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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023584-RA_Salv SmilChr05G001518 WRKY XP_057765511.1 MP00455 AACGTTGACTATT

可能结合的靶基因

9792 个结合位点 6900 个候选靶基因 第 121 / 138 下载 TSV

上一页 121 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005575 Chr01 NC_080387.1:72495483-72495495promoter 内 3855-3867 bp - 134 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 72490210-72495349(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCATTGACTAAT
SmilChr01G005716 Chr01 NC_080387.1:73366017-73366029promoter 内 3800-3812 bp + 189 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 73366218-73368088(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACATTTGACTAGA
SmilChr03G001055 Chr03 NC_080389.1:12259349-12259361promoter 内 3699-3711 bp - 290 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 12255155-12259059(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCATTTGACTATT
SmilChr01G005933 Chr01 NC_080387.1:75094974-75094986promoter 内 3644-3656 bp - 345 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 75095331-75098085(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCAAGTCAACTAG
SmilChr01G002706 Chr01 NC_080387.1:45343217-45343229promoter 内 3639-3651 bp - 350 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 45324190-45342867(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATTTTGACTATC
SmilChr02G005602 Chr02 NC_080388.1:75735855-75735867promoter 内 3578-3590 bp - 411 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 75732133-75735444(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACATTTGACTAGA
SmilChr02G002767 Chr02 NC_080388.1:47728109-47728121promoter 内 3535-3547 bp + 454 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 47728575-47730018(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTGTTGACTCTA
SmilChr02G005603 Chr02 NC_080388.1:75735855-75735867promoter 内 3503-3515 bp - 486 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 75736353-75739430(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCTAGTCAAATGT
SmilChr03G003903 Chr03 NC_080389.1:58133236-58133248promoter 内 3482-3494 bp + 507 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 58131016-58132729(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGTAGTCAAAAGT
SmilChr03G004372 Chr03 NC_080389.1:61916969-61916981promoter 内 3481-3493 bp + 508 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 61917489-61921201(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCATTGACTAAT
SmilChr01G005043 Chr01 NC_080387.1:68354642-68354654promoter 内 3476-3488 bp - 513 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 68355167-68358570(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAATCA
SmilChr02G000375 Chr02 NC_080388.1:4749390-4749402promoter 内 3460-3472 bp + 529 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 4745987-4748861(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATAGTCAAAATT
SmilChr01G002555 Chr01 NC_080387.1:43678137-43678149promoter 内 3459-3471 bp + 530 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 43673972-43677607(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATAGTCAAAATT
SmilChr03G001290 Chr03 NC_080389.1:15119510-15119522promoter 内 3441-3453 bp + 548 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 15120070-15122155(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCATTGACTAAT
SmilChr01G000592 Chr01 NC_080387.1:12904841-12904853promoter 内 3385-3397 bp + 604 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 12901654-12904237(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGTAGTCAACTGA
SmilChr03G004058 Chr03 NC_080389.1:59536610-59536622promoter 内 3289-3301 bp - 700 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 59537322-59538837(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAATCA
SmilChr01G001178 Chr01 NC_080387.1:23830237-23830249promoter 内 3266-3278 bp + 723 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 23827198-23829514(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCAGTCAACTAT
SmilChr02G003927 Chr02 NC_080388.1:61345362-61345374promoter 内 3258-3270 bp - 731 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 61346105-61348946(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAGGTC
SmilChr02G002775 Chr02 NC_080388.1:47813729-47813741promoter 内 3222-3234 bp - 767 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 47814508-47817471(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGTAGTCAACTAT
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SmilChr01G002707 Chr01 NC_080387.1:45343217-45343229promoter 内 3029-3041 bp - 960 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 45344189-45344260(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATAGTCAAAATT
SmilChr03G001325 Chr03 NC_080389.1:15516408-15516420promoter 内 3029-3041 bp - 960 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 15517380-15519261(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATAGTCAAAATT
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SmilChr01G004561 Chr01 NC_080387.1:63683518-63683530promoter 内 2876-2888 bp + 1113 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 63684643-63685569(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCATTTGACTATG
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SmilChr01G006012 Chr01 NC_080387.1:75697043-75697055promoter 内 2743-2755 bp - 1246 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 75698301-75699155(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAATGA
SmilChr02G005282 Chr02 NC_080388.1:73863213-73863225promoter 内 2728-2740 bp + 1261 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 73859527-73861952(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAATGA
SmilChr01G003389 Chr01 NC_080387.1:52584346-52584358promoter 内 2662-2674 bp + 1327 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 52579152-52583019(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGTAGTCAAAAGT
SmilChr02G003323 Chr02 NC_080388.1:54486858-54486870promoter 内 2620-2632 bp + 1369 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 54484798-54485489(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTAAGTCAACTTA
SmilChr01G004224 Chr01 NC_080387.1:60606081-60606093promoter 内 2577-2589 bp + 1412 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 60602872-60604669(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTAGTCAACTTA
SmilChr03G001676 Chr03 NC_080389.1:22022258-22022270promoter 内 2573-2585 bp - 1416 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 22018321-22020842(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCCTTGACTAGT
SmilChr02G002828 Chr02 NC_080388.1:48387076-48387088promoter 内 2539-2551 bp + 1450 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 48378626-48385626(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCTAGTCAATGCA
SmilChr02G004616 Chr02 NC_080388.1:68679359-68679371promoter 内 2475-2487 bp + 1514 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 68672190-68677845(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAATGA
SmilChr03G003857 Chr03 NC_080389.1:57666814-57666826promoter 内 2295-2307 bp - 1694 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 57660289-57665120(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTTTTGACTACT
SmilChr01G005475 Chr01 NC_080387.1:71742329-71742341promoter 内 2272-2284 bp - 1717 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 71734846-71740612(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTTTTGACTAGG
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SmilChr01G001405 Chr01 NC_080387.1:27669874-27669886promoter 内 2180-2192 bp - 1809 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 27662126-27668065(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCTTTTGACTAAG
SmilChr03G001985 Chr03 NC_080389.1:29031620-29031632promoter 内 2179-2191 bp - 1810 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 29033442-29034056(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAGGTC
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SmilChr01G004254 Chr01 NC_080387.1:60825517-60825529promoter 内 2080-2092 bp - 1909 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 60827438-60828265(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAATCA
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SmilChr01G000037 Chr01 NC_080387.1:602140-602152promoter 内 1840-1852 bp - 2149 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 604301-606337(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAATCA
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SmilChr01G001313 Chr01 NC_080387.1:26111827-26111839promoter 内 1758-1770 bp + 2231 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 26102816-26109596(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATAGTCAAATCT
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SmilChr03G000303 Chr03 NC_080389.1:3455524-3455536promoter 内 1728-1740 bp + 2261 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 3457797-3463241(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATTTTGACTATC
SmilChr01G003276 Chr01 NC_080387.1:51469008-51469020promoter 内 1704-1716 bp + 2285 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 51463545-51466723(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTTAGTCAATGGA