转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G004392; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022653-RA_Salv SmilChr05G004392 WRKY XP_057811204.1 MP00506 AAAAGTCAACGAC

可能结合的靶基因

9818 个结合位点 7173 个候选靶基因 第 17 / 144 下载 TSV

上一页 17 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000720 Chr01 NC_080387.1:16113926-16113938promoter 内 235-247 bp - 3754 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 5 16117692-16118649(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AACGTTGACTTGG
SmilChr03G000607 Chr03 NC_080389.1:6708437-6708449promoter 内 2584-2596 bp + 1405 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 6706463-6707032(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GACTTTGACTTTG
SmilChr01G000976 Chr01 NC_080387.1:20637297-20637309promoter 内 1527-1539 bp - 2462 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 20630201-20634835(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAAAGTCAACATC
SmilChr01G000483 Chr01 NC_080387.1:9895445-9895457promoter 内 1098-1110 bp - 2891 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 9898348-9899628(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGTGTTGACTTTG
SmilChr02G001274 Chr02 NC_080388.1:23376989-23377001promoter 内 3472-3484 bp - 517 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 23377518-23380899(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGCGTTGACCTCC
SmilChr03G004515 Chr03 NC_080389.1:63200531-63200543promoter 内 3092-3104 bp - 897 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 63201440-63202039(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AACGTTGACTTGG
SmilChr02G003070 Chr02 NC_080388.1:51558260-51558272promoter 内 2838-2850 bp + 1151 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 51559423-51561003(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAAGGTCAACGAA
SmilChr04G001217 Chr04 NC_080390.1:18999896-18999908promoter 内 2813-2825 bp - 1176 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 18996105-18998720(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAAAGTCAACATC
SmilChr04G001218 Chr04 NC_080390.1:19016192-19016204promoter 内 2410-2422 bp + 1579 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 19017783-19019467(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAACACA
SmilChr03G004513 Chr03 NC_080389.1:63200531-63200543promoter 内 868-880 bp - 3121 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 63193169-63197410(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCAAGTCAACGTT
SmilChr01G001828 Chr01 NC_080387.1:33215063-33215075promoter 内 3915-3927 bp + 74 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 33215149-33216677(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAAAGTC
SmilChr01G001182 Chr01 NC_080387.1:23880241-23880253promoter 内 3876-3888 bp - 113 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 23866677-23880128(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGAGGTCAACGCT
SmilChr02G002411 Chr02 NC_080388.1:42085815-42085827promoter 内 3239-3251 bp + 750 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 42084993-42085065(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AACGTTGACTTGG
SmilChr03G004514 Chr03 NC_080389.1:63200531-63200543promoter 内 2926-2938 bp - 1063 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 63198775-63199468(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCAAGTCAACGTT
SmilChr03G002873 Chr03 NC_080389.1:45408350-45408362promoter 内 2777-2789 bp + 1212 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 45395002-45407138(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGTGTTGACTTTG
SmilChr01G004455 Chr01 NC_080387.1:62673108-62673120promoter 内 2737-2749 bp - 1252 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 62668522-62671856(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAAAGCA
SmilChr01G001493 Chr01 NC_080387.1:28735443-28735455promoter 内 2623-2635 bp - 1366 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 28736821-28737817(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TTCGTTGACTATC
SmilChr02G002731 Chr02 NC_080388.1:47225880-47225892promoter 内 2602-2614 bp - 1387 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 47227279-47232620(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCAGTTGACTTTC
SmilChr01G001596 Chr01 NC_080387.1:30096339-30096351promoter 内 2576-2588 bp + 1413 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 30093211-30094926(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGTGTTGACTTTG
SmilChr02G000299 Chr02 NC_080388.1:3769329-3769341promoter 内 1914-1926 bp + 2075 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 3771416-3774441(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAAAGTC
SmilChr03G002036 Chr03 NC_080389.1:30718923-30718935promoter 内 1629-1641 bp - 2360 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 30721295-30721639(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGCGTTGACTATA
SmilChr04G001543 Chr04 NC_080390.1:25530510-25530522promoter 内 1454-1466 bp + 2535 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 25524323-25527975(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GACTTTGACTTTG
SmilChr04G001168 Chr04 NC_080390.1:17399882-17399894promoter 内 1404-1416 bp + 2585 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 17402479-17402584(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TATAGTCAACGCA
SmilChr03G002482 Chr03 NC_080389.1:39405852-39405864promoter 内 1364-1376 bp + 2625 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 39408489-39409055(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGTAGTCAACGAC
SmilChr03G000100 Chr03 NC_080389.1:1119628-1119640promoter 内 1136-1148 bp + 2853 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 1114004-1116775(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCCGTTGACTCTC
SmilChr01G000272 Chr01 NC_080387.1:5411304-5411316promoter 内 1098-1110 bp + 2891 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 5414207-5415073(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GATGGTCAACGAC
SmilChr03G001355 Chr03 NC_080389.1:15922646-15922658promoter 内 708-720 bp + 3281 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 15917647-15919365(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTCGTTGACTACT
SmilChr02G002690 Chr02 NC_080388.1:46600896-46600908promoter 内 605-617 bp + 3384 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 46604292-46608803(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAAAGTCAACATC
SmilChr03G004516 Chr03 NC_080389.1:63200531-63200543promoter 内 520-532 bp - 3469 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 63204012-63205192(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AACGTTGACTTGG
SmilChr03G001063 Chr03 NC_080389.1:12337892-12337904promoter 内 42-54 bp + 3947 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 12332113-12333945(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AACGTTGACTTGG
SmilChr04G000959 Chr04 NC_080390.1:12735935-12735947promoter 内 3795-3807 bp - 194 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 12736141-12739004(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGTGTTGACTTTG
SmilChr03G002078 Chr03 NC_080389.1:31897058-31897070promoter 内 3565-3577 bp + 424 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 31897494-31903418(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAACACA
SmilChr03G001227 Chr03 NC_080389.1:14160326-14160338promoter 内 3521-3533 bp + 468 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 14160806-14162209(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAAAGTCAACATC
SmilChr03G001697 Chr03 NC_080389.1:22519919-22519931promoter 内 3430-3442 bp - 559 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 22520490-22521910(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGCGTTGACCTCC
SmilChr03G004275 Chr03 NC_080389.1:61203720-61203732promoter 内 3425-3437 bp - 564 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 61201250-61203156(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATAAGTCAACGTT
SmilChr03G003833 Chr03 NC_080389.1:57476577-57476589promoter 内 3361-3373 bp - 628 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 57472549-57475949(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATAAGTCAACGTT
SmilChr01G001991 Chr01 NC_080387.1:35319471-35319483promoter 内 3313-3325 bp - 676 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 35320159-35325141(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CACGTTGACTTGT
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SmilChr03G002709 Chr03 NC_080389.1:43046713-43046725promoter 内 2271-2283 bp + 1718 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 43048443-43049618(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATAAGTCAACGTT
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SmilChr03G000269 Chr03 NC_080389.1:3106810-3106822promoter 内 2010-2022 bp - 1979 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 3100105-3104831(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ACAAGTCAACGTG