转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因,每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 133 / 149 下载 TSV

上一页 133 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003202 Chr02 NC_080388.1:53174505-53174515promoter 内 2213-2223 bp + 1778 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 53172149-53172727(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTATA
SmilChr02G001623 Chr02 NC_080388.1:30156229-30156239promoter 内 2135-2145 bp + 1856 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 30158095-30162904(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCT
SmilChr07G000980 Chr07 NC_080393.1:7124973-7124983promoter 内 2099-2109 bp + 1892 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 7126875-7132382(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TATAGCTGTCC
SmilChr07G002992 Chr07 NC_080393.1:30545016-30545026promoter 内 2051-2061 bp - 1940 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 30541871-30543076(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGCCC
SmilChr02G005152 Chr02 NC_080388.1:72885356-72885366promoter 内 2001-2011 bp - 1990 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 72887356-72893574(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGGCAGCTGGT
SmilChr03G000394 Chr03 NC_080389.1:4312900-4312910promoter 内 1935-1945 bp - 2056 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 4314966-4315644(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTATA
SmilChr03G000838 Chr03 NC_080389.1:9584856-9584866promoter 内 1851-1861 bp - 2140 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 9587006-9587775(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTATA
SmilChr06G000870 Chr06 NC_080392.1:8235553-8235563promoter 内 1843-1853 bp + 2148 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 8230821-8233405(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTATT
SmilChr03G000783 Chr03 NC_080389.1:8932947-8932957promoter 内 1788-1798 bp - 2203 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 8926994-8930744(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCT
SmilChr03G000459 Chr03 NC_080389.1:4907943-4907953promoter 内 1747-1757 bp - 2244 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 4902541-4905699(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCT
SmilChr01G001561 Chr01 NC_080387.1:29624715-29624725promoter 内 1707-1717 bp + 2284 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 29627009-29628114(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCT
SmilChr06G001306 Chr06 NC_080392.1:13570067-13570077promoter 内 1629-1639 bp + 2362 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 13572439-13573585(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGCCC
SmilChr07G000793 Chr07 NC_080393.1:5605064-5605074promoter 内 1557-1567 bp - 2434 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 5600195-5602630(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCT
SmilChr03G000847 Chr03 NC_080389.1:9663613-9663623promoter 内 1474-1484 bp - 2517 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 9654315-9661096(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCT
SmilChr03G000482 Chr03 NC_080389.1:5133766-5133776promoter 内 1465-1475 bp - 2526 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 5127291-5131240(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCT
SmilChr07G000393 Chr07 NC_080393.1:2652288-2652298promoter 内 1446-1456 bp + 2545 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 2648052-2649743(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTATA
SmilChr04G003735 Chr04 NC_080390.1:53665920-53665930promoter 内 1403-1413 bp - 2588 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 53661609-53663332(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTAC
SmilChr03G000974 Chr03 NC_080389.1:11029128-11029138promoter 内 1397-1407 bp + 2594 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 11031732-11056910(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCT
SmilChr05G003800 Chr05 NC_080391.1:51321803-51321813promoter 内 1381-1391 bp - 2610 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 51316457-51319193(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCT
SmilChr03G003907 Chr03 NC_080389.1:58174842-58174852promoter 内 1379-1389 bp - 2612 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 58166803-58172230(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTAC
SmilChr05G003808 Chr05 NC_080391.1:51387325-51387335promoter 内 1373-1383 bp - 2618 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 51381944-51384707(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCT
SmilChr04G003567 Chr04 NC_080390.1:52046628-52046638promoter 内 1210-1220 bp - 2781 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 52049419-52053391(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTATA
SmilChr01G000252 Chr01 NC_080387.1:4750778-4750788promoter 内 1185-1195 bp - 2806 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 4753594-4756226(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGGCAGCTGGG
SmilChr03G001126 Chr03 NC_080389.1:12978783-12978793promoter 内 969-979 bp + 3022 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 12973581-12975761(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGGCAGCTGGT
SmilChr03G003953 Chr03 NC_080389.1:58586016-58586026promoter 内 952-962 bp + 3039 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 58589065-58591030(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTAC
SmilChr01G000916 Chr01 NC_080387.1:19384879-19384889promoter 内 871-881 bp - 3120 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 19372169-19381759(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCT
SmilChr02G002353 Chr02 NC_080388.1:41320118-41320128promoter 内 833-843 bp + 3158 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 41314921-41316960(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGTT
SmilChr06G000165 Chr06 NC_080392.1:1151321-1151331promoter 内 818-828 bp - 3173 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 1146771-1148148(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TATAGCTGTCC
SmilChr03G003264 Chr03 NC_080389.1:50557290-50557300promoter 内 742-752 bp + 3249 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 50560549-50561271(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTAC
SmilChr06G003125 Chr06 NC_080392.1:44103297-44103307promoter 内 684-694 bp - 3307 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 44106614-44111196(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTATT
SmilChr07G003119 Chr07 NC_080393.1:33082492-33082502promoter 内 447-457 bp + 3544 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 33086046-33087588(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTAC
SmilChr07G002664 Chr07 NC_080393.1:25853269-25853279promoter 内 347-357 bp - 3644 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 25846118-25849625(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCT
SmilChr05G004296 Chr05 NC_080391.1:56693635-56693645promoter 内 323-333 bp - 3668 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 56685955-56689967(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCT
SmilChr03G000977 Chr03 NC_080389.1:11056372-11056382promoter 内 321-331 bp + 3670 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 11050404-11052702(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTATT
SmilChr03G004141 Chr03 NC_080389.1:60249199-60249209promoter 内 291-301 bp - 3700 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 60243987-60245499(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TATAGCTGTCC
SmilChr03G000802 Chr03 NC_080389.1:9183880-9183890promoter 内 253-263 bp + 3738 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 9178241-9180142(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTATT
SmilChr05G000021 Chr05 NC_080391.1:82085-82095promoter 内 253-263 bp + 3738 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 85833-89026(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGCCC
SmilChr05G000268 Chr05 NC_080391.1:2057913-2057923promoter 内 187-197 bp + 3804 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 2036513-2054109(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGGCAGCTGGT
SmilChr01G004794 Chr01 NC_080387.1:66171369-66171379promoter 内 183-193 bp + 3808 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 66175187-66177862(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTAC
SmilChr07G000522 Chr07 NC_080393.1:3647419-3647429promoter 内 126-136 bp - 3865 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 3651294-3653090(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGTT
SmilChr02G003201 Chr02 NC_080388.1:53174505-53174515promoter 内 122-132 bp + 3869 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 53167782-53170636(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTATA
SmilChr01G000210 Chr01 NC_080387.1:3702195-3702205promoter 内 87-97 bp + 3904 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 3706109-3707727(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGCCT
SmilChr01G004391 Chr01 NC_080387.1:62083412-62083422promoter 内 22-32 bp - 3969 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 62087391-62090905(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTATA
SmilChr02G004688 Chr02 NC_080388.1:69190061-69190071promoter 内 3602-3612 bp - 389 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 69190460-69192982(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGTG
SmilChr06G000559 Chr06 NC_080392.1:4774831-4774841promoter 内 2428-2438 bp - 1563 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 4776404-4777609(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCGGGA
SmilChr03G001752 Chr03 NC_080389.1:23751948-23751958promoter 内 2159-2169 bp + 1832 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 23748316-23750116(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCGGGA
SmilChr01G005173 Chr01 NC_080387.1:69478511-69478521promoter 内 3875-3885 bp + 116 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 69476337-69478395(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGTG
SmilChr02G005558 Chr02 NC_080388.1:75536673-75536683promoter 内 3641-3651 bp - 350 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 75534486-75536323(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTAT
SmilChr04G000223 Chr04 NC_080390.1:1984234-1984244promoter 内 3552-3562 bp + 439 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 1980293-1983795(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAAG
SmilChr07G003019 Chr07 NC_080393.1:31235238-31235248promoter 内 3045-3055 bp + 946 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 31236194-31238241(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTTAGCTGTCC