Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID 家族 基序 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G001606; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族蛋白基序共识序列
SMil_00016473-RA_Salv SmilChr03G001606 WRKY XP_057802772.1 MP00539 TCGTTGACTTTTTT

可能结合的靶基因

9848 个结合位点 7338 个候选靶基因 第 142 / 147 下载 TSV

上一页 142 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF 基序 匹配序列
SmilChr02G004571 Chr02 NC_080388.1:68211604-68211617promoter 内 2425-2438 bp + 1563 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 68213180-68218239(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 ATGTTGACTTGAGA
SmilChr01G005558 Chr01 NC_080387.1:72399790-72399803promoter 内 2397-2410 bp + 1591 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 72395385-72398199(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 CTTGAAGTCAAAGG
SmilChr03G000883 Chr03 NC_080389.1:10025361-10025374promoter 内 2389-2402 bp - 1599 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 10022162-10023762(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 AGGTTGACTAACTA
SmilChr02G000007 Chr02 NC_080388.1:63680-63693promoter 内 2333-2346 bp - 1655 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 60632-62025(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 TAGTTGACTGTGAT
SmilChr04G002502 Chr04 NC_080390.1:39969516-39969529promoter 内 2308-2321 bp - 1680 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 39971209-39974752(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 TCAAAAGTCAAATG
SmilChr04G001891 Chr04 NC_080390.1:30879238-30879251promoter 内 2301-2314 bp + 1687 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 30880938-30891666(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 ACTTTGACTTAAGG
SmilChr03G002780 Chr03 NC_080389.1:44232173-44232186promoter 内 2282-2295 bp + 1706 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 44233892-44235338(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 GGTTTGACTTTAAT
SmilChr04G003043 Chr04 NC_080390.1:46944385-46944398promoter 内 2257-2270 bp + 1731 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 46946129-46948705(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 CATTTGACTTTTCA
SmilChr04G001883 Chr04 NC_080390.1:30780556-30780569promoter 内 2246-2259 bp + 1742 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 30782311-30793000(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 ACTTTGACTTAAGG
SmilChr03G003684 Chr03 NC_080389.1:55685866-55685879promoter 内 2245-2258 bp + 1743 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 55683198-55684123(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 CCTTAAGTCAAAGT
SmilChr04G002531 Chr04 NC_080390.1:40378496-40378509promoter 内 2223-2236 bp - 1765 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 40374252-40376731(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 CGATTGACTTTCTT
SmilChr04G003172 Chr04 NC_080390.1:48391676-48391689promoter 内 2173-2186 bp - 1815 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 48387346-48389861(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 CATTTGACTTTTCA
SmilChr04G000496 Chr04 NC_080390.1:5419819-5419832promoter 内 2114-2127 bp - 1874 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 5408334-5417945(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 TTGTTGACTGACTC
SmilChr02G001582 Chr02 NC_080388.1:29546265-29546278promoter 内 2034-2047 bp - 1954 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 29534250-29544311(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 TATTTGACTTTTTA
SmilChr02G002809 Chr02 NC_080388.1:48148183-48148196promoter 内 2033-2046 bp + 1955 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 48141161-48146228(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 CAGCAAGTCAATGA
SmilChr01G001726 Chr01 NC_080387.1:31798996-31799009promoter 内 2029-2042 bp + 1959 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 31794900-31797037(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 TTATGAGTCAACAC
SmilChr02G004557 Chr02 NC_080388.1:68099837-68099850promoter 内 2010-2023 bp - 1978 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 68101828-68103606(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 GAATAAGTCAAAAG
SmilChr01G003105 Chr01 NC_080387.1:49854933-49854946promoter 内 2003-2016 bp - 1985 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 49856931-49862217(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 ACCGGAGTCAACAC
SmilChr01G002287 Chr01 NC_080387.1:39668683-39668696promoter 内 1986-1999 bp + 2002 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 39670698-39674128(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 AGTTTGACTTTTGA
SmilChr03G003743 Chr03 NC_080389.1:56472760-56472773promoter 内 1976-1989 bp - 2012 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 56474785-56481308(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 TCCAAAGTCAAAAG
SmilChr03G004741 Chr03 NC_080389.1:64544857-64544870promoter 内 1952-1965 bp - 2036 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 64539766-64542821(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 TGTTTGACTTTAGT
SmilChr02G003947 Chr02 NC_080388.1:61623089-61623102promoter 内 1923-1936 bp + 2065 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 61625167-61628104(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 TTGTTGACTGATGA
SmilChr04G001369 Chr04 NC_080390.1:22224926-22224939promoter 内 1904-1917 bp + 2084 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 22227023-22232900(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 GTTTTGACTTATGT
SmilChr02G003511 Chr02 NC_080388.1:56310937-56310950promoter 内 1825-1838 bp + 2163 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 56313113-56314634(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 ATGTTGACTCATGT
SmilChr03G002068 Chr03 NC_080389.1:31587512-31587525promoter 内 1821-1834 bp + 2167 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 31585239-31585345(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 CCAAAAGTCAAGGT
SmilChr02G002563 Chr02 NC_080388.1:44571783-44571796promoter 内 1715-1728 bp + 2273 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 44569404-44569510(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 CCAAAAGTCAAGGT
SmilChr02G002565 Chr02 NC_080388.1:44626982-44626995promoter 内 1715-1728 bp + 2273 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 44624603-44624709(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 CCAAAAGTCAAGGT
SmilChr03G002673 Chr03 NC_080389.1:42445420-42445433promoter 内 1692-1705 bp - 2296 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 42447729-42447802(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 TGAAAAGTCAATAC
SmilChr02G004677 Chr02 NC_080388.1:69117232-69117245promoter 内 1667-1680 bp + 2321 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 69112116-69114911(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 ATGTAAGTCAAAGT
SmilChr01G005442 Chr01 NC_080387.1:71528531-71528544promoter 内 1647-1660 bp + 2341 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 71524945-71526190(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 GCGCGAGTCAACAC
SmilChr02G002983 Chr02 NC_080388.1:50423948-50423961promoter 内 1645-1658 bp + 2343 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 50415867-50421605(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 TATACAGTCAACAT
SmilChr04G000508 Chr04 NC_080390.1:5577180-5577193promoter 内 1640-1653 bp - 2348 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 5568927-5574832(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 AAGTTGACTCTCCC
SmilChr03G004668 Chr03 NC_080389.1:64145379-64145392promoter 内 1633-1646 bp - 2355 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 64147747-64151428(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 TGACTAGTCAACAT
SmilChr01G003236 Chr01 NC_080387.1:51114071-51114084promoter 内 1555-1568 bp + 2433 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 51116517-51117513(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 ACCTTGACTTTTGG
SmilChr03G002848 Chr03 NC_080389.1:45042700-45042713promoter 内 1541-1554 bp - 2447 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 45038210-45040253(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 ACTTTGACTTAGAT
SmilChr02G001640 Chr02 NC_080388.1:30461607-30461620promoter 内 1534-1547 bp - 2454 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 30464074-30464180(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 CCAAAAGTCAAGGT
SmilChr04G000035 Chr04 NC_080390.1:337434-337447promoter 内 1526-1539 bp - 2462 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 332948-334972(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 GTATTGACTTTGTC
SmilChr03G001571 Chr03 NC_080389.1:19839447-19839460promoter 内 1482-1495 bp + 2506 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 19841966-19849617(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 GCATTGACTTCTAA
SmilChr04G003193 Chr04 NC_080390.1:48660667-48660680promoter 内 1476-1489 bp + 2512 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 48658049-48658155(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 CCAAAAGTCAAGGT
SmilChr01G001477 Chr01 NC_080387.1:28555376-28555389promoter 内 1469-1482 bp + 2519 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 28557908-28560722(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 ATGTTGACTTCAAC
SmilChr04G002625 Chr04 NC_080390.1:41652874-41652887promoter 内 1468-1481 bp - 2520 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 41646222-41650354(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 AGGTTGACTTAAAA
SmilChr01G005419 Chr01 NC_080387.1:71394405-71394418promoter 内 1461-1474 bp + 2527 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 71396945-71399306(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 TATTTGACTTTTTA
SmilChr03G004232 Chr03 NC_080389.1:60856542-60856555promoter 内 1433-1446 bp - 2555 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 60853081-60853987(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 ATGTTGACTGTATA
SmilChr01G002537 Chr01 NC_080387.1:43438676-43438689promoter 内 1425-1438 bp - 2563 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 43435817-43436113(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 ATGTTGACTCTGAG
SmilChr03G002240 Chr03 NC_080389.1:35291826-35291839promoter 内 1407-1420 bp + 2581 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 35288443-35289245(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 GCCAGAGTCAACTT
SmilChr04G002552 Chr04 NC_080390.1:40828060-40828073promoter 内 1403-1416 bp + 2585 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 40825369-40825475(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 CCAAAAGTCAAGGT
SmilChr01G004207 Chr01 NC_080387.1:60507150-60507163promoter 内 1388-1401 bp + 2600 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 60509763-60514700(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 CATTTGACTTTTGA
SmilChr04G002891 Chr04 NC_080390.1:45131787-45131800promoter 内 1385-1398 bp - 2603 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 45128099-45129184(-) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 TTGTTGACTGACTC
SmilChr04G001768 Chr04 NC_080390.1:29077571-29077584promoter 内 1384-1397 bp - 2604 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 29080188-29081646(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 CCTAAAGTCAAAAG
SmilChr02G002455 Chr02 NC_080388.1:42840029-42840042promoter 内 1366-1379 bp + 2622 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 1 42842664-42851129(+) SMil_00016473-RA_Salv MP00539 CTTTTGACTTTAGG