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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G003597; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008984-RA_Salv SmilChr07G003597 Nin-like XP_057773587.1 MP00449 ATTTGGCTTTTCGGA

可能结合的靶基因

9453 个结合位点 8096 个候选靶基因 第 2 / 162 下载 TSV

上一页 2 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001320 Chr03 NC_080389.1:15457185-15457199promoter 内 152-166 bp + 3835 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 15461034-15462749(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TTTTGGCTCTTGAGG
SmilChr01G000656 Chr01 NC_080387.1:14620497-14620511promoter 内 2901-2915 bp - 1086 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 14614324-14619411(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CTTTGGCTTTTCGGA
SmilChr01G000664 Chr01 NC_080387.1:14778348-14778362promoter 内 2489-2503 bp - 1498 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 14779860-14782457(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TCCGAAAAGCCATGT
SmilChr05G001442 Chr05 NC_080391.1:13167316-13167330promoter 内 2048-2062 bp + 1939 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 13163469-13165377(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CACGAAAAGCCAAAT
SmilChr03G002261 Chr03 NC_080389.1:35621270-35621284promoter 内 1850-1864 bp - 2137 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 35615352-35619133(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ATTTGGCTTTTCGTG
SmilChr01G000663 Chr01 NC_080387.1:14778348-14778362promoter 内 1841-1855 bp - 2146 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 14773813-14776202(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ACATGGCTTTTCGGA
SmilChr03G001206 Chr03 NC_080389.1:13913389-13913403promoter 内 1667-1681 bp - 2320 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 13915723-13917553(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ACCCAAGAGCCAAAA
SmilChr08G000857 Chr08 NC_080394.1:6353997-6354011promoter 内 1486-1500 bp - 2501 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 6349574-6351496(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TTGTGGCTTTTCAGG
SmilChr03G000111 Chr03 NC_080389.1:1228902-1228916promoter 内 3883-3897 bp + 104 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 1229020-1261784(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TTTTGGCTTTTGGGA
SmilChr04G003385 Chr04 NC_080390.1:50408286-50408300promoter 内 3749-3763 bp - 238 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 50408538-50410232(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CCCGAAAAGCCAGAA
SmilChr01G000030 Chr01 NC_080387.1:546275-546289promoter 内 3622-3636 bp - 365 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 544795-545910(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ATTTGGCTTTTGGGT
SmilChr03G000118 Chr03 NC_080389.1:1293837-1293851promoter 内 3538-3552 bp + 449 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 1294300-1298309(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TTTTGGCTTTTGGGA
SmilChr01G003706 Chr01 NC_080387.1:55417248-55417262promoter 内 3398-3412 bp + 589 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 55417851-55420324(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TTATGGCTTTTCGGA
SmilChr08G004041 Chr08 NC_080394.1:48888700-48888714promoter 内 3146-3160 bp - 841 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 48889555-48890431(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TTCCAAAGGCCAAAT
SmilChr08G002596 Chr08 NC_080394.1:25295213-25295227promoter 内 2982-2996 bp - 1005 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 25296232-25296627(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CCTCAAAAGCCAATT
SmilChr07G000294 Chr07 NC_080393.1:1908826-1908840promoter 内 2624-2638 bp - 1363 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 1910203-1911193(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ACCCAAAAGCCAAAT
SmilChr07G002155 Chr07 NC_080393.1:19725119-19725133promoter 内 2546-2560 bp - 1441 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 19721931-19723678(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 AGTTGGCTTTTGAGG
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SmilChr08G001516 Chr08 NC_080394.1:12306798-12306812promoter 内 2358-2372 bp + 1629 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 12302852-12305169(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ACCCAAAAGCCAAAT
SmilChr01G000029 Chr01 NC_080387.1:546275-546289promoter 内 2282-2296 bp - 1705 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 543996-544570(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ATTTGGCTTTTGGGT
SmilChr05G002639 Chr05 NC_080391.1:29794138-29794152promoter 内 1883-1897 bp - 2104 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 29796256-29798104(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TCCCAAAAGCCAAAA
SmilChr01G003704 Chr01 NC_080387.1:55417248-55417262promoter 内 1741-1755 bp + 2246 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 55410798-55415002(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TCCGAAAAGCCATAA
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SmilChr04G003626 Chr04 NC_080390.1:52741497-52741511promoter 内 989-1003 bp - 2998 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 52744509-52747697(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CCTGAAAAGCCATCT
SmilChr08G003215 Chr08 NC_080394.1:32964650-32964664promoter 内 847-861 bp - 3140 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 32957702-32961510(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TTTTGGCTTTTGGGA
SmilChr07G002022 Chr07 NC_080393.1:18167733-18167747promoter 内 640-654 bp - 3347 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 18171094-18179555(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TCCCAAAAGCCAAAA
SmilChr05G000305 Chr05 NC_080391.1:2319706-2319720promoter 内 556-570 bp - 3431 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 2314617-2316275(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CTTTGGCTCTTCGGC
SmilChr01G000028 Chr01 NC_080387.1:546275-546289promoter 内 76-90 bp - 3911 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 541403-542364(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ATTTGGCTTTTGGGT
SmilChr02G002071 Chr02 NC_080388.1:37292712-37292726promoter 内 29-43 bp - 3958 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 37296684-37298030(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 CACGAAAAGCCAAAT
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SmilChr04G003163 Chr04 NC_080390.1:48258683-48258697promoter 内 2462-2476 bp + 1525 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 48260222-48264857(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 AAATGGCTTTTCGAG
SmilChr07G002512 Chr07 NC_080393.1:23810287-23810301promoter 内 2374-2388 bp + 1613 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 23811914-23811985(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 AGATGGCTTTTCGGC
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SmilChr01G002724 Chr01 NC_080387.1:45585588-45585602promoter 内 1300-1314 bp - 2687 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 45581067-45582901(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TATTGGCTTTTGGGA
SmilChr01G000790 Chr01 NC_080387.1:17175401-17175415promoter 内 711-725 bp - 3276 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 17178691-17181537(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TCCCAAAAGCCAACA
SmilChr08G001707 Chr08 NC_080394.1:14285443-14285457promoter 内 225-239 bp - 3762 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 14277072-14281681(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TGATGGCTTTTCGGA
SmilChr01G005204 Chr01 NC_080387.1:69713491-69713505promoter 内 3479-3493 bp - 508 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 69712303-69712983(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ACATGCCCTTTCGGA
SmilChr01G005205 Chr01 NC_080387.1:69712640-69712654promoter 内 3317-3331 bp + 670 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 69713324-69713804(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ACATGCCCTTTCGGA
SmilChr01G005209 Chr01 NC_080387.1:69731165-69731179promoter 内 3164-3178 bp + 823 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 69732002-69732558(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ACATGCCCTTTCGGA
SmilChr01G005240 Chr01 NC_080387.1:69952736-69952750promoter 内 3023-3037 bp + 964 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 69953714-69954297(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ACATGCCCTTTCGGA
SmilChr05G004386 Chr05 NC_080391.1:57333240-57333254promoter 内 2939-2953 bp - 1048 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 57328916-57332192(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TTGTGGCTTTTGGGA
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SmilChr01G005213 Chr01 NC_080387.1:69740870-69740884promoter 内 2113-2127 bp - 1874 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 69742758-69744892(+) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 TCCGAAAGGGCATGT
SmilChr01G005211 Chr01 NC_080387.1:69740870-69740884promoter 内 1923-1937 bp - 2064 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 69738297-69738806(-) SMil_00008984-RA_Salv MP00449 ACATGCCCTTTCGGA