靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。
下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。
| 转录因子 ID | Family | Motifs | 候选靶基因 | 候选位点 | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| ARR-B | 1MP00010 |
8344 | 9778 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00059 |
8333 | 9940 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00296 |
8304 | 9873 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00114 |
8151 | 9897 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00408 |
8149 | 9902 | 查靶基因 | |
| Nin-like | 1MP00449 |
8096 | 9453 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00209 |
8083 | 9910 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00627 |
8075 | 9835 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00450 |
8044 | 9901 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00558 |
8044 | 9762 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00096 |
8019 | 9914 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00476 |
7981 | 9904 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00221 |
7965 | 9903 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00069 |
7882 | 9917 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00406 |
7839 | 9917 | 查靶基因 | |
| TALE | 1MP00670 |
7758 | 9906 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00555 |
7648 | 9805 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00021 |
7629 | 9812 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00132 |
7583 | 9926 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00609 |
7575 | 9941 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00529 |
7559 | 9247 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00510 |
7526 | 9799 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00058 |
7440 | 9855 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00303 |
7416 | 9868 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00565 |
7412 | 9785 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00026 |
7408 | 9854 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00071 |
7408 | 9764 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00033 |
7406 | 9827 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00074 |
7396 | 9969 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00216 |
7342 | 9832 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00539 |
7338 | 9848 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00574 |
7302 | 9846 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00464 |
7299 | 9864 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00315 |
7291 | 9567 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00525 |
7235 | 9838 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00171 |
7182 | 9833 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00506 |
7173 | 9818 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00272 |
7172 | 9889 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00184 |
7147 | 9840 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00647 |
7133 | 9953 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00485 |
7130 | 8059 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00134 |
7078 | 8676 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00312 |
7006 | 8490 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00564 |
6984 | 9893 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00022 |
6959 | 9720 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00040 |
6920 | 9919 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00151 |
6907 | 9976 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00455 |
6900 | 9792 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00482 |
6899 | 8940 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00291 |
6894 | 9321 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00307 |
6893 | 9755 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00195 |
6878 | 9832 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00388 |
6870 | 9774 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00318 |
6849 | 9413 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00633 |
6833 | 8026 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00308 |
6805 | 9826 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00082 |
6784 | 9435 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00080 |
6766 | 9850 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00028 |
6764 | 9024 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00191 |
6736 | 9690 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00081 |
6729 | 9942 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00500 |
6697 | 9681 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00452 |
6671 | 7783 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00531 |
6663 | 9784 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00200 |
6661 | 9930 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00034 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00660 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00055 |
6638 | 9685 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00634 |
6619 | 7771 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00035 |
6618 | 9903 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00568 |
6611 | 9696 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00039 |
6610 | 9936 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00284 |
6552 | 9774 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00422 |
6535 | 9791 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00153 |
6534 | 9706 | 查靶基因 | |
| YABBY | 1MP00620 |
6504 | 9844 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00169 |
6498 | 7295 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00252 |
6478 | 9780 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00108 |
6458 | 9810 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00062 |
6454 | 7249 | 查靶基因 | |
| RAV | 1MP00024 |
6450 | 9853 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00167 |
6439 | 9756 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00416 |
6433 | 9716 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00608 |
6398 | 9817 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00240 |
6368 | 9978 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00607 |
6362 | 9718 | 查靶基因 | |
| Dof | 1MP00402 |
6278 | 9875 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00409 |
6252 | 8429 | 查靶基因 | |
| GRAS | 1MP00611 |
6232 | 9807 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00648 |
6170 | 9939 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00120 |
6144 | 7514 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00251 |
6140 | 9713 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00077 |
6125 | 9815 | 查靶基因 | |
| GATA | 1MP00130 |
6015 | 9821 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00508 |
5979 | 7481 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00260 |
5932 | 9706 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00013 |
5927 | 9712 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00299 |
5919 | 9699 | 查靶基因 |
输入: SmilChr01G004579; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90
| TF ID | 新 Gene ID | 家族 | Protein | Motif | 共识序列 |
|---|---|---|---|---|---|
SMil_00010264-RA_Salv |
SmilChr01G004579 |
MYB | XP_057787263.1 |
MP00132 |
CTTTTCCAACCACCTTTTC |
9926 个结合位点 7583 个候选靶基因 第 127 / 152 下载 TSV
| 靶基因 | 染色体 | 最佳结合位点 | 链方向 | 靶基因上游距离 | 结合可能性 | 启动子命中位点 | 基因区间 | TF | Motif | 匹配序列 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SmilChr04G001699 |
Chr04 | NC_080390.1:28087959-28087977promoter 内 525-543 bp |
- | 3458 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 28081286-28084501(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CGCCCCCAACCAAAATAAT |
SmilChr01G004126 |
Chr01 | NC_080387.1:59753169-59753187promoter 内 495-513 bp |
- | 3488 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 59756675-59758001(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
ATTAAGTTAGTTGGAACCT |
SmilChr04G001598 |
Chr04 | NC_080390.1:26633827-26633845promoter 内 440-458 bp |
- | 3543 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 26637388-26639694(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TGTGTTGTGGTTGCGGTTG |
SmilChr02G005450 |
Chr02 | NC_080388.1:74854939-74854957promoter 内 433-451 bp |
+ | 3550 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 74848273-74851389(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
GGGGCATTGGTTGGCAGGT |
SmilChr03G002075 |
Chr03 | NC_080389.1:31722608-31722626promoter 内 432-450 bp |
+ | 3551 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 31726177-31727992(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TGTTTTCAACCACCAGGAA |
SmilChr02G003904 |
Chr02 | NC_080388.1:61124175-61124193promoter 内 347-365 bp |
+ | 3636 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 61115982-61120539(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CATTTAGTAGTTGGAAACA |
SmilChr02G000344 |
Chr02 | NC_080388.1:4498615-4498633promoter 内 317-335 bp |
- | 3666 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 4492434-4494949(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CTACCGCCACCACCTCTCC |
SmilChr02G004011 |
Chr02 | NC_080388.1:62434221-62434239promoter 内 264-282 bp |
+ | 3719 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 62428456-62430502(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
AAATGTGTGGTTGAGATTG |
SmilChr04G003147 |
Chr04 | NC_080390.1:48104736-48104754promoter 内 238-256 bp |
- | 3745 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 48108499-48108571(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CGCAAATTGGTTGGAAAAA |
SmilChr05G000196 |
Chr05 | NC_080391.1:1561156-1561174promoter 内 208-226 bp |
+ | 3775 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 1556281-1557381(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
GTTATTGTGGTTGGATTTA |
SmilChr01G005279 |
Chr01 | NC_080387.1:70190846-70190864promoter 内 205-223 bp |
- | 3778 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 70194642-70199710(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CGGTTGGTTGTTGGAATGT |
SmilChr02G002924 |
Chr02 | NC_080388.1:49641284-49641302promoter 内 181-199 bp |
- | 3802 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 49645104-49649297(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
ATCCAAGTGGTTGATAAGG |
SmilChr01G002762 |
Chr01 | NC_080387.1:46023651-46023669promoter 内 160-178 bp |
- | 3823 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 46027492-46030826(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
GGAGAGGTGGTGGCGGTAG |
SmilChr05G000044 |
Chr05 | NC_080391.1:220658-220676promoter 内 141-159 bp |
+ | 3842 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 213308-216816(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CATGAAGTGGTTGTGCACT |
SmilChr01G002350 |
Chr01 | NC_080387.1:40638629-40638647promoter 内 109-127 bp |
- | 3874 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 40642521-40642628(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
AGATAAGTGGTTGTAAATC |
SmilChr05G001004 |
Chr05 | NC_080391.1:8219452-8219470promoter 内 103-121 bp |
+ | 3880 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 8209457-8215572(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
GATCGAGTGGTTGAAAGTT |
SmilChr05G000335 |
Chr05 | NC_080391.1:2501398-2501416promoter 内 24-42 bp |
+ | 3959 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 2496943-2497439(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
AAAATGATGGTTGGGAACA |
SmilChr04G003094 |
Chr04 | NC_080390.1:47566481-47566499promoter 内 2793-2811 bp |
- | 1190 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 3 | 47567689-47567760(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
GTGATTGTGGTTGAATTGA |
SmilChr04G003095 |
Chr04 | NC_080390.1:47566481-47566499promoter 内 2363-2381 bp |
- | 1620 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 3 | 47568119-47568918(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
GTGATTGTGGTTGAATTGA |
SmilChr04G001381 |
Chr04 | NC_080390.1:22420306-22420324promoter 内 3462-3480 bp |
- | 521 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 2 | 22403394-22419785(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
AAATCGCAACCACTCTCAG |
SmilChr05G003184 |
Chr05 | NC_080391.1:40752798-40752816promoter 内 1672-1690 bp |
- | 2311 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 2 | 40755127-40756006(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TGGGAGGTGGTGGGTGGAG |
SmilChr05G002139 |
Chr05 | NC_080391.1:22522127-22522145promoter 内 1544-1562 bp |
- | 2439 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 2 | 22524584-22528104(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
AACGATGTTGTTGGAAATG |
SmilChr02G004950 |
Chr02 | NC_080388.1:71441668-71441686promoter 内 1214-1232 bp |
+ | 2769 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 2 | 71444455-71450469(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CAAAATCAACCACTTTCTA |
SmilChr05G002745 |
Chr05 | NC_080391.1:31613869-31613887promoter 内 872-890 bp |
+ | 3111 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 2 | 31616998-31619627(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
GCCTACCAACCACAACAGT |
SmilChr02G005471 |
Chr02 | NC_080388.1:74979584-74979602promoter 内 3978-3996 bp |
- | 5 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 74977964-74979579(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TATCATCAACCACAAACTC |
SmilChr03G002216 |
Chr03 | NC_080389.1:34910140-34910158promoter 内 3972-3990 bp |
+ | 11 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 34910169-34913099(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TACCCCTAACCACCCCCAA |
SmilChr02G001641 |
Chr02 | NC_080388.1:30492230-30492248promoter 内 3970-3988 bp |
+ | 13 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 30492261-30495190(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TACCCCTAACCACCCCCAA |
SmilChr03G000102 |
Chr03 | NC_080389.1:1136546-1136564promoter 内 3969-3987 bp |
- | 14 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 1136578-1142278(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
AATTTGGTGGTTGGTTACA |
SmilChr02G000821 |
Chr02 | NC_080388.1:13833719-13833737promoter 内 3946-3964 bp |
+ | 37 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 13833774-13835877(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CTTACTCAACCACTGTGGA |
SmilChr05G002292 |
Chr05 | NC_080391.1:24759166-24759184promoter 内 3943-3961 bp |
+ | 40 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 24759224-24762489(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TACCCCTAACCACCCCCAA |
SmilChr02G001842 |
Chr02 | NC_080388.1:33618756-33618774promoter 内 3937-3955 bp |
- | 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 33615806-33618710(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TACCCCTAACCACCCCCAA |
SmilChr05G002073 |
Chr05 | NC_080391.1:21624503-21624521promoter 内 3932-3950 bp |
- | 51 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 21624572-21626842(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
GAAAGGATGGTTGGAAAAA |
SmilChr02G003763 |
Chr02 | NC_080388.1:59310224-59310242promoter 内 3916-3934 bp |
+ | 67 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 59310309-59313153(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TACCCCTAACCACCCCCAA |
SmilChr04G000519 |
Chr04 | NC_080390.1:5733182-5733200promoter 内 3916-3934 bp |
- | 67 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 5730233-5733115(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TACCCCTAACCACCCCCAA |
SmilChr05G002430 |
Chr05 | NC_080391.1:26774538-26774556promoter 内 3916-3934 bp |
- | 67 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 26771574-26774471(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TACCCCTAACCACCCCCAA |
SmilChr05G002614 |
Chr05 | NC_080391.1:29420552-29420570promoter 内 3916-3934 bp |
- | 67 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 29417690-29420485(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TACCCCTAACCACCCCCAA |
SmilChr04G000444 |
Chr04 | NC_080390.1:4714400-4714418promoter 内 3913-3931 bp |
+ | 70 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 4714488-4717381(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TACCCCTAACCACCCCCAA |
SmilChr02G000921 |
Chr02 | NC_080388.1:16001607-16001625promoter 内 3907-3925 bp |
+ | 76 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 16001701-16011013(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TGAGCCCAACCAAATTCAC |
SmilChr01G000076 |
Chr01 | NC_080387.1:1330261-1330279promoter 内 3900-3918 bp |
+ | 83 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 1330362-1331297(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
AATGGCCAACCAACATTGC |
SmilChr01G001590 |
Chr01 | NC_080387.1:29920589-29920607promoter 内 3897-3915 bp |
+ | 86 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 29920693-29923607(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TACCCCTAACCACCCCCAA |
SmilChr03G002463 |
Chr03 | NC_080389.1:39079407-39079425promoter 内 3896-3914 bp |
+ | 87 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 39079512-39082377(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TACCCCTAACCACCCCCAA |
SmilChr02G002023 |
Chr02 | NC_080388.1:36458975-36458993promoter 内 3893-3911 bp |
- | 90 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 36456009-36458885(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TACCCCTAACCACCCCCAA |
SmilChr04G000970 |
Chr04 | NC_080390.1:13030097-13030115promoter 内 3873-3891 bp |
- | 110 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 13024982-13029987(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
ATTTTTCAACCACACGCTC |
SmilChr05G002082 |
Chr05 | NC_080391.1:21751776-21751794promoter 内 3859-3877 bp |
- | 124 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 21746217-21751652(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
AAATTCCAACCAATTTCAA |
SmilChr04G003392 |
Chr04 | NC_080390.1:50465799-50465817promoter 内 3849-3867 bp |
+ | 134 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 50465951-50467991(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
CCATGGCAACCACTTGCTT |
SmilChr04G001690 |
Chr04 | NC_080390.1:27949422-27949440promoter 内 3847-3865 bp |
- | 136 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 27949576-27952921(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
AAATATTTGGTTGGAAAGG |
SmilChr03G003046 |
Chr03 | NC_080389.1:47362515-47362533promoter 内 3778-3796 bp |
- | 205 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 47362738-47373446(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TCCTATGTGGTTGAAGGCA |
SmilChr01G005260 |
Chr01 | NC_080387.1:70084156-70084174promoter 内 3772-3790 bp |
+ | 211 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 70084385-70087913(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TCTTACCAACCATCTCAAC |
SmilChr03G003895 |
Chr03 | NC_080389.1:58053186-58053204promoter 内 3755-3773 bp |
- | 228 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 58050988-58052958(-) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
TACATTCAACAACCTTTTC |
SmilChr03G001519 |
Chr03 | NC_080389.1:18642395-18642413promoter 内 3732-3750 bp |
+ | 251 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 18642664-18643384(+) |
SMil_00010264-RA_Salv |
MP00132 |
GCATATCAACCACTTTACT |