064 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 56817080-56818981(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 CCCCAAAAATAGGCA
SmilChr02G000005 Chr02 NC_080388.1:40344-40358promoter 内 2890-2904 bp + 1097 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 34537-39247(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TGCCTATTTTTGGGG
SmilChr02G004644 Chr02 NC_080388.1:68881825-68881839promoter 内 2875-2889 bp + 1112 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 68878194-68880713(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TACCTATTTTTGGAC
SmilChr02G002334 Chr02 NC_080388.1:41036686-41036700promoter 内 2759-2773 bp - 1228 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 41031885-41035458(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 CCCCAAAAATAGGCA
SmilChr02G002638 Chr02 NC_080388.1:45778076-45778090promoter 内 2757-2771 bp + 1230 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 45779320-45788747(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 CTCCAAAAAGAAAAA
SmilChr01G002497 Chr01 NC_080387.1:42785891-42785905promoter 内 2754-2768 bp + 1233 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 42787138-42790359(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 ACCCAAAAAAAAAAA
SmilChr01G001010 Chr01 NC_080387.1:21233889-21233903promoter 内 2752-2766 bp - 1235 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 21227796-21232654(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 ATACAAAAATGGGAG
SmilChr01G001467 Chr01 NC_080387.1:28460064-28460078promoter 内 2747-2761 bp - 1240 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 28456924-28458824(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 CACCAAAAAAAAAAA
SmilChr02G002143 Chr02 NC_080388.1:38551959-38551973promoter 内 2734-2748 bp + 1253 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 38546809-38550706(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TGCCTATTTTTGGGG
SmilChr01G000560 Chr01 NC_080387.1:11659645-11659659promoter 内 2667-2681 bp - 1320 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 11649337-11658325(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 ACCCAAAAAAAAAAA
SmilChr02G003864 Chr02 NC_080388.1:60603293-60603307promoter 内 2665-2679 bp - 1322 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 60604629-60606214(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TTTTTCTTTTTGGGA
SmilChr01G003322 Chr01 NC_080387.1:51924401-51924415promoter 内 2662-2676 bp - 1325 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 51920813-51923076(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 AGCTAAAAATGAAAA
SmilChr01G000896 Chr01 NC_080387.1:19005898-19005912promoter 内 2635-2649 bp + 1352 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 19007264-19008454(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 CCCCAAAAATAGGCA
SmilChr01G004402 Chr01 NC_080387.1:62135156-62135170promoter 内 2620-2634 bp - 1367 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 62136537-62138406(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 GTTCCATTTTCAGGA
SmilChr01G003035 Chr01 NC_080387.1:49370214-49370228promoter 内 2605-2619 bp + 1382 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 49371610-49374044(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TACTAAAAATGGCTT
SmilChr02G002173 Chr02 NC_080388.1:38957968-38957982promoter 内 2580-2594 bp + 1407 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 38956013-38956561(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TGCCTATTTTTGGGG
SmilChr01G000487 Chr01 NC_080387.1:9944869-9944883promoter 内 2506-2520 bp - 1481 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 9942587-9943388(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 GTCCAAAAATAGGTA
SmilChr02G002593 Chr02 NC_080388.1:45077599-45077613promoter 内 2476-2490 bp + 1511 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 45079124-45088662(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 CTCCAAAAAGAAAAA
SmilChr02G000900 Chr02 NC_080388.1:15462906-15462920promoter 内 2463-2477 bp - 1524 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 15464444-15466622(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TTGTTTTTTTTGGAG
SmilChr02G004464 Chr02 NC_080388.1:67056916-67056930promoter 内 2442-2456 bp + 1545 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 67058475-67063551(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 CACCAAAAAAAAAAA
SmilChr01G005767 Chr01 NC_080387.1:73753802-73753816promoter 内 2405-2419 bp - 1582 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 73755398-73759578(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 GTGCTATTTTTGTGA
SmilChr01G005856 Chr01 NC_080387.1:74490067-74490081promoter 内 2402-2416 bp - 1585 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 74491666-74497993(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TTTCCATATAGAGTC
SmilChr02G001271 Chr02 NC_080388.1:23268129-23268143promoter 内 2392-2406 bp + 1595 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 23269738-23271189(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 GTCCAAAAATAGGTA
SmilChr01G003499 Chr01 NC_080387.1:53592000-53592014promoter 内 2339-2353 bp - 1648 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 53588664-53590352(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 GTCCAAAAATAGGTA
SmilChr01G000937 Chr01 NC_080387.1:19847388-19847402promoter 内 2334-2348 bp - 1653 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 19844941-19845735(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TCCCAAAAAAGAAAG
SmilChr01G001068 Chr01 NC_080387.1:22027791-22027805promoter 内 2334-2348 bp + 1653 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 22024948-22026138(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 CTTCCATTTTTATAC
SmilChr01G000164 Chr01 NC_080387.1:2729480-2729494promoter 内 2329-2343 bp + 1658 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 2731152-2731907(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TCCCAAAAAAGAAAG
SmilChr02G002871 Chr02 NC_080388.1:48906929-48906943promoter 内 2322-2336 bp - 1665 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 48893646-48905264(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 CACCAAAAAAAAAAA
SmilChr02G002932 Chr02 NC_080388.1:49806003-49806017promoter 内 2309-2323 bp + 1678 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 49807695-49808444(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TCCCAAAAAGAAAAA
SmilChr01G001364 Chr01 NC_080387.1:27010406-27010420promoter 内 2297-2311 bp + 1690 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 27012110-27014449(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 CACCAAAAAAAAAAA
SmilChr02G004615 Chr02 NC_080388.1:68663288-68663302promoter 内 2292-2306 bp - 1695 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 68664997-68666698(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TACCTATTTTTGGAC
SmilChr02G004357 Chr02 NC_080388.1:65864353-65864367promoter 内 2291-2305 bp - 1696 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 65866063-65868588(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TGCCTATTTTTGGGG
SmilChr01G004762 Chr01 NC_080387.1:65800484-65800498promoter 内 2273-2287 bp - 1714 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 65797080-65798770(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 GACCCAAAATGGGAT
SmilChr01G001843 Chr01 NC_080387.1:33372421-33372435promoter 内 2271-2285 bp - 1716 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 33369833-33370705(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 CACCAAAAAAAAAAA
SmilChr02G001165 Chr02 NC_080388.1:21298414-21298428promoter 内 2265-2279 bp - 1722 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 21300150-21300222(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TGCCTATTTTTGGGG
SmilChr01G001496 Chr01 NC_080387.1:28808214-28808228promoter 内 2241-2255 bp - 1746 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 28809974-28814378(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TACCTATTTTTGGAC
SmilChr03G001125 Chr03 NC_080389.1:12950779-12950793promoter 内 2229-2243 bp + 1758 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 12952551-12958573(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TCCCAAAAAAGAAAG
SmilChr02G001960 Chr02 NC_080388.1:35389204-35389218promoter 内 2209-2223 bp + 1778 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 35386959-35387426(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 GTGCTATTTTTGTGA
SmilChr01G003989 Chr01 NC_080387.1:58312382-58312396promoter 内 2176-2190 bp + 1811 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 58314207-58315187(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 GTCCAAAAATAGGTA
SmilChr02G002751 Chr02 NC_080388.1:47535106-47535120promoter 内 2143-2157 bp - 1844 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 47536964-47538247(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TTTTTTTTTTTGGGT
SmilChr02G004481 Chr02 NC_080388.1:67273643-67273657promoter 内 2132-2146 bp - 1855 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 67268535-67271788(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 CACCAAAAAAAAAAA
SmilChr02G000083 Chr02 NC_080388.1:1092981-1092995promoter 内 2117-2131 bp + 1870 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 1094865-1096786(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TGATAAAAATGGAGA