转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因,每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 130 / 149 下载 TSV

上一页 130 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G003161 Chr07 NC_080393.1:33588372-33588382promoter 内 1931-1941 bp - 2060 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 33578182-33586312(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGAGCTGTCC
SmilChr06G003036 Chr06 NC_080392.1:43218127-43218137promoter 内 1924-1934 bp - 2067 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 43210346-43216060(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGAGCTGTCC
SmilChr06G003257 Chr06 NC_080392.1:45239218-45239228promoter 内 1903-1913 bp + 2088 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 45228062-45237130(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCAA
SmilChr02G003188 Chr02 NC_080388.1:53041765-53041775promoter 内 1839-1849 bp + 2152 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 53043927-53044668(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTAG
SmilChr06G000025 Chr06 NC_080392.1:269053-269063promoter 内 1758-1768 bp - 2233 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 271296-275883(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCAT
SmilChr06G000612 Chr06 NC_080392.1:5283344-5283354promoter 内 1687-1697 bp + 2304 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 5280207-5281040(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCAT
SmilChr03G004012 Chr03 NC_080389.1:59104332-59104342promoter 内 1685-1695 bp + 2306 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 59106648-59109420(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATTAGCTGTCG
SmilChr06G001762 Chr06 NC_080392.1:20590061-20590071promoter 内 1592-1602 bp - 2399 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 20592470-20594707(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCAA
SmilChr06G002397 Chr06 NC_080392.1:34750011-34750021promoter 内 1522-1532 bp - 2469 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 34745009-34747542(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGAGCTGTCC
SmilChr06G001530 Chr06 NC_080392.1:16541738-16541748promoter 内 1508-1518 bp + 2483 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 16544231-16545318(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGAGCTGTCC
SmilChr03G001907 Chr03 NC_080389.1:26688167-26688177promoter 内 1362-1372 bp - 2629 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 26690806-26691552(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCAT
SmilChr02G004822 Chr02 NC_080388.1:70335529-70335539promoter 内 1316-1326 bp + 2675 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 70328542-70332854(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCAA
SmilChr05G002777 Chr05 NC_080391.1:32366291-32366301promoter 内 1270-1280 bp - 2721 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 32338545-32363570(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTAG
SmilChr04G000627 Chr04 NC_080390.1:7135999-7136009promoter 内 1180-1190 bp + 2811 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 7132128-7133188(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCAA
SmilChr01G003846 Chr01 NC_080387.1:56779668-56779678promoter 内 1175-1185 bp + 2816 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 56773403-56776852(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCAT
SmilChr02G002971 Chr02 NC_080388.1:50227344-50227354promoter 内 1171-1181 bp + 2820 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 50230174-50231112(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGAGCTGTCC
SmilChr01G000299 Chr01 NC_080387.1:5888655-5888665promoter 内 1170-1180 bp + 2821 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 5891486-5897014(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATGAGCTGTCT
SmilChr02G001683 Chr02 NC_080388.1:31070333-31070343promoter 内 1156-1166 bp + 2835 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 31066005-31067498(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGAC
SmilChr07G001366 Chr07 NC_080393.1:10583247-10583257promoter 内 1060-1070 bp - 2931 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 10578598-10580316(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGAGCTGTCC
SmilChr05G004028 Chr05 NC_080391.1:54299080-54299090promoter 内 1023-1033 bp + 2968 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 54291683-54296112(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGAC
SmilChr06G001981 Chr06 NC_080392.1:25198013-25198023promoter 内 999-1009 bp - 2992 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 25201015-25206921(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGAC
SmilChr01G004080 Chr01 NC_080387.1:59214722-59214732promoter 内 923-933 bp + 3068 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 59217800-59219762(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGAGCTGTCC
SmilChr04G002333 Chr04 NC_080390.1:37639280-37639290promoter 内 863-873 bp + 3128 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 37632740-37636152(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCAT
SmilChr06G002460 Chr06 NC_080392.1:35400325-35400335promoter 内 832-842 bp + 3159 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 35403494-35405565(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATGAGCTGTCT
SmilChr01G003820 Chr01 NC_080387.1:56543363-56543373promoter 内 744-754 bp - 3247 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 56546620-56550205(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCAT
SmilChr07G002930 Chr07 NC_080393.1:29660971-29660981promoter 内 669-679 bp + 3322 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 29657578-29657649(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTAAT
SmilChr01G006012 Chr01 NC_080387.1:75694904-75694914promoter 内 604-614 bp + 3387 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 75698301-75699155(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATGAGCTGTCT
SmilChr03G003592 Chr03 NC_080389.1:54568866-54568876promoter 内 573-583 bp - 3418 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 54572294-54574332(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGAC
SmilChr01G000452 Chr01 NC_080387.1:9191620-9191630promoter 内 524-534 bp - 3467 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 9195097-9197295(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCAT
SmilChr03G001844 Chr03 NC_080389.1:25338343-25338353promoter 内 521-531 bp - 3470 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 25341823-25343163(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCAT
SmilChr07G000077 Chr07 NC_080393.1:358053-358063promoter 内 521-531 bp - 3470 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 361533-362094(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCAT
SmilChr01G000489 Chr01 NC_080387.1:9959344-9959354promoter 内 519-529 bp + 3472 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 9953698-9955872(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCAT
SmilChr04G001121 Chr04 NC_080390.1:16263332-16263342promoter 内 516-526 bp + 3475 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 16258367-16259857(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCAT
SmilChr06G002158 Chr06 NC_080392.1:29430779-29430789promoter 内 513-523 bp - 3478 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 29434267-29436312(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCAT
SmilChr07G002929 Chr07 NC_080393.1:29660971-29660981promoter 内 454-464 bp + 3537 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 29651169-29657434(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTAAT
SmilChr05G000030 Chr05 NC_080391.1:144645-144655promoter 内 380-390 bp - 3611 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 148266-151780(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCAA
SmilChr07G000075 Chr07 NC_080393.1:358053-358063promoter 内 271-281 bp - 3720 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 352871-354333(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATGAGCTGTCT
SmilChr02G000635 Chr02 NC_080388.1:9612244-9612254promoter 内 195-205 bp - 3796 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 9606645-9608448(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGAGCTGTCC
SmilChr05G002904 Chr05 NC_080391.1:34885959-34885969promoter 内 115-125 bp - 3876 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 34889845-34890957(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTAAT
SmilChr05G002064 Chr05 NC_080391.1:21502387-21502397promoter 内 3975-3985 bp - 16 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 3 21501875-21502371(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTAG
SmilChr02G005541 Chr02 NC_080388.1:75420720-75420730promoter 内 795-805 bp + 3196 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 3 75423926-75428294(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTAG
SmilChr03G001613 Chr03 NC_080389.1:20524805-20524815promoter 内 3789-3799 bp - 202 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 20525017-20526193(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGTA
SmilChr03G001612 Chr03 NC_080389.1:20524805-20524815promoter 内 3724-3734 bp - 267 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 20523231-20524538(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTAG
SmilChr06G001318 Chr06 NC_080392.1:13697069-13697079promoter 内 3538-3548 bp + 453 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 13692284-13696616(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGTA
SmilChr05G003042 Chr05 NC_080391.1:38205629-38205639promoter 内 3444-3454 bp - 547 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 38202802-38205082(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTAG
SmilChr05G003138 Chr05 NC_080391.1:40001810-40001820promoter 内 3444-3454 bp + 547 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 40002367-40005519(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTAG
SmilChr03G001761 Chr03 NC_080389.1:24028557-24028567promoter 内 3381-3391 bp + 610 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 24029177-24030433(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGCCT
SmilChr02G000587 Chr02 NC_080388.1:8442524-8442534promoter 内 2394-2404 bp + 1597 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 8444131-8445285(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTAG
SmilChr04G000557 Chr04 NC_080390.1:6230883-6230893promoter 内 1618-1628 bp + 2373 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 6225676-6228510(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGTA
SmilChr07G000179 Chr07 NC_080393.1:1128025-1128035promoter 内 1577-1587 bp + 2414 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 1130449-1134543(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTAG