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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 126 / 151 下载 TSV

上一页 126 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000162 Chr01 NC_080387.1:2701625-2701637promoter 内 3755-3767 bp + 234 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 2701871-2702522(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTATTCTT
SmilChr04G003033 Chr04 NC_080390.1:46777163-46777175promoter 内 3529-3541 bp + 460 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 46777635-46778045(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTATCTGC
SmilChr01G004407 Chr01 NC_080387.1:62163510-62163522promoter 内 3426-3438 bp - 563 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 62164085-62166532(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGGGAGGTAAA
SmilChr05G001394 Chr05 NC_080391.1:12509319-12509331promoter 内 3426-3438 bp + 563 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 12509894-12510662(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGTACCTACATAT
SmilChr03G001971 Chr03 NC_080389.1:28412284-28412296promoter 内 3417-3429 bp + 572 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 28412868-28414304(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAATGTA
SmilChr05G001085 Chr05 NC_080391.1:9024984-9024996promoter 内 3319-3331 bp + 670 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 9025666-9036993(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTATTCCT
SmilChr01G001041 Chr01 NC_080387.1:21642821-21642833promoter 内 3264-3276 bp - 725 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 21637958-21642096(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTGCCTACCTAA
SmilChr01G000395 Chr01 NC_080387.1:8117217-8117229promoter 内 3256-3268 bp - 733 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 8117962-8120106(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGTTTAGGTAAC
SmilChr01G002162 Chr01 NC_080387.1:37628806-37628818promoter 内 3140-3152 bp + 849 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 37629667-37631655(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATACCTACTAAA
SmilChr04G001429 Chr04 NC_080390.1:23272645-23272657promoter 内 3048-3060 bp - 941 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 23267537-23271704(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAATGCA
SmilChr03G003403 Chr03 NC_080389.1:52405557-52405569promoter 内 2886-2898 bp + 1103 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 52400849-52404454(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACATTAGGTAAT
SmilChr03G003978 Chr03 NC_080389.1:58798506-58798518promoter 内 2761-2773 bp + 1228 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 58799746-58811854(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATACCTACTAAA
SmilChr03G003050 Chr03 NC_080389.1:47399318-47399330promoter 内 2694-2706 bp + 1295 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 47393487-47398023(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGGAATAGGTAAG
SmilChr01G005180 Chr01 NC_080387.1:69522219-69522231promoter 内 2683-2695 bp + 1306 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 69523537-69526664(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAATGTA
SmilChr04G003626 Chr04 NC_080390.1:52743175-52743187promoter 内 2667-2679 bp + 1322 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 52744509-52747697(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGAACCTACCAAT
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SmilChr02G001094 Chr02 NC_080388.1:19739405-19739417promoter 内 2278-2290 bp + 1711 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 19735577-19737694(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCTTTAGGTAAA
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SmilChr05G001422 Chr05 NC_080391.1:12900024-12900036promoter 内 1975-1987 bp - 2014 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 12902050-12908325(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGGAATAGGTAAG
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SmilChr03G002836 Chr03 NC_080389.1:44874623-44874635promoter 内 1394-1406 bp + 2595 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 44869156-44872028(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGTAGGAGGTAAA
SmilChr01G000329 Chr01 NC_080387.1:6721355-6721367promoter 内 1375-1387 bp - 2614 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 6723981-6724799(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCAGATAGGTAAA
SmilChr01G003753 Chr01 NC_080387.1:55908002-55908014promoter 内 1254-1266 bp + 2735 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 55910749-55913422(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACAGGC
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SmilChr01G002457 Chr01 NC_080387.1:42182512-42182524promoter 内 919-931 bp - 3070 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 42185594-42186616(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCAGATAGGTAAA
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SmilChr01G003964 Chr01 NC_080387.1:58062173-58062185promoter 内 492-504 bp + 3497 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 58065682-58068856(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTATCCCG
SmilChr03G001972 Chr03 NC_080389.1:28412284-28412296promoter 内 330-342 bp + 3659 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 28415955-28416551(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAATGTA
SmilChr01G003537 Chr01 NC_080387.1:53999091-53999103promoter 内 280-292 bp - 3709 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 53991101-53995382(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTATTCTT
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SmilChr04G003929 Chr04 NC_080390.1:54950361-54950373promoter 内 3924-3936 bp - 65 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 54950438-54951426(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGCGCG
SmilChr03G003620 Chr03 NC_080389.1:54860292-54860304promoter 内 3469-3481 bp + 520 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 54858763-54859772(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAGAATAGGTAAA
SmilChr03G001817 Chr03 NC_080389.1:24840794-24840806promoter 内 3440-3452 bp + 549 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 24837738-24840245(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACAAGTAGGTATA
SmilChr05G000267 Chr05 NC_080391.1:2030061-2030073promoter 内 3279-3291 bp + 710 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 2030783-2033065(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAATAGT
SmilChr04G000184 Chr04 NC_080390.1:1629824-1629836promoter 内 1970-1982 bp + 2019 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 1631855-1635735(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATAACCTACCATA
SmilChr02G005312 Chr02 NC_080388.1:74010974-74010986promoter 内 1548-1560 bp + 2441 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 74013427-74014978(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTAAAGTT
SmilChr03G003991 Chr03 NC_080389.1:58950109-58950121promoter 内 1144-1156 bp + 2845 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 58952966-58956547(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAATAG
SmilChr02G001647 Chr02 NC_080388.1:30573075-30573087promoter 内 476-488 bp - 3513 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 30568957-30569562(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAAACCTACCTTC
SmilChr01G000990 Chr01 NC_080387.1:20902254-20902266promoter 内 421-433 bp - 3568 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 20894555-20898686(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTACCTACAATC
SmilChr04G003928 Chr04 NC_080390.1:54950361-54950373promoter 内 3967-3979 bp - 22 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 54942327-54950339(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGCGCCTACCTCT
SmilChr05G001838 Chr05 NC_080391.1:18408710-18408722promoter 内 3899-3911 bp - 90 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 18403456-18408620(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACATCT