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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 33 / 136 下载 TSV

上一页 33 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001223 Chr01 NC_080387.1:24517874-24517884promoter 内 2698-2708 bp - 1293 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 24519177-24522740(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGGG
SmilChr08G000579 Chr08 NC_080394.1:4234800-4234810promoter 内 2690-2700 bp + 1301 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 4236111-4237912(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGGT
SmilChr04G001651 Chr04 NC_080390.1:27462770-27462780promoter 内 2648-2658 bp + 1343 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 27464123-27465643(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGGT
SmilChr03G004326 Chr03 NC_080389.1:61619992-61620002promoter 内 2588-2598 bp + 1403 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 61616270-61618589(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGGG
SmilChr03G004553 Chr03 NC_080389.1:63487612-63487622promoter 内 2517-2527 bp - 1474 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 63489096-63492937(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGGG
SmilChr02G002703 Chr02 NC_080388.1:46869103-46869113promoter 内 2483-2493 bp + 1508 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 46865206-46867595(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGGG
SmilChr05G003474 Chr05 NC_080391.1:46127747-46127757promoter 内 2481-2491 bp + 1510 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 46129267-46131056(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGGT
SmilChr01G006124 Chr01 NC_080387.1:76752611-76752621promoter 内 2462-2472 bp - 1529 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 76750274-76751082(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGGT
SmilChr05G001425 Chr05 NC_080391.1:12942036-12942046promoter 内 2391-2401 bp - 1600 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 12939546-12940436(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGCC
SmilChr07G002746 Chr07 NC_080393.1:26985931-26985941promoter 内 2056-2066 bp + 1935 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 26981319-26983996(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCCCTGAGCC
SmilChr02G003519 Chr02 NC_080388.1:56370315-56370325promoter 内 2053-2063 bp - 1938 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 56367230-56368377(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGGT
SmilChr04G001374 Chr04 NC_080390.1:22319195-22319205promoter 内 2025-2035 bp + 1966 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 22321171-22322319(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGGT
SmilChr06G001458 Chr06 NC_080392.1:15429269-15429279promoter 内 1859-1869 bp - 2132 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 15431411-15434638(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGGG
SmilChr02G003042 Chr02 NC_080388.1:51165468-51165478promoter 内 1567-1577 bp + 2424 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 51167902-51169515(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGGT
SmilChr05G003441 Chr05 NC_080391.1:45778659-45778669promoter 内 1474-1484 bp - 2517 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 45781186-45784189(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGGG
SmilChr05G003473 Chr05 NC_080391.1:46127747-46127757promoter 内 1358-1368 bp + 2633 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 46122236-46125114(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGGG
SmilChr01G001282 Chr01 NC_080387.1:25605222-25605232promoter 内 1211-1221 bp + 2780 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 25600152-25602442(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCCCTGAGCC
SmilChr01G005952 Chr01 NC_080387.1:75229794-75229804promoter 内 1143-1153 bp - 2848 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 75224873-75226946(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGGT
SmilChr02G001153 Chr02 NC_080388.1:21005422-21005432promoter 内 1138-1148 bp + 2853 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 20997549-21002569(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCCCTGAGCC
SmilChr03G003309 Chr03 NC_080389.1:51304589-51304599promoter 内 888-898 bp - 3103 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 51307702-51309142(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGGG
SmilChr04G003189 Chr04 NC_080390.1:48592915-48592925promoter 内 767-777 bp + 3224 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 48580804-48589691(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCCCTGAGCC
SmilChr06G001439 Chr06 NC_080392.1:15186697-15186707promoter 内 738-748 bp + 3253 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 15181605-15183444(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGGG
SmilChr08G002484 Chr08 NC_080394.1:23745295-23745305promoter 内 595-605 bp - 3396 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 23748701-23750736(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGGA
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SmilChr04G002204 Chr04 NC_080390.1:35682538-35682548promoter 内 400-410 bp - 3591 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 35676476-35678947(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGGT
SmilChr07G001497 Chr07 NC_080393.1:11890666-11890676promoter 内 328-338 bp - 3663 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 11856036-11887003(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGGC
SmilChr02G005034 Chr02 NC_080388.1:72053730-72053740promoter 内 283-293 bp + 3708 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 72057448-72058671(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGGT
SmilChr08G003365 Chr08 NC_080394.1:35212712-35212722promoter 内 255-265 bp + 3736 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 35216458-35219685(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGGT
SmilChr04G002636 Chr04 NC_080390.1:41755396-41755406promoter 内 70-80 bp + 3921 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 2 41759327-41761402(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGGT
SmilChr07G001619 Chr07 NC_080393.1:13597570-13597580promoter 内 3907-3917 bp + 84 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 13597664-13599861(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGGC
SmilChr05G000348 Chr05 NC_080391.1:2614793-2614803promoter 内 3788-3798 bp - 203 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 2615006-2617026(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGGA
SmilChr04G004161 Chr04 NC_080390.1:56291479-56291489promoter 内 3609-3619 bp + 382 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 56291871-56293290(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGCC
SmilChr01G003248 Chr01 NC_080387.1:51208887-51208897promoter 内 3185-3195 bp - 806 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 51205715-51208081(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGGC
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SmilChr08G001821 Chr08 NC_080394.1:15544857-15544867promoter 内 3106-3116 bp + 885 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 15539835-15543972(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGGA
SmilChr04G001415 Chr04 NC_080390.1:23016208-23016218promoter 内 3062-3072 bp + 929 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 23009713-23015279(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCCCTGAGCC
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SmilChr08G002025 Chr08 NC_080394.1:18072344-18072354promoter 内 2472-2482 bp + 1519 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 18069140-18070825(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCCCTGAGCC
SmilChr08G002010 Chr08 NC_080394.1:17863980-17863990promoter 内 2341-2351 bp - 1650 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 17856375-17862330(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGGC
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SmilChr04G003308 Chr04 NC_080390.1:49816608-49816618promoter 内 2051-2061 bp + 1940 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 49818558-49827362(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGCC
SmilChr04G003651 Chr04 NC_080390.1:53001150-53001160promoter 内 2035-2045 bp - 1956 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 53003116-53005290(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCCCTGAGCC
SmilChr03G000174 Chr03 NC_080389.1:1904132-1904142promoter 内 1625-1635 bp + 2366 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 1901080-1901766(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGGG
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SmilChr08G002573 Chr08 NC_080394.1:25086869-25086879promoter 内 1217-1227 bp + 2774 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 25083388-25084095(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGGA