转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G002503; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027448-RA_Salv SmilChr03G002503 MYB XP_057801356.1 MP00482 AAAATATGACCGTTG

可能结合的靶基因

8940 个结合位点 6899 个候选靶基因 第 15 / 138 下载 TSV

上一页 15 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002993 Chr02 NC_080388.1:50602251-50602265promoter 内 3878-3892 bp - 109 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 50602374-50603343(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTTAGTTTAG
SmilChr02G001573 Chr02 NC_080388.1:29165255-29165269promoter 内 3072-3086 bp - 915 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 29162480-29164340(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAATGTTGACCGTTA
SmilChr01G002555 Chr01 NC_080387.1:43679289-43679303promoter 内 2305-2319 bp - 1682 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 43673972-43677607(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAATGTTGACCGTTA
SmilChr04G002976 Chr04 NC_080390.1:46151181-46151195promoter 内 2230-2244 bp - 1757 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 46148245-46149424(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAATGCTGACCGTTA
SmilChr06G001076 Chr06 NC_080392.1:10662922-10662936promoter 内 2153-2167 bp - 1834 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 10659329-10661088(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAATGCTGACCGTTA
SmilChr06G000136 Chr06 NC_080392.1:965983-965997promoter 内 2063-2077 bp + 1924 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 962824-964059(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGTCAACATTT
SmilChr01G005703 Chr01 NC_080387.1:73271617-73271631promoter 内 1322-1336 bp + 2665 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 73274296-73277234(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAATGCTGACCGTTA
SmilChr03G003834 Chr03 NC_080389.1:57489376-57489390promoter 内 1201-1215 bp - 2786 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 57481259-57486590(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 GGTACATGACCGTTG
SmilChr06G000137 Chr06 NC_080392.1:965983-965997promoter 内 991-1005 bp + 2996 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 968993-972741(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAATGTTGACCGTTA
SmilChr05G004058 Chr05 NC_080391.1:54535652-54535666promoter 内 813-827 bp + 3174 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 54538840-54543137(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAATGTTGACCGTTA
SmilChr08G001968 Chr08 NC_080394.1:17354982-17354996promoter 内 389-403 bp + 3598 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 17358594-17363558(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAATGCTGACCGTTA
SmilChr08G002121 Chr08 NC_080394.1:19076004-19076018promoter 内 3931-3945 bp - 56 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 19072973-19075948(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAGAGGTGACCGTTG
SmilChr06G000005 Chr06 NC_080392.1:150561-150575promoter 内 3767-3781 bp + 220 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 150795-152295(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAATGTTGACCGTTA
SmilChr04G002973 Chr04 NC_080390.1:46100201-46100215promoter 内 3448-3462 bp + 539 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 46096390-46099662(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCATTAGTT
SmilChr02G005540 Chr02 NC_080388.1:75417853-75417867promoter 内 3190-3204 bp + 797 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 75418664-75420406(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TCAAAATGACCGTTA
SmilChr03G002384 Chr03 NC_080389.1:37653461-37653475promoter 内 3050-3064 bp + 937 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 37652021-37652524(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCGGAATAT
SmilChr02G005539 Chr02 NC_080388.1:75417853-75417867promoter 内 2981-2995 bp + 1006 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 75413636-75416847(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGTCATTTTGA
SmilChr04G000619 Chr04 NC_080390.1:7014604-7014618promoter 内 2919-2933 bp + 1068 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 7006882-7013536(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTTAGTTTGG
SmilChr06G002164 Chr06 NC_080392.1:29761108-29761122promoter 内 2868-2882 bp + 1119 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 29762241-29766561(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 ATTACTTGACCGTTG
SmilChr05G001889 Chr05 NC_080391.1:19192090-19192104promoter 内 2782-2796 bp + 1205 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 19193309-19202492(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 GGAATCGGACCGTTG
SmilChr04G002493 Chr04 NC_080390.1:39825360-39825374promoter 内 2536-2550 bp + 1451 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 39826825-39828443(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAATGCTGACCGTTA
SmilChr06G000357 Chr06 NC_080392.1:2731448-2731462promoter 内 2141-2155 bp - 1846 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 2733308-2736597(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGTCAACATTT
SmilChr01G003208 Chr01 NC_080387.1:50860428-50860442promoter 内 2066-2080 bp - 1921 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 50862363-50862856(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGTCAATTATG
SmilChr01G004707 Chr01 NC_080387.1:65174940-65174954promoter 内 1939-1953 bp + 2048 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 65177002-65181214(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAAACTTTACCGTTG
SmilChr02G003631 Chr02 NC_080388.1:57658931-57658945promoter 内 1920-1934 bp + 2067 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 57650555-57656864(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGTCAACATTT
SmilChr04G001439 Chr04 NC_080390.1:23495694-23495708promoter 内 1898-1912 bp - 2089 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 23497797-23504823(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGTCAGCATTT
SmilChr04G000549 Chr04 NC_080390.1:6133289-6133303promoter 内 1846-1860 bp - 2141 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 6135444-6138217(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTAAAGTTTG
SmilChr07G000120 Chr07 NC_080393.1:689715-689729promoter 内 1716-1730 bp - 2271 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 684232-687444(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 GATTTACGACCGTTG
SmilChr07G001915 Chr07 NC_080393.1:16554995-16555009promoter 内 1477-1491 bp - 2510 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 16551988-16552485(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAATGCTGACCGTTA
SmilChr07G002262 Chr07 NC_080393.1:20821386-20821400promoter 内 1443-1457 bp - 2544 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 20816555-20818842(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAATGCTGACCGTTA
SmilChr08G003016 Chr08 NC_080394.1:30288063-30288077promoter 内 1147-1161 bp + 2840 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 30285151-30285223(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCATCTTGA
SmilChr05G001888 Chr05 NC_080391.1:19192090-19192104promoter 内 1052-1066 bp + 2935 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 19188247-19189155(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCCGATTCC
SmilChr03G004063 Chr03 NC_080389.1:59593905-59593919promoter 内 1012-1026 bp + 2975 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 59596894-59599925(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 GGAATTGGACCGTTG
SmilChr05G002030 Chr05 NC_080391.1:21096092-21096106promoter 内 966-980 bp - 3021 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 21087317-21093071(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAATGCTGACCGTTA
SmilChr02G001140 Chr02 NC_080388.1:20581285-20581299promoter 内 937-951 bp + 3050 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 20584349-20594367(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 ATTATTTAACCGTTG
SmilChr06G001111 Chr06 NC_080392.1:11217641-11217655promoter 内 892-906 bp + 3095 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 11220750-11221893(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 ACTATTTAACCGTTG
SmilChr06G001127 Chr06 NC_080392.1:11329032-11329046promoter 内 710-724 bp + 3277 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 11332323-11334211(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 ACTATTTAACCGTTG
SmilChr07G004013 Chr07 NC_080393.1:51213509-51213523promoter 内 514-528 bp + 3473 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 51209464-51210036(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCATCTTCA
SmilChr03G000177 Chr03 NC_080389.1:1911489-1911503promoter 内 350-364 bp - 3637 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 1915140-1916637(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGTCAAATACT
SmilChr08G002174 Chr08 NC_080394.1:19658831-19658845promoter 内 348-362 bp + 3639 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 19662484-19663080(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAATGTTGACCGTTA
SmilChr07G004201 Chr07 NC_080393.1:54095695-54095709promoter 内 213-227 bp - 3774 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 54090843-54091921(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAATGCTGACCGTTA
SmilChr02G003920 Chr02 NC_080388.1:61279139-61279153promoter 内 2501-2515 bp + 1486 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 4 61280639-61283858(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CGAATTCGACCGTTG
SmilChr03G000236 Chr03 NC_080389.1:2822727-2822741promoter 内 1892-1906 bp + 2095 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 4 2819595-2820632(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCGAATTCG
SmilChr04G001303 Chr04 NC_080390.1:20730634-20730648promoter 内 3738-3752 bp + 249 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 20730897-20748029(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CGAATTCGACCGTTG
SmilChr02G001219 Chr02 NC_080388.1:22385058-22385072promoter 内 3723-3737 bp + 264 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 22384036-22384794(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCGAATTCG
SmilChr08G002293 Chr08 NC_080394.1:21409813-21409827promoter 内 3655-3669 bp - 332 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 21404160-21409481(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CGAATTCGACCGTTG
SmilChr02G001279 Chr02 NC_080388.1:23486429-23486443promoter 内 3403-3417 bp + 584 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 23485375-23485845(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCGAATTCG
SmilChr01G003823 Chr01 NC_080387.1:56559067-56559081promoter 内 2711-2725 bp - 1276 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 56560357-56560430(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCGAATTCG
SmilChr02G001218 Chr02 NC_080388.1:22385058-22385072promoter 内 2125-2139 bp + 1862 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 22376649-22383196(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCGAATTCG
SmilChr01G003822 Chr01 NC_080387.1:56559067-56559081promoter 内 1764-1778 bp - 2223 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 56553834-56556844(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CGAATTCGACCGTTG