转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G001094; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021820-RA_Salv SmilChr04G001094 WRKY XP_057804404.1 MP00408 AGCGTTGACTTTT

可能结合的靶基因

9902 个结合位点 8149 个候选靶基因 第 19 / 163 下载 TSV

上一页 19 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G000622 Chr08 NC_080394.1:4654572-4654584promoter 内 124-136 bp + 3865 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 4650150-4650707(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAGAGTCAACGCG
SmilChr02G001730 Chr02 NC_080388.1:31790182-31790194promoter 内 2749-2761 bp - 1240 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 4 31788837-31788942(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CACGTTGACCTTT
SmilChr01G000360 Chr01 NC_080387.1:7427034-7427046promoter 内 2737-2749 bp - 1252 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 4 7425677-7425782(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CACGTTGACCTTT
SmilChr07G003679 Chr07 NC_080393.1:44259427-44259439promoter 内 2737-2749 bp - 1252 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 4 44258070-44258175(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CACGTTGACCTTT
SmilChr02G005359 Chr02 NC_080388.1:74310717-74310729promoter 内 3880-3892 bp + 109 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 74307777-74310608(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAAGTCAACCCT
SmilChr01G003138 Chr01 NC_080387.1:50166727-50166739promoter 内 3851-3863 bp + 138 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 50165129-50166589(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAAGTCAACGAG
SmilChr05G001551 Chr05 NC_080391.1:14247613-14247625promoter 内 609-621 bp + 3380 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 14241996-14244233(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAGGTCAACGAA
SmilChr03G002262 Chr03 NC_080389.1:35611655-35611667promoter 内 37-49 bp + 3952 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 35615619-35619293(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGCGTTGACTTGA
SmilChr08G000678 Chr08 NC_080394.1:5045640-5045652promoter 内 3932-3944 bp + 57 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 5045709-5047392(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGGGTTGACTTTC
SmilChr01G006014 Chr01 NC_080387.1:75730677-75730689promoter 内 3516-3528 bp + 473 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 75731162-75732955(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGCGTTGACTTGA
SmilChr02G003733 Chr02 NC_080388.1:58969712-58969724promoter 内 3354-3366 bp - 635 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 58964002-58969077(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGGGTTGACTTTG
SmilChr04G002544 Chr04 NC_080390.1:40743748-40743760promoter 内 2054-2066 bp - 1935 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 40741741-40741813(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGGGTTGACTTTC
SmilChr01G003044 Chr01 NC_080387.1:49426915-49426927promoter 内 1979-1991 bp - 2010 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 49421625-49424905(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGCGTTGACTTGA
SmilChr04G002543 Chr04 NC_080390.1:40743748-40743760promoter 内 1815-1827 bp - 2174 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 40739975-40741574(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGGGTTGACTTTC
SmilChr07G003689 Chr07 NC_080393.1:44424301-44424313promoter 内 1575-1587 bp + 2414 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 44420679-44421887(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAAGTCAACGAG
SmilChr04G003634 Chr04 NC_080390.1:52849231-52849243promoter 内 1316-1328 bp + 2673 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 52851916-52854425(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CTCGTTGACTTCT
SmilChr05G001283 Chr05 NC_080391.1:10977109-10977121promoter 内 835-847 bp - 3154 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 10969983-10973955(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TGAGTTGACTTTT
SmilChr07G004629 Chr07 NC_080393.1:59142761-59142773promoter 内 158-170 bp - 3831 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 59146604-59161952(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAACTCA
SmilChr01G005416 Chr01 NC_080387.1:71376254-71376266promoter 内 3935-3947 bp - 54 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 71373066-71376200(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TGAGTTGACTTTT
SmilChr02G004899 Chr02 NC_080388.1:71005553-71005565promoter 内 3893-3905 bp - 96 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 71005661-71008497(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAAAGTCAACCCC
SmilChr02G004338 Chr02 NC_080388.1:65630241-65630253promoter 内 3888-3900 bp - 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 65619917-65630140(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TGAGTTGACTTTT
SmilChr03G004740 Chr03 NC_080389.1:64530224-64530236promoter 内 3771-3783 bp - 218 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 64530454-64539570(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAACTCA
SmilChr02G004885 Chr02 NC_080388.1:70932535-70932547promoter 内 3634-3646 bp + 355 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 70929384-70932180(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAACTCA
SmilChr04G003585 Chr04 NC_080390.1:52286644-52286656promoter 内 3634-3646 bp + 355 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 52285399-52286289(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAAGTCAACTGT
SmilChr05G002833 Chr05 NC_080391.1:33670912-33670924promoter 内 3539-3551 bp - 450 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 33666258-33670462(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGCGTTGACTTGA
SmilChr03G001105 Chr03 NC_080389.1:12723257-12723269promoter 内 3435-3447 bp + 554 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 12723823-12724932(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACAGTTGACTTTG
SmilChr07G004029 Chr07 NC_080393.1:51420115-51420127promoter 内 3283-3295 bp + 706 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 51417157-51419409(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GTAAGTCAACGGA
SmilChr03G001398 Chr03 NC_080389.1:16600615-16600627promoter 内 3279-3291 bp - 710 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 16601337-16604106(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAAAGTCAACTGC
SmilChr02G001871 Chr02 NC_080388.1:33992684-33992696promoter 内 3206-3218 bp + 783 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 33990153-33991901(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAACTCA
SmilChr07G004577 Chr07 NC_080393.1:58555777-58555789promoter 内 3111-3123 bp + 878 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 58554300-58554899(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAAAGTCAACTGC
SmilChr07G004628 Chr07 NC_080393.1:59128181-59128193promoter 内 2979-2991 bp - 1010 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 59121469-59127171(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TGAGTTGACTTTT
SmilChr02G003962 Chr02 NC_080388.1:61783010-61783022promoter 内 2922-2934 bp + 1067 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 61784089-61785619(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTCGTTGACCTTT
SmilChr07G001773 Chr07 NC_080393.1:15026109-15026121promoter 内 2754-2766 bp + 1235 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 15027356-15032190(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TGAGTTGACTTTT
SmilChr02G002731 Chr02 NC_080388.1:47225880-47225892promoter 内 2602-2614 bp + 1387 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 47227279-47232620(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAGTTGACTTTC
SmilChr04G001670 Chr04 NC_080390.1:27658392-27658404promoter 内 2469-2481 bp - 1520 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 27655301-27656872(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACAGTTGACTTTG
SmilChr06G000348 Chr06 NC_080392.1:2633973-2633985promoter 内 2276-2288 bp - 1713 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 2635698-2637976(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAACTCA
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