转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 16 / 151 下载 TSV

上一页 16 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000396 Chr02 NC_080388.1:4908786-4908798promoter 内 1203-1215 bp - 2786 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 2 4905569-4906000(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCTTA
SmilChr01G005017 Chr01 NC_080387.1:68172745-68172757promoter 内 1112-1124 bp - 2877 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 2 68167299-68169868(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCCAT
SmilChr01G001362 Chr01 NC_080387.1:26973170-26973182promoter 内 88-100 bp - 3901 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 2 26968437-26969269(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCCCT
SmilChr04G001978 Chr04 NC_080390.1:32055313-32055325promoter 内 3927-3939 bp - 62 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 32052541-32055251(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCCCT
SmilChr04G001980 Chr04 NC_080390.1:32064751-32064763promoter 内 3927-3939 bp - 62 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 32062028-32064689(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCCCT
SmilChr04G001979 Chr04 NC_080390.1:32060557-32060569promoter 内 3922-3934 bp - 67 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 32056113-32060490(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCCCT
SmilChr02G001364 Chr02 NC_080388.1:25621424-25621436promoter 内 3691-3703 bp - 298 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 25615077-25621126(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCTAG
SmilChr02G003000 Chr02 NC_080388.1:50676342-50676354promoter 内 3248-3260 bp - 741 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 50677095-50677959(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTGGTAGGTAGA
SmilChr01G003605 Chr01 NC_080387.1:54585893-54585905promoter 内 3220-3232 bp + 769 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 54584642-54585124(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTGGTAGGTAGA
SmilChr05G000444 Chr05 NC_080391.1:3377976-3377988promoter 内 3190-3202 bp + 799 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 3375357-3377177(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGGGTAGGTGGA
SmilChr02G002133 Chr02 NC_080388.1:38388005-38388017promoter 内 2921-2933 bp - 1068 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 38384804-38386937(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTTTC
SmilChr02G004732 Chr02 NC_080388.1:69563161-69563173promoter 内 2554-2566 bp - 1435 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 69555676-69561726(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCTCA
SmilChr03G003702 Chr03 NC_080389.1:55966634-55966646promoter 内 2143-2155 bp + 1846 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 55968492-55972000(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCTCA
SmilChr03G004018 Chr03 NC_080389.1:59168426-59168438promoter 内 1998-2010 bp - 1991 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 59170429-59175337(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAGGTAGGTAAA
SmilChr01G002326 Chr01 NC_080387.1:40353675-40353687promoter 内 1745-1757 bp + 2244 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 40345066-40351431(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGAGGTAGGTAAA
SmilChr01G002317 Chr01 NC_080387.1:40169311-40169323promoter 内 1732-1744 bp + 2257 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 40161020-40167054(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGAGGTAGGTAAA
SmilChr01G003604 Chr01 NC_080387.1:54585893-54585905promoter 内 1628-1640 bp + 2361 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 54580869-54583532(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTGGTAGGTAGA
SmilChr03G004182 Chr03 NC_080389.1:60537283-60537295promoter 内 1626-1638 bp - 2363 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 60539658-60542483(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTGGTAGGTAGA
SmilChr02G003001 Chr02 NC_080388.1:50676342-50676354promoter 内 1357-1369 bp - 2632 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 50678986-50681683(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTGGTAGGTAGA
SmilChr01G003030 Chr01 NC_080387.1:49347579-49347591promoter 内 897-909 bp - 3092 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 49350683-49353052(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATAGTAGGTAAG
SmilChr01G003308 Chr01 NC_080387.1:51770423-51770435promoter 内 544-556 bp + 3445 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 51773880-51777439(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCTCA
SmilChr04G003026 Chr04 NC_080390.1:46690152-46690164promoter 内 377-389 bp - 3612 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 46686434-46686540(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCTCA
SmilChr01G004639 Chr01 NC_080387.1:64430172-64430184promoter 内 341-353 bp - 3648 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 64425773-64426524(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCTTA
SmilChr02G003791 Chr02 NC_080388.1:59565187-59565199promoter 内 102-114 bp - 3887 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 1 59569086-59572242(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGAAGTAGGTAGG
SmilChr01G002584 Chr01 NC_080387.1:43971482-43971494promoter 内 3446-3458 bp - 543 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 3 43970859-43970939(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACCCAT
SmilChr02G003542 Chr02 NC_080388.1:56584951-56584963promoter 内 3213-3225 bp + 776 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 3 56585739-56586593(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCACA
SmilChr01G000247 Chr01 NC_080387.1:4650525-4650537promoter 内 3769-3781 bp - 220 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 4649148-4650305(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACCTCA
SmilChr04G003632 Chr04 NC_080390.1:52830272-52830284promoter 内 3507-3519 bp - 482 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 52826978-52829790(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCACA
SmilChr05G001021 Chr05 NC_080391.1:8376027-8376039promoter 内 1957-1969 bp + 2032 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 8371112-8373995(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTAGA
SmilChr04G003308 Chr04 NC_080390.1:49815433-49815445promoter 内 876-888 bp + 3113 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 49818558-49827362(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCACA
SmilChr05G001175 Chr05 NC_080391.1:9851076-9851088promoter 内 753-765 bp + 3236 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 9842817-9847840(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTAAA
SmilChr02G005422 Chr02 NC_080388.1:74686856-74686868promoter 内 430-442 bp - 3559 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 74681555-74683297(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCATA
SmilChr04G001549 Chr04 NC_080390.1:25586679-25586691promoter 内 3673-3685 bp - 316 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 25585530-25586363(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTCACCTACCAAC
SmilChr04G003750 Chr04 NC_080390.1:53780781-53780793promoter 内 3493-3505 bp - 496 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 53781289-53789135(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCAGGTAGGTGGA
SmilChr03G001056 Chr03 NC_080389.1:12285551-12285563promoter 内 3485-3497 bp + 504 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 12282066-12285047(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGAGGTAGGTAGA
SmilChr03G001898 Chr03 NC_080389.1:26524669-26524681promoter 内 3265-3277 bp + 724 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 26518850-26523945(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTAAA
SmilChr01G000666 Chr01 NC_080387.1:14818304-14818316promoter 内 3089-3101 bp + 900 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 14814848-14817404(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGAGGTAGGTAGA
SmilChr03G001948 Chr03 NC_080389.1:27809908-27809920promoter 内 2960-2972 bp - 1029 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 27810949-27815999(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTAAA
SmilChr02G000712 Chr02 NC_080388.1:11481237-11481249promoter 内 2813-2825 bp + 1176 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 11478624-11480061(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTGGGTAGGTGAG
SmilChr02G005329 Chr02 NC_080388.1:74144789-74144801promoter 内 2448-2460 bp - 1541 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 74141865-74143248(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCACA
SmilChr01G003285 Chr01 NC_080387.1:51540132-51540144promoter 内 2254-2266 bp - 1735 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 51535512-51538397(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCACA
SmilChr02G001503 Chr02 NC_080388.1:28079294-28079306promoter 内 2178-2190 bp - 1811 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 28074760-28077483(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCAAG
SmilChr01G005060 Chr01 NC_080387.1:68515974-68515986promoter 内 2111-2123 bp + 1878 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 68517864-68519444(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCATA
SmilChr01G004853 Chr01 NC_080387.1:66711107-66711119promoter 内 1762-1774 bp - 2227 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 66713346-66725072(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTAAA
SmilChr03G001497 Chr03 NC_080389.1:18278231-18278243promoter 内 1602-1614 bp + 2387 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 18280630-18288688(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCACA
SmilChr03G001600 Chr03 NC_080389.1:20337251-20337263promoter 内 1519-1531 bp - 2470 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 20332193-20334781(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCAAG
SmilChr01G000024 Chr01 NC_080387.1:448409-448421promoter 内 1364-1376 bp - 2625 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 451046-452337(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTGGGTAGGTGAG
SmilChr03G000232 Chr03 NC_080389.1:2757680-2757692promoter 内 1351-1363 bp - 2638 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 2752746-2755042(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCAAG
SmilChr04G003124 Chr04 NC_080390.1:47856941-47856953promoter 内 899-911 bp + 3090 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 47851420-47853851(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATCGGTAGGTGAG
SmilChr04G000148 Chr04 NC_080390.1:1293935-1293947promoter 内 684-696 bp + 3305 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 1297252-1299763(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCATA