转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003367; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001784-RA_Salv SmilChr04G003367 MYB XP_057804957.1 MP00191 ATTAACCTTATCCTC

可能结合的靶基因

9690 个结合位点 6736 个候选靶基因 第 28 / 135 下载 TSV

上一页 28 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001204 Chr01 NC_080387.1:24265147-24265161promoter 内 1396-1410 bp - 2591 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 24255738-24262556(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATCCACCTTATCTCC
SmilChr01G002967 Chr01 NC_080387.1:48566210-48566224promoter 内 1346-1360 bp - 2641 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 48555600-48563569(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTAATTCTTATCCAT
SmilChr01G004564 Chr01 NC_080387.1:63722685-63722699promoter 内 1259-1273 bp + 2728 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 63717788-63719957(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GCAGATAAGGATTAA
SmilChr01G005064 Chr01 NC_080387.1:68544751-68544765promoter 内 1154-1168 bp - 2833 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 68537871-68541918(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTATGCTTATCCAC
SmilChr02G002407 Chr02 NC_080388.1:42022622-42022636promoter 内 1126-1140 bp + 2861 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 42025497-42026438(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCATTTCTTATCCTC
SmilChr01G001232 Chr01 NC_080387.1:24770460-24770474promoter 内 1106-1120 bp - 2881 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 24762242-24767579(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACCTATCTTATCCTT
SmilChr01G003593 Chr01 NC_080387.1:54470795-54470809promoter 内 910-924 bp + 3077 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 54466042-54467718(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAAGATGCTA
SmilChr01G003590 Chr01 NC_080387.1:54442299-54442313promoter 内 908-922 bp + 3079 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 54437545-54439220(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAAGATGCTA
SmilChr01G003572 Chr01 NC_080387.1:54285953-54285967promoter 内 890-904 bp - 3097 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 54289064-54290069(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TGGGATAAGGCTAAG
SmilChr02G000130 Chr02 NC_080388.1:1760520-1760534promoter 内 834-848 bp + 3153 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 1756019-1757367(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATGGATAAGAATTAA
SmilChr03G001150 Chr03 NC_080389.1:13253719-13253733promoter 内 819-833 bp - 3168 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 13256901-13258244(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GGAGATAAGGTGTTG
SmilChr02G001531 Chr02 NC_080388.1:28569430-28569444promoter 内 818-832 bp + 3169 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 28562341-28566261(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGGGATAAGGAGGGG
SmilChr03G001531 Chr03 NC_080389.1:19120600-19120614promoter 内 787-801 bp - 3200 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 19116541-19117400(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTTGTCCTTATCTCC
SmilChr02G002486 Chr02 NC_080388.1:43279420-43279434promoter 内 773-787 bp - 3214 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 43282648-43284698(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GCGGATAAGGAGTGT
SmilChr02G003522 Chr02 NC_080388.1:56392121-56392135promoter 内 543-557 bp + 3444 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 56395579-56397687(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTCCACCTTATCTTT
SmilChr02G002819 Chr02 NC_080388.1:48285224-48285238promoter 内 540-554 bp - 3447 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 48288685-48289447(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GCAGATAAGGTGAAA
SmilChr01G004143 Chr01 NC_080387.1:59927586-59927600promoter 内 267-281 bp - 3720 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 59931320-59935459(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATGGATAAGCTTGAG
SmilChr02G001292 Chr02 NC_080388.1:23749462-23749476promoter 内 256-270 bp - 3731 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 23739913-23745731(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTCCACCTTATCTTT
SmilChr01G005391 Chr01 NC_080387.1:71199091-71199105promoter 内 2854-2868 bp + 1133 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 5 71200238-71205838(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CATCTTCTTATCCAT
SmilChr01G001428 Chr01 NC_080387.1:27919670-27919684promoter 内 2206-2220 bp - 1781 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 4 27921465-27924019(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGGGATAAGATTGAT
SmilChr02G004722 Chr02 NC_080388.1:69469794-69469808promoter 内 1710-1724 bp + 2277 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 4 69460615-69467517(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGGATAAGATCAAT
SmilChr03G000845 Chr03 NC_080389.1:9649469-9649483promoter 内 3986-4000 bp - 1 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 9637415-9649468(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTTTCCTTATCTTT
SmilChr01G003738 Chr01 NC_080387.1:55708233-55708247promoter 内 2302-2316 bp + 1685 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 55709932-55712763(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATTGATCTTATCCTT
SmilChr03G002149 Chr03 NC_080389.1:33435962-33435976promoter 内 2230-2244 bp + 1757 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 33433170-33434205(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTGGATAAGCATAGT
SmilChr03G002332 Chr03 NC_080389.1:36783798-36783812promoter 内 2174-2188 bp + 1813 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 36781031-36781985(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTGGATAAGCATAGT
SmilChr01G000968 Chr01 NC_080387.1:20521296-20521310promoter 内 1008-1022 bp + 2979 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 20515673-20518317(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAACAATGAG
SmilChr02G002704 Chr02 NC_080388.1:46891133-46891147promoter 内 549-563 bp + 3438 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 46882839-46887695(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTTGATAAGGTAAGC
SmilChr02G003346 Chr02 NC_080388.1:54673167-54673181promoter 内 427-441 bp - 3560 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 54676741-54680443(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATAGATAAGGAATAG
SmilChr03G001177 Chr03 NC_080389.1:13521284-13521298promoter 内 216-230 bp + 3771 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 13525069-13537051(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TATTATCTTATCCAT
SmilChr01G000329 Chr01 NC_080387.1:6723909-6723923promoter 内 3929-3943 bp - 58 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 6723981-6724799(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GATGATAAGGTGAAA
SmilChr01G002999 Chr01 NC_080387.1:48975399-48975413promoter 内 3510-3524 bp + 477 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 48970122-48974922(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAAGGACTAC
SmilChr02G002176 Chr02 NC_080388.1:38984673-38984687promoter 内 3499-3513 bp - 488 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 38980129-38984185(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AACAACCTTATCTGA
SmilChr03G000622 Chr03 NC_080389.1:6862936-6862950promoter 内 3347-3361 bp - 640 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 6861170-6862296(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TATTATCTTATCCAT
SmilChr02G001011 Chr02 NC_080388.1:17863651-17863665promoter 内 3345-3359 bp - 642 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 17864307-17865524(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGGGATAAGGATTTC
SmilChr03G001176 Chr03 NC_080389.1:13521284-13521298promoter 内 3288-3302 bp + 699 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 13521997-13523176(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TATTATCTTATCCAT
SmilChr02G001423 Chr02 NC_080388.1:26829046-26829060promoter 内 3077-3091 bp - 910 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 26829970-26830536(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCGGATAAGGTCAAA
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