转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G005851; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011948-RA_Salv SmilChr01G005851 MYB XP_057789306.1 MP00055 CAGATAAGGT

可能结合的靶基因

9685 个结合位点 6638 个候选靶基因 第 122 / 133 下载 TSV

上一页 122 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G006078 Chr01 NC_080387.1:76227112-76227121promoter 内 3848-3857 bp - 144 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 76221765-76226968(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AAGATAAGCG
SmilChr02G005220 Chr02 NC_080388.1:73406838-73406847promoter 内 3842-3851 bp - 150 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 73404859-73406688(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGTT
SmilChr01G001589 Chr01 NC_080387.1:29919436-29919445promoter 内 3832-3841 bp - 160 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 29915355-29919276(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGTG
SmilChr01G000075 Chr01 NC_080387.1:1324012-1324021promoter 内 3830-3839 bp + 162 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 1320766-1323850(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CGCTTATCTT
SmilChr01G002357 Chr01 NC_080387.1:40755254-40755263promoter 内 3825-3834 bp - 167 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 40743682-40755087(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGTT
SmilChr02G000092 Chr02 NC_080388.1:1203995-1204004promoter 内 3820-3829 bp + 172 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 1204176-1206430(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGAT
SmilChr02G003549 Chr02 NC_080388.1:56631623-56631632promoter 内 3814-3823 bp + 178 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 56628840-56631445(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTT
SmilChr02G004281 Chr02 NC_080388.1:65053539-65053548promoter 内 3810-3819 bp - 182 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 65053730-65054651(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TGCTTATCTC
SmilChr02G002746 Chr02 NC_080388.1:47444536-47444545promoter 内 3794-3803 bp + 198 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 47442827-47444338(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TGCTTATCTC
SmilChr01G001365 Chr01 NC_080387.1:27023201-27023210promoter 内 3779-3788 bp - 213 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 27023423-27025072(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CTCTTATCTC
SmilChr01G006195 Chr01 NC_080387.1:77564386-77564395promoter 内 3765-3774 bp - 227 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 77555537-77564159(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGAT
SmilChr01G004279 Chr01 NC_080387.1:61012214-61012223promoter 内 3720-3729 bp - 272 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 61009073-61011942(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AAGATAAGCG
SmilChr01G004455 Chr01 NC_080387.1:62672181-62672190promoter 内 3667-3676 bp - 325 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 62668522-62671856(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGTG
SmilChr02G003743 Chr02 NC_080388.1:59091187-59091196promoter 内 3634-3643 bp - 358 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 59091554-59091625(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CACTTATCTC
SmilChr01G003867 Chr01 NC_080387.1:56917069-56917078promoter 内 3613-3622 bp + 379 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 56913994-56916690(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTC
SmilChr02G001163 Chr02 NC_080388.1:21221436-21221445promoter 内 3613-3622 bp - 379 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 21213127-21221057(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGTT
SmilChr02G001553 Chr02 NC_080388.1:28834619-28834628promoter 内 3610-3619 bp - 382 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 28829532-28834237(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AAGATAAGCT
SmilChr01G000692 Chr01 NC_080387.1:15536681-15536690promoter 内 3608-3617 bp + 384 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 15537074-15537938(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGAT
SmilChr01G004340 Chr01 NC_080387.1:61577552-61577561promoter 内 3596-3605 bp + 396 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 61577957-61579945(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGTT
SmilChr01G004690 Chr01 NC_080387.1:64954188-64954197promoter 内 3596-3605 bp + 396 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 64934331-64953792(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTC
SmilChr03G001044 Chr03 NC_080389.1:12161000-12161009promoter 内 3587-3596 bp - 405 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 12161414-12166396(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTT
SmilChr02G002393 Chr02 NC_080388.1:41840066-41840075promoter 内 3576-3585 bp + 416 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 41838295-41839650(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 TGCTTATCTC
SmilChr01G001504 Chr01 NC_080387.1:28880038-28880047promoter 内 3572-3581 bp + 420 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 28876833-28879618(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTT
SmilChr02G001196 Chr02 NC_080388.1:22006565-22006574promoter 内 3542-3551 bp - 450 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 22007024-22012627(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AACTTATCTC
SmilChr03G001070 Chr03 NC_080389.1:12404276-12404285promoter 内 3540-3549 bp + 452 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 12402708-12403824(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTC
SmilChr02G001616 Chr02 NC_080388.1:30100961-30100970promoter 内 3532-3541 bp + 460 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 30099530-30100501(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTC
SmilChr02G005485 Chr02 NC_080388.1:75046155-75046164promoter 内 3532-3541 bp - 460 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 75044541-75045695(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AAGATAAGCT
SmilChr01G000221 Chr01 NC_080387.1:3868743-3868752promoter 内 3522-3531 bp - 470 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 3866939-3868273(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGAG
SmilChr02G000337 Chr02 NC_080388.1:4306212-4306221promoter 内 3493-3502 bp - 499 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 4304631-4305713(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGAT
SmilChr01G001026 Chr01 NC_080387.1:21413007-21413016promoter 内 3474-3483 bp + 518 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 21412190-21412489(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AACTTATCTC
SmilChr01G004397 Chr01 NC_080387.1:62115172-62115181promoter 内 3473-3482 bp + 519 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 62115700-62117532(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AAGATAAGCG
SmilChr02G005533 Chr02 NC_080388.1:75375759-75375768promoter 内 3472-3481 bp + 520 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 75370224-75375239(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AACTTATCTC
SmilChr01G001753 Chr01 NC_080387.1:32257160-32257169promoter 内 3462-3471 bp + 530 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 32254613-32256630(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTT
SmilChr01G001810 Chr01 NC_080387.1:33035469-33035478promoter 内 3459-3468 bp + 533 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 33033903-33034936(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTC
SmilChr01G003118 Chr01 NC_080387.1:49989649-49989658promoter 内 3458-3467 bp - 534 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 49990192-49990330(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CTCTTATCTC
SmilChr01G002405 Chr01 NC_080387.1:41411734-41411743promoter 内 3457-3466 bp + 535 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 41411060-41411199(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CTCTTATCTC
SmilChr01G003380 Chr01 NC_080387.1:52489015-52489024promoter 内 3456-3465 bp + 536 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 52489560-52494862(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGAG
SmilChr03G001025 Chr03 NC_080389.1:11912358-11912367promoter 内 3449-3458 bp - 543 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 11910604-11911815(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGAG
SmilChr02G001918 Chr02 NC_080388.1:35139735-35139744promoter 内 3442-3451 bp + 550 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 34532972-35139185(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTC
SmilChr02G001227 Chr02 NC_080388.1:22549276-22549285promoter 内 3436-3445 bp - 556 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 22547755-22548720(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AAGATAAGCT
SmilChr01G001892 Chr01 NC_080387.1:34039990-34039999promoter 内 3428-3437 bp + 564 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 34040563-34041389(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AAGATAAGCT
SmilChr02G001594 Chr02 NC_080388.1:29709803-29709812promoter 内 3422-3431 bp + 570 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 29710382-29711865(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGTG
SmilChr01G003698 Chr01 NC_080387.1:55355183-55355192promoter 内 3405-3414 bp + 587 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 55353220-55354596(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AACTTATCTC
SmilChr01G003140 Chr01 NC_080387.1:50233431-50233440promoter 内 3403-3412 bp - 589 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 50234029-50239713(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTT
SmilChr03G000984 Chr03 NC_080389.1:11147990-11147999promoter 内 3398-3407 bp - 594 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 11148593-11149969(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AACTTATCTC
SmilChr02G001485 Chr02 NC_080388.1:27835097-27835106promoter 内 3392-3401 bp + 600 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 27833629-27834497(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTC
SmilChr02G001083 Chr02 NC_080388.1:19385583-19385592promoter 内 3381-3390 bp + 611 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 19386203-19392105(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGAT
SmilChr02G002551 Chr02 NC_080388.1:44395802-44395811promoter 内 3370-3379 bp - 622 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 44396433-44400493(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AACTTATCTC
SmilChr02G002665 Chr02 NC_080388.1:46147831-46147840promoter 内 3369-3378 bp + 623 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 46148463-46150262(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGTT
SmilChr01G003339 Chr01 NC_080387.1:52137192-52137201promoter 内 3341-3350 bp - 651 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 52135124-52136541(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 GAGATAAGAG