转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G004480; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00029285-RA_Salv SmilChr07G004480 WRKY XP_057776222.1 MP00531 CTTTGACTTTTTT

可能结合的靶基因

9784 个结合位点 6663 个候选靶基因 第 15 / 134 下载 TSV

上一页 15 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000596 Chr02 NC_080388.1:8603507-8603519promoter 内 2362-2374 bp - 1627 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 8605146-8607318(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 GAAAAAGTCAAAT
SmilChr02G001270 Chr02 NC_080388.1:23259281-23259293promoter 内 2317-2329 bp - 1672 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 23248477-23257609(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTTTGACTTTTCC
SmilChr01G001606 Chr01 NC_080387.1:30219411-30219423promoter 内 1986-1998 bp + 2003 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 30216246-30217408(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 GGAAAAGTCAAAA
SmilChr01G003763 Chr01 NC_080387.1:56027589-56027601promoter 内 1873-1885 bp + 2116 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 56023758-56025473(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 ACAAAAGTCAACT
SmilChr01G004839 Chr01 NC_080387.1:66527105-66527117promoter 内 1555-1567 bp - 2434 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 66523337-66524671(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CTTTGACTTTGTC
SmilChr01G001459 Chr01 NC_080387.1:28353626-28353638promoter 内 1147-1159 bp - 2842 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 28356480-28359703(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 AGAAAAGTCAACT
SmilChr03G000842 Chr03 NC_080389.1:9609757-9609769promoter 内 1089-1101 bp - 2900 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 9612669-9613799(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TGAAAAGTCAACA
SmilChr02G004851 Chr02 NC_080388.1:70670499-70670511promoter 内 848-860 bp + 3141 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 70673652-70678006(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 AGTTGACTTTTCT
SmilChr02G002289 Chr02 NC_080388.1:40435316-40435328promoter 内 708-720 bp - 3281 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 40431150-40432035(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTTTGACTTTTGC
SmilChr02G002018 Chr02 NC_080388.1:36380447-36380459promoter 内 665-677 bp + 3324 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 36383783-36388678(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 AGTTGACTTTTCT
SmilChr01G005145 Chr01 NC_080387.1:69240910-69240922promoter 内 579-591 bp - 3410 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 69236880-69237500(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 AGTTGACTTTTCT
SmilChr01G001494 Chr01 NC_080387.1:28766943-28766955promoter 内 572-584 bp + 3417 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 28770372-28774508(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TGTTGACTTTTAT
SmilChr01G001015 Chr01 NC_080387.1:21315477-21315489promoter 内 368-380 bp + 3621 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 21319110-21321772(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CTTTGACTTTGTC
SmilChr01G004338 Chr01 NC_080387.1:61512327-61512339promoter 内 1058-1070 bp - 2931 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 4 61504998-61509396(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CTTTGACTTTTAA
SmilChr01G002437 Chr01 NC_080387.1:41965221-41965233promoter 内 2103-2115 bp + 1886 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 41959720-41963335(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CTAAAAGTCAACC
SmilChr02G004415 Chr02 NC_080388.1:66495208-66495220promoter 内 3962-3974 bp + 27 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 66495247-66496458(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CATTGACTTTTTC
SmilChr03G001039 Chr03 NC_080389.1:12113519-12113531promoter 内 3883-3895 bp - 106 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 12113637-12118189(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 ACAAAAGTCAAAC
SmilChr02G004407 Chr02 NC_080388.1:66389830-66389842promoter 内 3418-3430 bp + 571 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 66390413-66392292(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CTTTGACTTTTAA
SmilChr02G004405 Chr02 NC_080388.1:66378030-66378042promoter 内 3055-3067 bp + 934 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 66378976-66379335(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CTTTGACTTTTAA
SmilChr02G004082 Chr02 NC_080388.1:63100480-63100492promoter 内 2766-2778 bp - 1223 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 63097722-63099257(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CTTTGACTTTTAA
SmilChr01G003737 Chr01 NC_080387.1:55697724-55697736promoter 内 2357-2369 bp + 1632 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 55699368-55701398(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CTTTGACTTTTAA
SmilChr01G004727 Chr01 NC_080387.1:65453845-65453857promoter 内 2005-2017 bp - 1984 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 65449517-65451861(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CATTGACTTTTTC
SmilChr02G004406 Chr02 NC_080388.1:66389830-66389842promoter 内 1827-1839 bp + 2162 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 66385204-66387668(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTAAAAGTCAAAG
SmilChr03G000884 Chr03 NC_080389.1:10031073-10031085promoter 内 1805-1817 bp - 2184 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 10025259-10028889(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 GTTTGACTTTTTA
SmilChr02G004404 Chr02 NC_080388.1:66378030-66378042promoter 内 1723-1735 bp + 2266 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 66373233-66375764(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTAAAAGTCAAAG
SmilChr03G001376 Chr03 NC_080389.1:16246309-16246321promoter 内 1321-1333 bp - 2668 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 16248989-16250404(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TAAAAAGTCAAAC
SmilChr02G004162 Chr02 NC_080388.1:63954488-63954500promoter 内 1012-1024 bp - 2977 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 63947914-63951511(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 GTTTGACTTTTCT
SmilChr02G001743 Chr02 NC_080388.1:32025752-32025764promoter 内 678-690 bp - 3311 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 32018425-32022441(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 GGTTGACTTTTAG
SmilChr01G004490 Chr01 NC_080387.1:63033175-63033187promoter 内 492-504 bp + 3497 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 63036684-63038569(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CTTTGACTTTTAA
SmilChr02G004414 Chr02 NC_080388.1:66495208-66495220promoter 内 456-468 bp + 3533 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 66486928-66491675(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 GAAAAAGTCAATG
SmilChr01G003844 Chr01 NC_080387.1:56762630-56762642promoter 内 174-186 bp + 3815 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 56766457-56768587(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CTTTGACTTTTAA
SmilChr02G001667 Chr02 NC_080388.1:30941039-30941051promoter 内 92-104 bp + 3897 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 30944948-30946979(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CTTTGACTTTTAA
SmilChr03G000222 Chr03 NC_080389.1:2592878-2592890promoter 内 45-57 bp + 3944 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 2596834-2607793(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 GGTTGACTTTTAG
SmilChr01G001778 Chr01 NC_080387.1:32666580-32666592promoter 内 3909-3921 bp - 80 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 32666672-32668220(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 GAAAAAGTCAATG
SmilChr01G002501 Chr01 NC_080387.1:42847794-42847806promoter 内 3833-3845 bp - 156 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 42844910-42847638(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 GTTTGACTTTTGT
SmilChr03G000024 Chr03 NC_080389.1:364789-364801promoter 内 3648-3660 bp + 341 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 363541-364448(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTAAAAGTCAAAG
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