转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 24 / 128 下载 TSV

上一页 24 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004128 Chr01 NC_080387.1:59804652-59804663promoter 内 3866-3877 bp + 124 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 59803567-59804528(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTTG
SmilChr01G001015 Chr01 NC_080387.1:21318586-21318597promoter 内 3477-3488 bp - 513 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 21319110-21321772(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTTG
SmilChr02G000205 Chr02 NC_080388.1:2652973-2652984promoter 内 2055-2066 bp - 1935 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 2654919-2668502(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTTG
SmilChr01G000172 Chr01 NC_080387.1:2830963-2830974promoter 内 1496-1507 bp - 2494 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 2833468-2836431(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTTG
SmilChr02G003257 Chr02 NC_080388.1:53869619-53869630promoter 内 1219-1230 bp - 2771 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 53865103-53866848(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGAAACAGAGAA
SmilChr02G004484 Chr02 NC_080388.1:67317824-67317835promoter 内 1137-1148 bp - 2853 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 67313590-67314971(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGAAACAGAGAA
SmilChr01G001587 Chr01 NC_080387.1:29902298-29902309promoter 内 111-122 bp + 3879 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 29906188-29908696(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGAAACAGAGAA
SmilChr02G005408 Chr02 NC_080388.1:74591776-74591787promoter 内 3582-3593 bp - 408 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 74592195-74595504(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTTTC
SmilChr02G000265 Chr02 NC_080388.1:3426286-3426297promoter 内 3518-3529 bp - 472 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 3426769-3427796(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTTTC
SmilChr01G001092 Chr01 NC_080387.1:22374683-22374694promoter 内 3501-3512 bp + 489 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 22371515-22374194(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTTG
SmilChr02G004609 Chr02 NC_080388.1:68590726-68590737promoter 内 3301-3312 bp - 689 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 68585615-68590037(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGAAACAGAGAA
SmilChr02G003701 Chr02 NC_080388.1:58485392-58485403promoter 内 3279-3290 bp - 711 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 58476983-58484681(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAGAA
SmilChr01G002698 Chr01 NC_080387.1:45248245-45248256promoter 内 3180-3191 bp + 810 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 45245357-45247435(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTTG
SmilChr01G006186 Chr01 NC_080387.1:77407136-77407147promoter 内 3064-3075 bp + 926 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 77401606-77406210(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTTTC
SmilChr01G003441 Chr01 NC_080387.1:52994710-52994721promoter 内 2942-2953 bp - 1048 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 52995769-52998000(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTCG
SmilChr02G003577 Chr02 NC_080388.1:56941444-56941455promoter 内 2875-2886 bp + 1115 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 56939348-56940329(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTTTC
SmilChr01G001689 Chr01 NC_080387.1:31113906-31113917promoter 内 2600-2611 bp + 1390 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 31115307-31115858(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGCT
SmilChr01G000971 Chr01 NC_080387.1:20582875-20582886promoter 内 2140-2151 bp + 1850 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 20571972-20581025(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTCG
SmilChr02G005418 Chr02 NC_080388.1:74642158-74642169promoter 内 1981-1992 bp - 2009 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 74637606-74640149(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGCT
SmilChr02G000690 Chr02 NC_080388.1:10995572-10995583promoter 内 1859-1870 bp + 2131 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 10997714-10999835(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGAAACAGAGAA
SmilChr01G000973 Chr01 NC_080387.1:20588310-20588321promoter 内 1636-1647 bp + 2354 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 20590675-20594808(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGAAACAGAGAA
SmilChr02G005081 Chr02 NC_080388.1:72436749-72436760promoter 内 1510-1521 bp - 2480 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 72432735-72434269(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAGAA
SmilChr02G000966 Chr02 NC_080388.1:16879759-16879770promoter 内 1244-1255 bp - 2746 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 16876393-16877013(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGAAACAGAGAA
SmilChr03G000515 Chr03 NC_080389.1:5552768-5552779promoter 内 1214-1225 bp + 2776 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 5555555-5563630(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGAAACAGAGGG
SmilChr01G005025 Chr01 NC_080387.1:68217439-68217450promoter 内 1141-1152 bp - 2849 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 68212631-68214590(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGCT
SmilChr03G001823 Chr03 NC_080389.1:24951315-24951326promoter 内 1065-1076 bp - 2925 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 24946586-24948390(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGAAACAGAGAA
SmilChr01G005204 Chr01 NC_080387.1:69716161-69716172promoter 内 812-823 bp + 3178 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 69712303-69712983(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTTG
SmilChr01G003440 Chr01 NC_080387.1:52994710-52994721promoter 内 679-690 bp - 3311 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 52988922-52991399(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGAAACAGAGAA
SmilChr02G000688 Chr02 NC_080388.1:10967612-10967623promoter 内 608-619 bp + 3382 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 10971005-10973024(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGAAACAGAGAA
SmilChr02G004532 Chr02 NC_080388.1:67897082-67897093promoter 内 442-453 bp - 3548 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 67890055-67893534(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGAAACAGAGGG
SmilChr01G004360 Chr01 NC_080387.1:61791177-61791188promoter 内 3534-3545 bp + 456 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 61789442-61790721(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTTTC
SmilChr01G002070 Chr01 NC_080387.1:36571932-36571943promoter 内 3400-3411 bp - 590 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 36565220-36571342(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAGAA
SmilChr01G004445 Chr01 NC_080387.1:62569404-62569415promoter 内 3394-3405 bp - 596 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 62564470-62568808(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAGCT
SmilChr01G006010 Chr01 NC_080387.1:75657112-75657123promoter 内 3043-3054 bp + 947 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 75658070-75662073(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGAAACAGAGAA
SmilChr01G001484 Chr01 NC_080387.1:28627883-28627894promoter 内 2982-2993 bp + 1008 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 28628902-28631945(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAGAA
SmilChr03G000615 Chr03 NC_080389.1:6810326-6810337promoter 内 2840-2851 bp + 1150 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 6808133-6809176(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CCCTCTGTTTCG
SmilChr01G005459 Chr01 NC_080387.1:71615299-71615310promoter 内 2728-2739 bp - 1262 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 71609114-71614037(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGCT
SmilChr02G003552 Chr02 NC_080388.1:56701072-56701083promoter 内 2381-2392 bp - 1609 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 56694510-56699463(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAGAA
SmilChr01G003444 Chr01 NC_080387.1:53008806-53008817promoter 内 2125-2136 bp - 1865 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 53010682-53013283(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTCG
SmilChr01G002490 Chr01 NC_080387.1:42621638-42621649promoter 内 1837-1848 bp + 2153 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 42615577-42619485(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTTG
SmilChr02G001273 Chr02 NC_080388.1:23300807-23300818promoter 内 1806-1817 bp - 2184 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 23295339-23298623(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGAAACAGAGAA
SmilChr02G001116 Chr02 NC_080388.1:20119617-20119628promoter 内 1674-1685 bp + 2316 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 20114751-20117301(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTCG
SmilChr02G004867 Chr02 NC_080388.1:70780224-70780235promoter 内 1531-1542 bp + 2459 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 70782694-70782767(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGCT
SmilChr02G000071 Chr02 NC_080388.1:902411-902422promoter 内 1457-1468 bp - 2533 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 897628-899878(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGAAACAGAGAA
SmilChr02G003986 Chr02 NC_080388.1:62119073-62119084promoter 内 1307-1318 bp + 2683 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 62108959-62116390(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTTG
SmilChr01G003353 Chr01 NC_080387.1:52279995-52280006promoter 内 915-926 bp - 3075 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 52283081-52286271(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTTG
SmilChr02G001352 Chr02 NC_080388.1:25294388-25294399promoter 内 826-837 bp + 3164 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 25288281-25291224(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTTTC
SmilChr03G001592 Chr03 NC_080389.1:20179100-20179111promoter 内 798-809 bp - 3192 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 20182303-20184509(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTTG
SmilChr02G001094 Chr02 NC_080388.1:19741178-19741189promoter 内 506-517 bp + 3484 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 19735577-19737694(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTCG
SmilChr02G003582 Chr02 NC_080388.1:56985080-56985091promoter 内 480-491 bp - 3510 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 56980141-56981570(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAGAA