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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004708; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00017834-RA_Salv SmilChr01G004708 WRKY XP_057787833.1 MP00251 AACGTTGACTTTTTT

可能结合的靶基因

9713 个结合位点 6140 个候选靶基因 第 14 / 123 下载 TSV

上一页 14 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001223 Chr02 NC_080388.1:22492642-22492656promoter 内 1117-1131 bp - 2870 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 22480981-22489772(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GAGGTTGACTTTCTA
SmilChr02G004162 Chr02 NC_080388.1:63954488-63954502promoter 内 1010-1024 bp - 2977 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 63947914-63951511(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GGGTTTGACTTTTCT
SmilChr02G002074 Chr02 NC_080388.1:37326200-37326214promoter 内 703-717 bp - 3284 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 37329498-37330279(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 TTGAAAGTCAAAGGC
SmilChr02G001259 Chr02 NC_080388.1:23095492-23095506promoter 内 659-673 bp + 3328 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 23089378-23092164(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 TCAAAAGTCAAGGCA
SmilChr01G004659 Chr01 NC_080387.1:64682179-64682193promoter 内 578-592 bp + 3409 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 64676701-64678770(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 CCAAAAGTCAACACG
SmilChr01G003891 Chr01 NC_080387.1:57218338-57218352promoter 内 503-517 bp - 3484 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 57213067-57214854(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 TACCTTGACTTTTTA
SmilChr01G004490 Chr01 NC_080387.1:63033173-63033187promoter 内 490-504 bp + 3497 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 63036684-63038569(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GTCTTTGACTTTTAA
SmilChr01G004536 Chr01 NC_080387.1:63516955-63516969promoter 内 488-502 bp + 3499 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 63520468-63524011(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 TCTGTTGACTTTTGA
SmilChr02G003311 Chr02 NC_080388.1:54356842-54356856promoter 内 393-407 bp - 3594 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 54360450-54361312(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 CGAAAAGTCAAAGAG
SmilChr02G002914 Chr02 NC_080388.1:49446287-49446301promoter 内 384-398 bp - 3603 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 49449904-49450771(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 CGAAAAGTCAAAGAG
SmilChr01G003844 Chr01 NC_080387.1:56762628-56762642promoter 内 172-186 bp + 3815 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 56766457-56768587(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GTCTTTGACTTTTAA
SmilChr01G005053 Chr01 NC_080387.1:68467411-68467425promoter 内 44-58 bp + 3943 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 68471368-68474383(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GTCTTTGACTTTTAA
SmilChr02G002271 Chr02 NC_080388.1:40175464-40175478promoter 内 3902-3916 bp - 85 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 40172226-40175379(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 ACGTTTGACTTTTTC
SmilChr01G004564 Chr01 NC_080387.1:63720095-63720109promoter 内 3849-3863 bp + 138 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 63717788-63719957(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 AGCCAAGTCAAAGAC
SmilChr01G005736 Chr01 NC_080387.1:73488821-73488835promoter 内 3597-3611 bp + 390 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 73489225-73490124(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 TCCGTTGACTTCTCA
SmilChr02G003697 Chr02 NC_080388.1:58431170-58431184promoter 内 3363-3377 bp + 624 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 58431808-58433480(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 TTTGTTGACTTTGCT
SmilChr01G001991 Chr01 NC_080387.1:35319471-35319485promoter 内 3313-3327 bp + 674 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 35320159-35325141(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 CACGTTGACTTGTAG
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SmilChr01G004360 Chr01 NC_080387.1:61791803-61791817promoter 内 2905-2919 bp - 1082 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 61789442-61790721(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 TATGTTGACTTTTCA
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SmilChr01G001989 Chr01 NC_080387.1:35319471-35319485promoter 内 2804-2818 bp + 1183 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 35312795-35318288(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 CTACAAGTCAACGTG
SmilChr02G004783 Chr02 NC_080388.1:70008864-70008878promoter 内 2640-2654 bp - 1347 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 70010225-70014037(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 TAGCAAGTCAACGAT
SmilChr02G002052 Chr02 NC_080388.1:36931420-36931434promoter 内 2482-2496 bp - 1505 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 36932939-36935810(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 CAACAAGTCAAAGCT
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SmilChr01G002206 Chr01 NC_080387.1:38387828-38387842promoter 内 2297-2311 bp - 1690 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 38389532-38392060(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 CAACAAGTCAAAGCT
SmilChr02G002423 Chr02 NC_080388.1:42196468-42196482promoter 内 2208-2222 bp + 1779 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 42198261-42199616(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GTGGTTGACTTGGGC
SmilChr02G004781 Chr02 NC_080388.1:70008864-70008878promoter 内 1898-1912 bp - 2089 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 69999839-70006775(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 ATCGTTGACTTGCTA
SmilChr01G003966 Chr01 NC_080387.1:58098465-58098479promoter 内 1827-1841 bp - 2160 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 58100639-58105464(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GAAAAAGTCAACTGG
SmilChr01G001886 Chr01 NC_080387.1:33965760-33965774promoter 内 1487-1501 bp - 2500 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 33959204-33963260(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GTCTTTGACTTTTAA
SmilChr02G001063 Chr02 NC_080388.1:18933971-18933985promoter 内 1358-1372 bp + 2629 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 18936614-18940083(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GTTGTTGACTTGGTG
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SmilChr01G005738 Chr01 NC_080387.1:73504289-73504303promoter 内 1063-1077 bp + 2924 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 73507227-73507982(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 TCCGTTGACTTCTCA
SmilChr01G002832 Chr01 NC_080387.1:46930406-46930420promoter 内 824-838 bp + 3163 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 46933583-46934074(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 ACCGTTGACTTCTGG
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SmilChr01G005957 Chr01 NC_080387.1:75256666-75256680promoter 内 621-635 bp + 3366 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 75260046-75263014(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 ATCTTTGACTTTTTA
SmilChr02G004065 Chr02 NC_080388.1:62946946-62946960promoter 内 583-597 bp + 3404 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 62942366-62943542(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GTCAAAGTCAAGAGC
SmilChr01G002789 Chr01 NC_080387.1:46382361-46382375promoter 内 437-451 bp + 3550 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 46363649-46378811(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 CTCAAAGTCAAAGGT
SmilChr01G002441 Chr01 NC_080387.1:41991645-41991659promoter 内 3838-3852 bp - 149 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 5 41991808-41992807(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 AAGCAAGTCAACCCC
SmilChr02G002768 Chr02 NC_080388.1:47743580-47743594promoter 内 3250-3264 bp - 737 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 4 47744331-47750293(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 TGCAAAGTCAACCCG
SmilChr01G001165 Chr01 NC_080387.1:23673441-23673455promoter 内 3894-3908 bp + 93 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 23673548-23687383(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 CTCTTTGACTTTTTT
SmilChr02G002037 Chr02 NC_080388.1:36665084-36665098promoter 内 3037-3051 bp - 950 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 36666048-36673497(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 ACAAAAGTCAACACG
SmilChr02G002025 Chr02 NC_080388.1:36477540-36477554promoter 内 2853-2867 bp + 1134 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 36467687-36476406(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 ACAAAAGTCAACACG
SmilChr01G004042 Chr01 NC_080387.1:58832980-58832994promoter 内 2742-2756 bp - 1245 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 58828095-58831735(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GGCGTTGACTCTTCA
SmilChr02G002623 Chr02 NC_080388.1:45527672-45527686promoter 内 3688-3702 bp + 299 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 45527985-45529888(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 CATGTTGACTTGTCC
SmilChr02G000159 Chr02 NC_080388.1:2062358-2062372promoter 内 3645-3659 bp - 342 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 2061494-2062016(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 GGGGTTGACTTGCTT
SmilChr02G003038 Chr02 NC_080388.1:51095555-51095569promoter 内 2743-2757 bp + 1244 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 51096813-51098669(+) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 AGCGTTGACTTAGAC
SmilChr02G003147 Chr02 NC_080388.1:52486842-52486856promoter 内 2724-2738 bp - 1263 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 52483738-52485579(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 AGCGTTGACTTAGAC
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SmilChr01G004524 Chr01 NC_080387.1:63443410-63443424promoter 内 1505-1519 bp + 2482 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 63439237-63440928(-) SMil_00017834-RA_Salv MP00251 CAGAAAGTCAACAGG