转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023584-RA_Salv SmilChr05G001518 WRKY XP_057765511.1 MP00455 AACGTTGACTATT

可能结合的靶基因

9792 个结合位点 6900 个候选靶基因 第 23 / 138 下载 TSV

上一页 23 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G003690 Chr03 NC_080389.1:55841042-55841054promoter 内 2896-2908 bp + 1093 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 55838321-55839949(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTAAGTCAACGAT
SmilChr02G004901 Chr02 NC_080388.1:71017179-71017191promoter 内 2746-2758 bp + 1243 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 71018434-71021100(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCTTTGACTAAT
SmilChr01G000129 Chr01 NC_080387.1:2192389-2192401promoter 内 2697-2709 bp - 1292 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 2188602-2191097(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCGTTGACTAAC
SmilChr02G001512 Chr02 NC_080388.1:28143140-28143152promoter 内 2373-2385 bp + 1616 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 28144768-28222538(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTCGTTGACCACC
SmilChr01G005891 Chr01 NC_080387.1:74850714-74850726promoter 内 2223-2235 bp - 1766 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 74852492-74855151(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCAAGTCAACCCC
SmilChr01G000130 Chr01 NC_080387.1:2192389-2192401promoter 内 2182-2194 bp - 1807 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 2194208-2196236(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTAGTCAACGCG
SmilChr01G005436 Chr01 NC_080387.1:71497067-71497079promoter 内 1886-1898 bp - 2103 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 71499182-71500235(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCTAGTCAAAGCC
SmilChr03G002407 Chr03 NC_080389.1:38260539-38260551promoter 内 1747-1759 bp - 2242 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 38262793-38265735(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTAGTCAACGCG
SmilChr01G003600 Chr01 NC_080387.1:54561624-54561636promoter 内 1714-1726 bp + 2275 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 54563911-54565456(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGGGTTGACTATA
SmilChr01G000219 Chr01 NC_080387.1:3861207-3861219promoter 内 1660-1672 bp - 2329 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 3854243-3858878(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCTTTGACTAAT
SmilChr03G004172 Chr03 NC_080389.1:60462888-60462900promoter 内 1594-1606 bp - 2395 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 60465295-60467056(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTAGTCAACGCG
SmilChr02G004179 Chr02 NC_080388.1:64075903-64075915promoter 内 1566-1578 bp + 2423 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 64078338-64090839(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCGTTGACTAAC
SmilChr01G004272 Chr01 NC_080387.1:60962768-60962780promoter 内 1476-1488 bp + 2513 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 60965293-60968483(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATCGTTGACTAAA
SmilChr03G003210 Chr03 NC_080389.1:49698107-49698119promoter 内 1330-1342 bp - 2659 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 49693296-49695448(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCGTTGACTCTT
SmilChr03G003324 Chr03 NC_080389.1:51497473-51497485promoter 内 1325-1337 bp - 2664 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 51492990-51494809(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCGTTGACTCTT
SmilChr02G001283 Chr02 NC_080388.1:23668766-23668778promoter 内 575-587 bp + 3414 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 23672192-23676036(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTCGTTGACTGTA
SmilChr02G004938 Chr02 NC_080388.1:71339120-71339132promoter 内 565-577 bp + 3424 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 71342556-71350335(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCTTTGACTAAT
SmilChr03G001823 Chr03 NC_080389.1:24951821-24951833promoter 内 558-570 bp - 3431 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 24946586-24948390(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCGTTGACTCTT
SmilChr02G004178 Chr02 NC_080388.1:64075903-64075915promoter 内 317-329 bp + 3672 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 64068322-64072231(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTAGTCAACGCG
SmilChr03G001941 Chr03 NC_080389.1:27631825-27631837promoter 内 2420-2432 bp + 1569 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 27621750-27630256(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGTAGTCAACGGG
SmilChr02G004034 Chr02 NC_080388.1:62634862-62634874promoter 内 2311-2323 bp + 1678 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 62630314-62633184(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAAAGTCAACGAA
SmilChr01G001876 Chr01 NC_080387.1:33769972-33769984promoter 内 1419-1431 bp - 2570 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 33772554-33773888(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTGAGTCAACGTC
SmilChr01G001920 Chr01 NC_080387.1:34326742-34326754promoter 内 1409-1421 bp - 2580 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 34329334-34330618(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTGAGTCAACGTC
SmilChr02G000431 Chr02 NC_080388.1:5583565-5583577promoter 内 3565-3577 bp - 424 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 5582653-5583141(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCTTTGACTAGC
SmilChr02G002427 Chr02 NC_080388.1:42249690-42249702promoter 内 3473-3485 bp - 516 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 42250218-42250874(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTTAGTCAACCGC
SmilChr02G002541 Chr02 NC_080388.1:44275595-44275607promoter 内 3274-3286 bp + 715 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 44263095-44274880(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTAGTCAACCGC
SmilChr02G003964 Chr02 NC_080388.1:61795837-61795849promoter 内 3037-3049 bp - 952 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 61791360-61794885(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CACGTTGACCGAA
SmilChr03G002892 Chr03 NC_080389.1:45612629-45612641promoter 内 2161-2173 bp + 1828 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 45607948-45610801(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCCAGTCAACCGC
SmilChr03G004243 Chr03 NC_080389.1:60947669-60947681promoter 内 2118-2130 bp - 1871 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 60942628-60945798(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGGGTTGACTTAT
SmilChr02G001549 Chr02 NC_080388.1:28787410-28787422promoter 内 1817-1829 bp + 2172 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 28779199-28785238(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAAAGTCAACGAA
SmilChr01G006005 Chr01 NC_080387.1:75617636-75617648promoter 内 1302-1314 bp + 2687 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 75620335-75623815(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGGGTTGACTGGA
SmilChr03G004345 Chr03 NC_080389.1:61732827-61732839promoter 内 1244-1256 bp - 2745 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 61735584-61736510(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGGGGTCAACGGC
SmilChr02G001550 Chr02 NC_080388.1:28787410-28787422promoter 内 1112-1124 bp + 2877 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 28790299-28792717(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTCGTTGACTTTC
SmilChr03G001906 Chr03 NC_080389.1:26650817-26650829promoter 内 895-907 bp - 3094 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 26653923-26662440(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGTAGTCAACGGG
SmilChr02G001157 Chr02 NC_080388.1:21112311-21112323promoter 内 3940-3952 bp + 49 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 21112372-21115555(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CACGTTGACCGAA
SmilChr01G000917 Chr01 NC_080387.1:19390263-19390275promoter 内 3636-3648 bp - 353 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 19390628-19391413(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGGGGTCAACGGC
SmilChr02G003085 Chr02 NC_080388.1:51752936-51752948promoter 内 3166-3178 bp - 823 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 51753771-51754938(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAAAGTCAACGAA
SmilChr02G002704 Chr02 NC_080388.1:46888813-46888825promoter 内 2871-2883 bp - 1118 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 46882839-46887695(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGCGTTGACTTCT
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SmilChr02G003086 Chr02 NC_080388.1:51752936-51752948promoter 内 2608-2620 bp - 1381 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 51754329-51754979(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAAAGTCAACGAA
SmilChr01G001818 Chr01 NC_080387.1:33101746-33101758promoter 内 2583-2595 bp + 1406 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 33100189-33100340(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGTAGTCAACGGG
SmilChr01G002071 Chr01 NC_080387.1:36580479-36580491promoter 内 2511-2523 bp + 1478 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 36581969-36584586(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCTTTGACTAGC
SmilChr01G004706 Chr01 NC_080387.1:65162701-65162713promoter 内 1960-1972 bp - 2029 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 65164742-65166444(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTCGGTCAACGTG
SmilChr01G002117 Chr01 NC_080387.1:37195329-37195341promoter 内 1923-1935 bp - 2066 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 37189801-37193263(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CACGTTGACTAAT
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SmilChr02G001156 Chr02 NC_080388.1:21112311-21112323promoter 内 1172-1184 bp + 2817 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 21105216-21109494(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTCGGTCAACGTG
SmilChr01G000854 Chr01 NC_080387.1:18413080-18413092promoter 内 1165-1177 bp + 2824 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 18415916-18419064(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CACGTTGACCCGT
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SmilChr02G005418 Chr02 NC_080388.1:74643462-74643474promoter 内 676-688 bp + 3313 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 74637606-74640149(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATAAGTCAACCCC