转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G002503; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027448-RA_Salv SmilChr03G002503 MYB XP_057801356.1 MP00482 AAAATATGACCGTTG

可能结合的靶基因

8940 个结合位点 6899 个候选靶基因 第 18 / 138 下载 TSV

上一页 18 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004882 Chr01 NC_080387.1:66895814-66895828promoter 内 3878-3892 bp - 109 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 66895028-66895705(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAATATCAACCGTTG
SmilChr03G003726 Chr03 NC_080389.1:56287146-56287160promoter 内 3873-3887 bp + 114 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 56287274-56287975(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TTTTAATGACCGTTG
SmilChr02G001567 Chr02 NC_080388.1:29072283-29072297promoter 内 3633-3647 bp + 354 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 29072651-29074053(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TCGATCTGACCGTTG
SmilChr04G003882 Chr04 NC_080390.1:54663063-54663077promoter 内 3374-3388 bp - 613 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 54663690-54664205(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGTCGGTTTTC
SmilChr02G004506 Chr02 NC_080388.1:67603147-67603161promoter 内 3353-3367 bp + 634 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 67601581-67602513(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGTCAAAAATA
SmilChr07G000880 Chr07 NC_080393.1:6293894-6293908promoter 内 3352-3366 bp + 635 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 6294543-6298210(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TTAATTCGACCGTTG
SmilChr01G001673 Chr01 NC_080387.1:30878853-30878867promoter 内 3189-3203 bp + 798 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 30879665-30882603(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TTAATTCGACCGTTG
SmilChr01G004046 Chr01 NC_080387.1:58899940-58899954promoter 内 2983-2997 bp - 1004 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 58898460-58898936(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAATTCAGACCGTTG
SmilChr05G003498 Chr05 NC_080391.1:46648654-46648668promoter 内 2792-2806 bp + 1195 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 46643576-46647459(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTTAAAATGA
SmilChr07G001860 Chr07 NC_080393.1:16135013-16135027promoter 内 2685-2699 bp - 1302 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 16127593-16133711(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AGATATCGACCGTTG
SmilChr04G001858 Chr04 NC_080390.1:30266151-30266165promoter 内 2480-2494 bp + 1507 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 30267672-30268295(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TGGATTTGACCGTTG
SmilChr04G001542 Chr04 NC_080390.1:25481929-25481943promoter 内 2290-2304 bp + 1697 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 25478118-25480232(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAACGGTCACAATTT
SmilChr02G000738 Chr02 NC_080388.1:11957967-11957981promoter 内 1719-1733 bp + 2268 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 11952330-11955699(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTTGAAATTC
SmilChr04G002237 Chr04 NC_080390.1:36092746-36092760promoter 内 1699-1713 bp + 2288 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 36095048-36120297(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAATCTTAACCGTTG
SmilChr04G003805 Chr04 NC_080390.1:54230902-54230916promoter 内 1676-1690 bp + 2311 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 54233227-54237726(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAATTTAGACCGTTG
SmilChr01G004471 Chr01 NC_080387.1:62807104-62807118promoter 内 1659-1673 bp + 2328 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 62801628-62804776(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAACGGTCACAATTT
SmilChr02G003375 Chr02 NC_080388.1:54891923-54891937promoter 内 1643-1657 bp - 2344 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 54887308-54889579(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 GGGTTCTGACCGTTG
SmilChr07G001862 Chr07 NC_080393.1:16135013-16135027promoter 内 1640-1654 bp - 2347 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 16137374-16139517(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCGATATCT
SmilChr01G004047 Chr01 NC_080387.1:58899940-58899954promoter 内 1598-1612 bp - 2389 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 58902343-58908090(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCTGAATTT
SmilChr07G003531 Chr07 NC_080393.1:40613124-40613138promoter 内 1598-1612 bp + 2389 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 40603011-40610735(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCAAAGATT
SmilChr02G004507 Chr02 NC_080388.1:67603147-67603161promoter 内 1219-1233 bp + 2768 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 67605929-67611060(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TATTTTTGACCGTTA
SmilChr01G002508 Chr01 NC_080387.1:42970541-42970555promoter 内 1208-1222 bp - 2779 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 42964801-42967762(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAATTGTGACCGTTT
SmilChr04G001970 Chr04 NC_080390.1:31920834-31920848promoter 内 1187-1201 bp + 2800 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 31923648-31925144(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAATTGTGACCGTTT
SmilChr01G004908 Chr01 NC_080387.1:67112386-67112400promoter 内 1126-1140 bp + 2861 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 67115261-67119955(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 ACTAATTAACCGTTG
SmilChr02G002194 Chr02 NC_080388.1:39162071-39162085promoter 内 942-956 bp - 3045 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 39158517-39159026(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 GAGATAGGACCGTTG
SmilChr07G000193 Chr07 NC_080393.1:1219784-1219798promoter 内 828-842 bp - 3159 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 1222957-1223947(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGTCATTATGG
SmilChr04G003883 Chr04 NC_080390.1:54663063-54663077promoter 内 669-683 bp - 3318 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 54666395-54668033(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGTCGGTTTTC
SmilChr02G004508 Chr02 NC_080388.1:67603147-67603161promoter 内 275-289 bp + 3712 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 67606873-67625971(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TATTTTTGACCGTTA
SmilChr07G000454 Chr07 NC_080393.1:3210732-3210746promoter 内 90-104 bp + 3897 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 3202805-3206835(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTTAATTAGT
SmilChr03G001126 Chr03 NC_080389.1:12977030-12977044promoter 内 2718-2732 bp + 1269 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 5 12973581-12975761(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTAAGTTTAG
SmilChr06G001410 Chr06 NC_080392.1:14797250-14797264promoter 内 1068-1082 bp + 2919 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 14791516-14794331(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAACGGTCAAATTTT
SmilChr01G003818 Chr01 NC_080387.1:56534583-56534597promoter 内 778-792 bp - 3209 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 56537806-56542793(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAACGGTCAAATTTT
SmilChr02G003175 Chr02 NC_080388.1:52877624-52877638promoter 内 3840-3854 bp - 147 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 52871820-52877477(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAAATTTGACCGTTT
SmilChr08G001458 Chr08 NC_080394.1:11748578-11748592promoter 内 3836-3850 bp + 151 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 11748743-11749744(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TTGATTTGACCGTTG
SmilChr05G002477 Chr05 NC_080391.1:27287456-27287470promoter 内 3823-3837 bp + 164 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 27287634-27290339(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAAATTTGACCGTTT
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