转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G004136; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00000866-RA_Salv SmilChr04G004136 MYB XP_057806072.1 MP00627 TTACCTACCG

可能结合的靶基因

9835 个结合位点 8075 个候选靶基因 第 15 / 162 下载 TSV

上一页 15 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000796 Chr04 NC_080390.1:9836537-9836546promoter 内 3201-3210 bp - 791 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 9833809-9835746(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr07G004323 Chr07 NC_080393.1:55777259-55777268promoter 内 3178-3187 bp - 814 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 55771957-55776445(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr05G002296 Chr05 NC_080391.1:24790409-24790418promoter 内 3147-3156 bp + 845 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 24788599-24789564(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr01G001265 Chr01 NC_080387.1:25346556-25346565promoter 内 3142-3151 bp + 850 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 25343733-25345706(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr03G001629 Chr03 NC_080389.1:20991328-20991337promoter 内 3067-3076 bp + 925 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 20992262-20994544(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr05G003701 Chr05 NC_080391.1:50107986-50107995promoter 内 3019-3028 bp + 973 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 50108968-50111515(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr03G004456 Chr03 NC_080389.1:62659948-62659957promoter 内 3016-3025 bp - 976 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 62660933-62664423(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr07G001060 Chr07 NC_080393.1:7815784-7815793promoter 内 2977-2986 bp + 1015 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 7813277-7814769(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr06G002959 Chr06 NC_080392.1:42389976-42389985promoter 内 2905-2914 bp - 1087 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 42391072-42393776(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr01G001266 Chr01 NC_080387.1:25346556-25346565promoter 内 2867-2876 bp + 1125 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 25347690-25350063(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr03G000559 Chr03 NC_080389.1:6063062-6063071promoter 内 2765-2774 bp + 1227 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 6058931-6061835(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr07G002105 Chr07 NC_080393.1:19150712-19150721promoter 内 2710-2719 bp - 1282 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 19152003-19156324(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr03G003677 Chr03 NC_080389.1:55610664-55610673promoter 内 2706-2715 bp + 1286 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 55611959-55615915(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr06G002958 Chr06 NC_080392.1:42389976-42389985promoter 内 2663-2672 bp - 1329 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 42385067-42388647(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr03G004274 Chr03 NC_080389.1:61194496-61194505promoter 内 2656-2665 bp - 1336 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 61195841-61198054(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr03G002478 Chr03 NC_080389.1:39302205-39302214promoter 内 2606-2615 bp + 1386 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 39303600-39306097(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr06G002410 Chr06 NC_080392.1:34848194-34848203promoter 内 2518-2527 bp - 1474 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 34845670-34846720(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr02G000356 Chr02 NC_080388.1:4593127-4593136promoter 内 2500-2509 bp + 1492 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 4594628-4601151(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr04G003473 Chr04 NC_080390.1:51185184-51185193promoter 内 2294-2303 bp + 1698 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 51186891-51189681(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr07G003343 Chr07 NC_080393.1:35823183-35823192promoter 内 2273-2282 bp + 1719 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 35824911-35826102(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr03G002285 Chr03 NC_080389.1:36032483-36032492promoter 内 2267-2276 bp - 1725 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 36027752-36030758(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr05G001298 Chr05 NC_080391.1:11204277-11204286promoter 内 2228-2237 bp + 1764 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 11198076-11202513(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr06G000995 Chr06 NC_080392.1:9824393-9824402promoter 内 2099-2108 bp + 1893 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 9821263-9822500(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr06G003073 Chr06 NC_080392.1:43625121-43625130promoter 内 2030-2039 bp + 1962 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 43627092-43628093(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr02G001379 Chr02 NC_080388.1:26101729-26101738promoter 内 1989-1998 bp + 2003 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 26097113-26099726(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr03G000072 Chr03 NC_080389.1:898800-898809promoter 内 1942-1951 bp + 2050 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 900859-911088(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr03G001925 Chr03 NC_080389.1:27015647-27015656promoter 内 1913-1922 bp - 2079 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 27006361-27013568(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr04G000527 Chr04 NC_080390.1:5791175-5791184promoter 内 1904-1913 bp - 2088 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 5787434-5789087(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr01G000125 Chr01 NC_080387.1:2101831-2101840promoter 内 1873-1882 bp - 2119 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 2098596-2099712(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr01G005637 Chr01 NC_080387.1:72802117-72802126promoter 内 1806-1815 bp + 2186 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 72804312-72805047(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr05G002853 Chr05 NC_080391.1:34033714-34033723promoter 内 1800-1809 bp + 2192 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 34024537-34031522(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr04G000611 Chr04 NC_080390.1:6901525-6901534promoter 内 1760-1769 bp + 2232 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 6897804-6899293(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr07G002429 Chr07 NC_080393.1:22612141-22612150promoter 内 1715-1724 bp + 2277 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 22606680-22609864(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr06G002636 Chr06 NC_080392.1:37969442-37969451promoter 内 1694-1703 bp + 2298 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 37964022-37967144(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr01G000751 Chr01 NC_080387.1:16596608-16596617promoter 内 1612-1621 bp + 2380 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 16598997-16602119(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr05G004254 Chr05 NC_080391.1:56325772-56325781promoter 内 1586-1595 bp + 2406 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 56328187-56331674(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr01G003937 Chr01 NC_080387.1:57689805-57689814promoter 内 1585-1594 bp + 2407 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 57685818-57687398(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr01G006018 Chr01 NC_080387.1:75763040-75763049promoter 内 1580-1589 bp - 2412 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 75765461-75773588(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr07G001061 Chr07 NC_080393.1:7815784-7815793promoter 内 1508-1517 bp + 2484 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 7818277-7819189(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr01G000934 Chr01 NC_080387.1:19817236-19817245promoter 内 1395-1404 bp - 2597 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 19803718-19814639(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr01G000933 Chr01 NC_080387.1:19788781-19788790promoter 内 1393-1402 bp - 2599 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 19775261-19786182(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr03G000314 Chr03 NC_080389.1:3581111-3581120promoter 内 1392-1401 bp + 2600 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 3575411-3578511(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr01G001192 Chr01 NC_080387.1:24055705-24055714promoter 内 1364-1373 bp - 2628 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 24058342-24059483(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr07G000441 Chr07 NC_080393.1:3088868-3088877promoter 内 1360-1369 bp + 2632 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 3083628-3086236(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT
SmilChr04G000824 Chr04 NC_080390.1:10344713-10344722promoter 内 1253-1262 bp - 2739 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 10332171-10341974(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr01G002872 Chr01 NC_080387.1:47321925-47321934promoter 内 1205-1214 bp - 2787 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 47317702-47319138(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr02G001028 Chr02 NC_080388.1:18197583-18197592promoter 内 1201-1210 bp - 2791 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 18191178-18194792(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr06G002637 Chr06 NC_080392.1:37969442-37969451promoter 内 1192-1201 bp + 2800 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 37972251-37975119(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr06G001513 Chr06 NC_080392.1:16189919-16189928promoter 内 1156-1165 bp - 2836 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 16185527-16187083(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 ATACCTACCT
SmilChr05G001954 Chr05 NC_080391.1:19985448-19985457promoter 内 1116-1125 bp + 2876 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 19980235-19982572(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTAT