转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 23 / 136 下载 TSV

上一页 23 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004686 Chr01 NC_080387.1:64930546-64930556promoter 内 3469-3479 bp - 522 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 64926181-64930024(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCCCAGCGCG
SmilChr02G002212 Chr02 NC_080388.1:39369690-39369700promoter 内 3417-3427 bp - 574 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 39370274-39370975(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGCT
SmilChr07G003378 Chr07 NC_080393.1:36484194-36484204promoter 内 3334-3344 bp - 657 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 36481870-36483537(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGGA
SmilChr02G004005 Chr02 NC_080388.1:62378840-62378850promoter 内 3090-3100 bp + 901 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 62379751-62380769(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCCCAGCGCG
SmilChr04G003176 Chr04 NC_080390.1:48441893-48441903promoter 内 2854-2864 bp + 1137 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 48437990-48440756(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGCT
SmilChr02G003292 Chr02 NC_080388.1:54197712-54197722promoter 内 2513-2523 bp - 1478 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 54190962-54196234(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGGA
SmilChr01G005645 Chr01 NC_080387.1:72858761-72858771promoter 内 2220-2230 bp + 1771 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 72860542-72865349(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCCCAGCGCG
SmilChr04G001170 Chr04 NC_080390.1:17512995-17513005promoter 内 2215-2225 bp - 1776 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 17505225-17511219(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGGA
SmilChr01G004689 Chr01 NC_080387.1:64930546-64930556promoter 内 2164-2174 bp - 1827 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 64932383-64934344(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGCC
SmilChr05G002226 Chr05 NC_080391.1:23796486-23796496promoter 内 2135-2145 bp + 1856 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 23789694-23794630(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGCT
SmilChr03G002398 Chr03 NC_080389.1:37991168-37991178promoter 内 1939-1949 bp - 2052 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 37985835-37989116(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCCCAGCGCG
SmilChr06G002733 Chr06 NC_080392.1:39483270-39483280promoter 内 1860-1870 bp - 2131 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 39472934-39481139(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGGA
SmilChr04G002243 Chr04 NC_080390.1:36227721-36227731promoter 内 1749-1759 bp + 2242 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 36223288-36225479(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGCC
SmilChr04G002038 Chr04 NC_080390.1:33099827-33099837promoter 内 1285-1295 bp + 2706 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 33096335-33097121(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGCT
SmilChr02G002637 Chr02 NC_080388.1:45760840-45760850promoter 内 1258-1268 bp - 2733 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 45763583-45764729(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGCT
SmilChr04G001788 Chr04 NC_080390.1:29328631-29328641promoter 内 1188-1198 bp + 2803 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 29324042-29325828(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGCT
SmilChr06G001166 Chr06 NC_080392.1:11882805-11882815promoter 内 953-963 bp - 3038 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 11885853-11890169(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGCT
SmilChr07G003325 Chr07 NC_080393.1:35489239-35489249promoter 内 951-961 bp + 3040 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 35492289-35494714(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCCCAGCGCG
SmilChr02G001147 Chr02 NC_080388.1:20868152-20868162promoter 内 465-475 bp - 3526 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 20871688-20874281(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGCT
SmilChr06G001847 Chr06 NC_080392.1:21787440-21787450promoter 内 351-361 bp - 3640 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 21791090-21804361(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGCT
SmilChr08G004009 Chr08 NC_080394.1:48484366-48484376promoter 内 310-320 bp - 3681 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 48488057-48488901(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGCT
SmilChr02G002103 Chr02 NC_080388.1:37720122-37720132promoter 内 210-220 bp + 3781 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 37713921-37716341(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGCT
SmilChr04G003420 Chr04 NC_080390.1:50792477-50792487promoter 内 203-213 bp - 3788 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 50796275-50800491(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGCT
SmilChr08G001934 Chr08 NC_080394.1:16952831-16952841promoter 内 130-140 bp - 3861 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 16956702-16959570(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGCT
SmilChr02G001240 Chr02 NC_080388.1:22788704-22788714promoter 内 2112-2122 bp - 1879 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 10 22785038-22786825(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCA
SmilChr05G001838 Chr05 NC_080391.1:18410993-18411003promoter 内 1618-1628 bp - 2373 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 10 18403456-18408620(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCA
SmilChr01G000163 Chr01 NC_080387.1:2708298-2708308promoter 内 2107-2117 bp - 1884 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 4 2703580-2706414(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCA
SmilChr05G003411 Chr05 NC_080391.1:45273942-45273952promoter 内 784-794 bp - 3207 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 45266697-45270735(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCA
SmilChr05G000354 Chr05 NC_080391.1:2643342-2643352promoter 内 3907-3917 bp + 84 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 2640336-2643258(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGGT
SmilChr06G000439 Chr06 NC_080392.1:3584639-3584649promoter 内 3768-3778 bp + 223 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 3583907-3584416(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTC
SmilChr04G003058 Chr04 NC_080390.1:47156950-47156960promoter 内 2973-2983 bp + 1018 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 47157978-47162720(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGC
SmilChr06G001122 Chr06 NC_080392.1:11292790-11292800promoter 内 1080-1090 bp - 2911 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 11288426-11289879(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCA
SmilChr06G001106 Chr06 NC_080392.1:11172671-11172681promoter 内 1075-1085 bp - 2916 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 11168014-11169755(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCA
SmilChr02G004099 Chr02 NC_080388.1:63312437-63312447promoter 内 315-325 bp + 3676 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 63302221-63308761(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTC
SmilChr03G000617 Chr03 NC_080389.1:6814227-6814237promoter 内 3800-3810 bp + 191 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 6812419-6814036(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTC
SmilChr08G003794 Chr08 NC_080394.1:43844658-43844668promoter 内 3629-3639 bp - 362 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 43838516-43844296(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCA
SmilChr06G001990 Chr06 NC_080392.1:25299800-25299810promoter 内 3529-3539 bp - 462 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 25300272-25301149(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTC
SmilChr02G005111 Chr02 NC_080388.1:72631140-72631150promoter 内 3319-3329 bp - 672 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 72631822-72632954(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTC
SmilChr03G003063 Chr03 NC_080389.1:47581030-47581040promoter 内 3193-3203 bp - 798 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 47581838-47583674(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTC
SmilChr01G004311 Chr01 NC_080387.1:61292779-61292789promoter 内 2758-2768 bp + 1233 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 61289693-61291546(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGGT
SmilChr02G000914 Chr02 NC_080388.1:15870160-15870170promoter 内 2521-2531 bp - 1470 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 15850486-15868690(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGC
SmilChr02G000915 Chr02 NC_080388.1:15870160-15870170promoter 内 2502-2512 bp - 1489 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 15852719-15868671(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGC
SmilChr01G005999 Chr01 NC_080387.1:75582090-75582100promoter 内 2440-2450 bp + 1551 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 75567792-75580539(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGGT
SmilChr05G000927 Chr05 NC_080391.1:7401077-7401087promoter 内 2233-2243 bp + 1758 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 7402845-7406376(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGC
SmilChr06G001718 Chr06 NC_080392.1:19801957-19801967promoter 内 1942-1952 bp + 2049 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 19796347-19799908(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTC
SmilChr05G003800 Chr05 NC_080391.1:51321730-51321740promoter 内 1454-1464 bp + 2537 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 51316457-51319193(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGGT
SmilChr05G003808 Chr05 NC_080391.1:51387252-51387262promoter 内 1446-1456 bp + 2545 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 51381944-51384707(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGGT
SmilChr01G004019 Chr01 NC_080387.1:58587349-58587359promoter 内 1407-1417 bp - 2584 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 58578309-58584765(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGC
SmilChr01G000138 Chr01 NC_080387.1:2328808-2328818promoter 内 1341-1351 bp + 2650 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 2331468-2335218(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCA
SmilChr06G000438 Chr06 NC_080392.1:3584639-3584649promoter 内 1103-1113 bp + 2888 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 3578821-3581751(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTC