靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。
下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。
| 转录因子 ID | Family | Motifs | 候选靶基因 | 候选位点 | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| ARR-B | 1MP00010 |
8344 | 9778 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00059 |
8333 | 9940 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00296 |
8304 | 9873 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00114 |
8151 | 9897 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00408 |
8149 | 9902 | 查靶基因 | |
| Nin-like | 1MP00449 |
8096 | 9453 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00209 |
8083 | 9910 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00627 |
8075 | 9835 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00450 |
8044 | 9901 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00558 |
8044 | 9762 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00096 |
8019 | 9914 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00476 |
7981 | 9904 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00221 |
7965 | 9903 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00069 |
7882 | 9917 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00406 |
7839 | 9917 | 查靶基因 | |
| TALE | 1MP00670 |
7758 | 9906 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00555 |
7648 | 9805 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00021 |
7629 | 9812 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00132 |
7583 | 9926 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00609 |
7575 | 9941 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00529 |
7559 | 9247 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00510 |
7526 | 9799 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00058 |
7440 | 9855 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00303 |
7416 | 9868 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00565 |
7412 | 9785 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00026 |
7408 | 9854 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00071 |
7408 | 9764 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00033 |
7406 | 9827 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00074 |
7396 | 9969 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00216 |
7342 | 9832 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00539 |
7338 | 9848 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00574 |
7302 | 9846 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00464 |
7299 | 9864 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00315 |
7291 | 9567 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00525 |
7235 | 9838 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00171 |
7182 | 9833 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00506 |
7173 | 9818 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00272 |
7172 | 9889 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00184 |
7147 | 9840 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00647 |
7133 | 9953 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00485 |
7130 | 8059 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00134 |
7078 | 8676 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00312 |
7006 | 8490 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00564 |
6984 | 9893 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00022 |
6959 | 9720 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00040 |
6920 | 9919 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00151 |
6907 | 9976 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00455 |
6900 | 9792 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00482 |
6899 | 8940 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00291 |
6894 | 9321 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00307 |
6893 | 9755 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00195 |
6878 | 9832 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00388 |
6870 | 9774 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00318 |
6849 | 9413 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00633 |
6833 | 8026 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00308 |
6805 | 9826 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00082 |
6784 | 9435 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00080 |
6766 | 9850 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00028 |
6764 | 9024 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00191 |
6736 | 9690 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00081 |
6729 | 9942 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00500 |
6697 | 9681 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00452 |
6671 | 7783 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00531 |
6663 | 9784 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00200 |
6661 | 9930 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00034 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00660 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00055 |
6638 | 9685 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00634 |
6619 | 7771 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00035 |
6618 | 9903 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00568 |
6611 | 9696 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00039 |
6610 | 9936 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00284 |
6552 | 9774 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00422 |
6535 | 9791 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00153 |
6534 | 9706 | 查靶基因 | |
| YABBY | 1MP00620 |
6504 | 9844 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00169 |
6498 | 7295 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00252 |
6478 | 9780 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00108 |
6458 | 9810 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00062 |
6454 | 7249 | 查靶基因 | |
| RAV | 1MP00024 |
6450 | 9853 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00167 |
6439 | 9756 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00416 |
6433 | 9716 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00608 |
6398 | 9817 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00240 |
6368 | 9978 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00607 |
6362 | 9718 | 查靶基因 | |
| Dof | 1MP00402 |
6278 | 9875 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00409 |
6252 | 8429 | 查靶基因 | |
| GRAS | 1MP00611 |
6232 | 9807 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00648 |
6170 | 9939 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00120 |
6144 | 7514 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00251 |
6140 | 9713 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00077 |
6125 | 9815 | 查靶基因 | |
| GATA | 1MP00130 |
6015 | 9821 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00508 |
5979 | 7481 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00260 |
5932 | 9706 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00013 |
5927 | 9712 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00299 |
5919 | 9699 | 查靶基因 |
下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因,每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。
输入: SmilChr03G004518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90
| TF ID | 新 Gene ID | 家族 | Protein | Motif | 共识序列 |
|---|---|---|---|---|---|
SMil_00009629-RA_Salv |
SmilChr03G004518 |
ERF | XP_057799834.1 |
MP00529 |
CTCCACCGACAAAAT |
9247 个结合位点 7559 个候选靶基因 第 135 / 152 下载 TSV
| 靶基因 | 染色体 | 最佳结合位点 | 链方向 | 靶基因上游距离 | 标准化 motif 得分 | 启动子命中位点 | 基因区间 | TF | Motif | 匹配序列 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SmilChr07G000271 |
Chr07 | NC_080393.1:1747632-1747646promoter 内 823-837 bp |
- | 3164 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 1750810-1751922(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
AGTCCGTCGGTGATT |
SmilChr08G003139 |
Chr08 | NC_080394.1:31797257-31797271promoter 内 744-758 bp |
- | 3243 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 31800514-31802124(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
ATAACGTCGGTGATT |
SmilChr03G003532 |
Chr03 | NC_080389.1:53922846-53922860promoter 内 694-708 bp |
- | 3293 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 53918860-53919553(-) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
GTCCACCGCCGAATT |
SmilChr07G004577 |
Chr07 | NC_080393.1:58558206-58558220promoter 内 680-694 bp |
- | 3307 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 58554300-58554899(-) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
TGGCACCGACGTTTA |
SmilChr07G003278 |
Chr07 | NC_080393.1:34517978-34517992promoter 内 664-678 bp |
- | 3323 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 34521315-34523091(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
CTGGAGTCGGTGCAG |
SmilChr06G002979 |
Chr06 | NC_080392.1:42608145-42608159promoter 内 514-528 bp |
+ | 3473 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 42611632-42614009(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
CCGAACCGACAATTC |
SmilChr06G000214 |
Chr06 | NC_080392.1:1427623-1427637promoter 内 469-483 bp |
+ | 3518 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 1431155-1434387(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
CGCCTCCGACAACCC |
SmilChr07G004114 |
Chr07 | NC_080393.1:52822249-52822263promoter 内 469-483 bp |
+ | 3518 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 52825781-52828448(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
AGTTACCGACAGCAT |
SmilChr01G004593 |
Chr01 | NC_080387.1:63929693-63929707promoter 内 388-402 bp |
+ | 3599 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 63923355-63926094(-) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
TCGGAGGCGGTGGAG |
SmilChr05G003725 |
Chr05 | NC_080391.1:50344344-50344358promoter 内 370-384 bp |
+ | 3617 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 50347975-50352669(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
CATCACCGACTCCAT |
SmilChr04G004122 |
Chr04 | NC_080390.1:56076365-56076379promoter 内 361-375 bp |
+ | 3626 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 56080005-56083512(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
CACCACCGACCCCAA |
SmilChr03G002045 |
Chr03 | NC_080389.1:30967561-30967575promoter 内 345-359 bp |
+ | 3642 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 30960883-30963919(-) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
CAGGTGTCGGTCACC |
SmilChr06G002410 |
Chr06 | NC_080392.1:34850371-34850385promoter 内 336-350 bp |
+ | 3651 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 34845670-34846720(-) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
TGGTCGTCGGTGTCA |
SmilChr07G004011 |
Chr07 | NC_080393.1:51152885-51152899promoter 内 310-324 bp |
+ | 3677 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 51146299-51149208(-) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
CTTGGGTCGGTGGTG |
SmilChr01G001019 |
Chr01 | NC_080387.1:21356264-21356278promoter 内 283-297 bp |
+ | 3704 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 21359982-21363226(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
CTGCACCGACTACAC |
SmilChr02G003188 |
Chr02 | NC_080388.1:53040175-53040189promoter 内 249-263 bp |
- | 3738 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 53043927-53044668(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
ATTTTGTCGGCTGAC |
SmilChr01G002298 |
Chr01 | NC_080387.1:39794552-39794566promoter 内 217-231 bp |
- | 3770 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 39798336-39800288(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
GCGGAGACGGTGGAG |
SmilChr01G003568 |
Chr01 | NC_080387.1:54249420-54249434promoter 内 73-87 bp |
+ | 3914 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 54253348-54255051(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
GGGAGCCGACAACGC |
SmilChr08G002247 |
Chr08 | NC_080394.1:20689805-20689819promoter 内 71-85 bp |
+ | 3916 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 20684800-20685889(-) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
TCTTAGTCGGTGGAC |
SmilChr08G002715 |
Chr08 | NC_080394.1:26732973-26732987promoter 内 37-51 bp |
- | 3950 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.6/ 100 | 1 | 26736937-26737008(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
GATTTGTCGGCTCAG |
SmilChr06G000973 |
Chr06 | NC_080392.1:9434565-9434579promoter 内 3868-3882 bp |
+ | 119 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 2 | 9434698-9437266(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
AAACACCGACGGAGG |
SmilChr04G001894 |
Chr04 | NC_080390.1:30914390-30914404promoter 内 2501-2515 bp |
- | 1486 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 2 | 30915890-30924549(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
TTAGTGTCGGTTCGG |
SmilChr03G000987 |
Chr03 | NC_080389.1:11177983-11177997promoter 内 474-488 bp |
+ | 3513 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 2 | 11181510-11189568(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
CTCCACCGCCTCATC |
SmilChr05G002913 |
Chr05 | NC_080391.1:35082303-35082317promoter 内 276-290 bp |
+ | 3711 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 2 | 35086028-35088092(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
CTCCACCGCCTCTTC |
SmilChr02G004185 |
Chr02 | NC_080388.1:64178424-64178438promoter 内 3946-3960 bp |
- | 41 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 64178479-64179812(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
CAGTTGTCGGTAAAT |
SmilChr02G000291 |
Chr02 | NC_080388.1:3697961-3697975promoter 内 3945-3959 bp |
+ | 42 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 3698017-3723614(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
TTCGGCCGACAAGAG |
SmilChr04G003136 |
Chr04 | NC_080390.1:47953992-47954006promoter 内 3931-3945 bp |
+ | 56 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 47951279-47953936(-) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
TAAAAGTCGGTGGAG |
SmilChr08G003108 |
Chr08 | NC_080394.1:31327886-31327900promoter 内 3921-3935 bp |
+ | 66 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 31325721-31327820(-) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
AATTTGTCGGTAACA |
SmilChr04G000079 |
Chr04 | NC_080390.1:718672-718686promoter 内 3892-3906 bp |
- | 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 718781-719961(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
GTGGAGTCGGTGTAG |
SmilChr07G003422 |
Chr07 | NC_080393.1:37389034-37389048promoter 内 3708-3722 bp |
+ | 279 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 37388165-37388755(-) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
GGTTGGTCGGTGGGG |
SmilChr06G002644 |
Chr06 | NC_080392.1:38221232-38221246promoter 内 3691-3705 bp |
+ | 296 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 38216960-38220936(-) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
CGAAAGTCGGTGGAG |
SmilChr01G004149 |
Chr01 | NC_080387.1:60023701-60023715promoter 内 3682-3696 bp |
+ | 305 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 60016671-60023396(-) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
GAAGGGTCGGTGGCT |
SmilChr05G001803 |
Chr05 | NC_080391.1:17814287-17814301promoter 内 3673-3687 bp |
+ | 314 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 17814615-17816936(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
CCCCACCGACCGATC |
SmilChr02G000517 |
Chr02 | NC_080388.1:7145698-7145712promoter 内 3559-3573 bp |
+ | 428 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 7143063-7145270(-) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
CACTTGTCGGCAATG |
SmilChr04G003171 |
Chr04 | NC_080390.1:48343937-48343951promoter 内 3559-3573 bp |
+ | 428 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 48342003-48343509(-) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
TGATCGTCGGTGCGT |
SmilChr02G004726 |
Chr02 | NC_080388.1:69505427-69505441promoter 内 3521-3535 bp |
+ | 466 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 69505907-69508790(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
CTTCACCGACTCCCT |
SmilChr05G003233 |
Chr05 | NC_080391.1:41486918-41486932promoter 内 3508-3522 bp |
- | 479 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 41487411-41488971(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
GATGAGGCGGTGGAG |
SmilChr01G003036 |
Chr01 | NC_080387.1:49373682-49373696promoter 内 3494-3508 bp |
+ | 493 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 49374189-49376325(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
CACCACCGACCTAGC |
SmilChr04G003044 |
Chr04 | NC_080390.1:46975223-46975237promoter 内 3456-3470 bp |
- | 531 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 46975768-46977181(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
TGATCGTCGGTGCGT |
SmilChr01G002419 |
Chr01 | NC_080387.1:41629759-41629773promoter 内 3427-3441 bp |
- | 560 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 41630333-41631071(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
TGATCGTCGGTGCAC |
SmilChr05G003040 |
Chr05 | NC_080391.1:38152910-38152924promoter 内 3423-3437 bp |
+ | 564 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 38142178-38152346(-) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
TGATCGTCGGTGCGT |
SmilChr05G003803 |
Chr05 | NC_080391.1:51353813-51353827promoter 内 3420-3434 bp |
- | 567 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 51354394-51354967(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
CCGGTGTCGGTTATT |
SmilChr08G000064 |
Chr08 | NC_080394.1:371112-371126promoter 内 3400-3414 bp |
- | 587 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 368394-370525(-) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
TACAACCGACAATAT |
SmilChr03G004423 |
Chr03 | NC_080389.1:62397255-62397269promoter 内 3340-3354 bp |
- | 647 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 62394783-62396608(-) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
TCACACCGACATCCA |
SmilChr01G005058 |
Chr01 | NC_080387.1:68496536-68496550promoter 内 3282-3296 bp |
+ | 705 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 68497255-68498694(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
AGATACCGACACTGA |
SmilChr05G003421 |
Chr05 | NC_080391.1:45449882-45449896promoter 内 3219-3233 bp |
+ | 768 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 45450664-45460402(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
AAACGCCGACAATCT |
SmilChr03G000214 |
Chr03 | NC_080389.1:2500801-2500815promoter 内 3212-3226 bp |
+ | 775 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 2496980-2500026(-) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
TGCTTGTCGGTAAAG |
SmilChr04G001197 |
Chr04 | NC_080390.1:18321119-18321133promoter 内 3198-3212 bp |
- | 789 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 18321922-18328541(+) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
GTCTTGTCGGCCATG |
SmilChr07G000430 |
Chr07 | NC_080393.1:3002443-3002457promoter 内 3176-3190 bp |
+ | 811 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 2997062-3001632(-) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
TAGACGTCGGTGATT |
SmilChr06G001294 |
Chr06 | NC_080392.1:13483135-13483149promoter 内 3151-3165 bp |
+ | 836 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 13481016-13482299(-) |
SMil_00009629-RA_Salv |
MP00529 |
ATATTGTCGGTTGTA |