转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000619; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00006374-RA_Salv SmilChr05G000619 WRKY XP_057764205.1 MP00167 AAAAGTCAACG

可能结合的靶基因

9756 个结合位点 6439 个候选靶基因 第 13 / 129 下载 TSV

上一页 13 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004205 Chr02 NC_080388.1:64313229-64313239promoter 内 3460-3470 bp + 531 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 64313770-64316621(+) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 TCAAGTCAACG
SmilChr02G001871 Chr02 NC_080388.1:33992686-33992696promoter 内 3206-3216 bp - 785 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 33990153-33991901(-) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AAAAGTCAACT
SmilChr03G001175 Chr03 NC_080389.1:13507595-13507605promoter 内 2935-2945 bp + 1056 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 13505637-13506539(-) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AGTTGACTTTT
SmilChr02G005518 Chr02 NC_080388.1:75292174-75292184promoter 内 2798-2808 bp + 1193 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 75289006-75290981(-) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AGTTGACTTTT
SmilChr03G000461 Chr03 NC_080389.1:4921021-4921031promoter 内 2794-2804 bp - 1197 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 4911930-4919824(-) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AAAAGTCAACT
SmilChr03G000281 Chr03 NC_080389.1:3209612-3209622promoter 内 2755-2765 bp + 1236 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 3206167-3208376(-) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AGTTGACTTTT
SmilChr02G000670 Chr02 NC_080388.1:10338664-10338674promoter 内 2673-2683 bp - 1318 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 10339992-10340971(+) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AGTTGACTTTT
SmilChr02G000575 Chr02 NC_080388.1:8222486-8222496promoter 内 2489-2499 bp + 1502 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 8220511-8220984(-) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AGTTGACTTTT
SmilChr02G000369 Chr02 NC_080388.1:4696041-4696051promoter 内 2451-2461 bp + 1540 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 4693613-4694501(-) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AGTTGACTTTT
SmilChr01G001639 Chr01 NC_080387.1:30423957-30423967promoter 内 2328-2338 bp - 1663 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 30420018-30422294(-) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 TCAAGTCAACG
SmilChr03G001255 Chr03 NC_080389.1:14481954-14481964promoter 内 2267-2277 bp - 1724 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 14483688-14485015(+) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AGTTGACTTTT
SmilChr02G004190 Chr02 NC_080388.1:64225662-64225672promoter 内 2110-2120 bp + 1881 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 64220433-64223781(-) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AGTTGACTTTT
SmilChr01G003966 Chr01 NC_080387.1:58098467-58098477promoter 内 1829-1839 bp + 2162 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 58100639-58105464(+) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AAAAGTCAACT
SmilChr02G005331 Chr02 NC_080388.1:74149670-74149680promoter 内 1736-1746 bp + 2255 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 74151935-74153381(+) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AAAAGTCAACT
SmilChr01G005784 Chr01 NC_080387.1:73940293-73940303promoter 内 1658-1668 bp - 2333 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 73937889-73937960(-) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 TCAAGTCAACG
SmilChr01G005934 Chr01 NC_080387.1:75106297-75106307promoter 内 1647-1657 bp - 2344 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 75099219-75103953(-) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 TCAAGTCAACG
SmilChr01G003678 Chr01 NC_080387.1:55192215-55192225promoter 内 1614-1624 bp - 2377 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 55194602-55196007(+) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AGTTGACTTTT
SmilChr01G005935 Chr01 NC_080387.1:75106297-75106307promoter 内 1556-1566 bp - 2435 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 75108742-75111390(+) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 CGTTGACTTGA
SmilChr01G001459 Chr01 NC_080387.1:28353628-28353638promoter 内 1149-1159 bp + 2842 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 28356480-28359703(+) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AAAAGTCAACT
SmilChr01G005908 Chr01 NC_080387.1:74951338-74951348promoter 内 1018-1028 bp - 2973 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 74946885-74948365(-) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AAAAGTCAACT
SmilChr01G002565 Chr01 NC_080387.1:43759237-43759247promoter 内 848-858 bp + 3143 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 43762390-43764524(+) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AAAAGTCAACT
SmilChr02G004851 Chr02 NC_080388.1:70670499-70670509promoter 内 848-858 bp - 3143 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 70673652-70678006(+) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AGTTGACTTTT
SmilChr02G000565 Chr02 NC_080388.1:7959293-7959303promoter 内 791-801 bp + 3200 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 7962503-7964742(+) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AAAAGTCAACT
SmilChr01G005937 Chr01 NC_080387.1:75121196-75121206promoter 内 776-786 bp - 3215 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 75116386-75117981(-) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 TCAAGTCAACG
SmilChr01G005078 Chr01 NC_080387.1:68661843-68661853promoter 内 722-732 bp + 3269 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 68665122-68666594(+) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AAAAGTCAACT
SmilChr02G002018 Chr02 NC_080388.1:36380447-36380457promoter 内 665-675 bp - 3326 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 36383783-36388678(+) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AGTTGACTTTT
SmilChr01G005145 Chr01 NC_080387.1:69240912-69240922promoter 内 579-589 bp + 3412 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 69236880-69237500(-) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AGTTGACTTTT
SmilChr01G000327 Chr01 NC_080387.1:6616892-6616902promoter 内 422-432 bp - 3569 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 6620471-6623501(+) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AGTTGACTTTT
SmilChr01G004731 Chr01 NC_080387.1:65489103-65489113promoter 内 358-368 bp - 3633 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 65492746-65494127(+) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AGTTGACTTTT
SmilChr02G001187 Chr02 NC_080388.1:21785920-21785930promoter 内 328-338 bp - 3663 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 21789593-21793173(+) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 CGTTGACTTGA
SmilChr01G003744 Chr01 NC_080387.1:55770329-55770339promoter 内 315-325 bp - 3676 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 55759079-55766653(-) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 TCAAGTCAACG
SmilChr01G004237 Chr01 NC_080387.1:60710320-60710330promoter 内 3230-3240 bp + 761 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 5 60709018-60709559(-) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AGTTGACTTTG
SmilChr01G004236 Chr01 NC_080387.1:60710320-60710330promoter 内 2776-2786 bp + 1215 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 5 60708292-60709105(-) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AGTTGACTTTG
SmilChr01G004239 Chr01 NC_080387.1:60710320-60710330promoter 内 2302-2312 bp + 1689 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 5 60712019-60715266(+) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 CAAAGTCAACT
SmilChr01G004931 Chr01 NC_080387.1:67364899-67364909promoter 内 2248-2258 bp - 1743 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 5 67366652-67368209(+) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AGTTGACTTTG
SmilChr01G004235 Chr01 NC_080387.1:60710320-60710330promoter 内 1753-1763 bp + 2238 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 5 60707062-60708082(-) SMil_00006374-RA_Salv MP00167 AGTTGACTTTG
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