转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 36 / 143 下载 TSV

上一页 36 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G003471 Chr08 NC_080394.1:37333289-37333300promoter 内 2185-2196 bp + 1805 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 37328225-37331484(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAAT
SmilChr07G004062 Chr07 NC_080393.1:51905029-51905040promoter 内 2138-2149 bp + 1852 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 51906892-51909571(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTCCAGCTGTT
SmilChr07G004069 Chr07 NC_080393.1:52037838-52037849promoter 内 2130-2141 bp + 1860 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 52039709-52042208(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTCCAGCTGTT
SmilChr04G002056 Chr04 NC_080390.1:33300674-33300685promoter 内 1741-1752 bp + 2249 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 33302934-33308415(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTCCAGCTGTT
SmilChr02G002247 Chr02 NC_080388.1:39906531-39906542promoter 内 1679-1690 bp + 2311 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 39908853-39912236(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTACAGCTGTA
SmilChr01G002089 Chr01 NC_080387.1:36886629-36886640promoter 内 1439-1450 bp - 2551 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 36883067-36884078(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTCCAGCTGTT
SmilChr05G002873 Chr05 NC_080391.1:34401746-34401757promoter 内 1129-1140 bp + 2861 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 34404618-34405483(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTCCAGCTGTT
SmilChr01G005705 Chr01 NC_080387.1:73282591-73282602promoter 内 1117-1128 bp - 2873 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 73285475-73291615(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCGA
SmilChr07G001903 Chr07 NC_080393.1:16435328-16435339promoter 内 835-846 bp - 3155 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 16438494-16441039(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAAT
SmilChr01G001245 Chr01 NC_080387.1:24967706-24967717promoter 内 469-480 bp - 3521 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 24963532-24964185(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTCCAGCTGTT
SmilChr02G005082 Chr02 NC_080388.1:72458848-72458859promoter 内 464-475 bp + 3526 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 72451388-72455322(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACAGCTGGAAG
SmilChr07G004067 Chr07 NC_080393.1:52037838-52037849promoter 内 422-433 bp + 3568 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 52032687-52034270(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAAT
SmilChr03G001306 Chr03 NC_080389.1:15322071-15322082promoter 内 377-388 bp + 3613 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 15309028-15318458(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTCTC
SmilChr06G003155 Chr06 NC_080392.1:44540899-44540910promoter 内 3719-3730 bp - 271 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 44541181-44541970(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTCTC
SmilChr03G001346 Chr03 NC_080389.1:15711484-15711495promoter 内 3695-3706 bp - 295 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 15709870-15711189(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTATA
SmilChr05G002799 Chr05 NC_080391.1:32757749-32757760promoter 内 3596-3607 bp + 394 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 32756185-32757355(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTCTC
SmilChr05G002800 Chr05 NC_080391.1:32767748-32767759promoter 内 3596-3607 bp + 394 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 32766332-32767354(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTCTC
SmilChr05G002801 Chr05 NC_080391.1:32777746-32777757promoter 内 3596-3607 bp + 394 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 32776330-32777352(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTCTC
SmilChr05G001723 Chr05 NC_080391.1:16500813-16500824promoter 内 3384-3395 bp + 606 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 16501430-16503046(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCTC
SmilChr02G005581 Chr02 NC_080388.1:75643718-75643729promoter 内 3146-3157 bp + 844 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 75637200-75642874(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTCTC
SmilChr04G002063 Chr04 NC_080390.1:33369559-33369570promoter 内 2919-2930 bp - 1071 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 33367761-33368488(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGAC
SmilChr07G001395 Chr07 NC_080393.1:10830672-10830683promoter 内 1802-1813 bp - 2188 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 10826590-10828484(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTATA
SmilChr08G003131 Chr08 NC_080394.1:31647455-31647466promoter 内 1717-1728 bp + 2273 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 31642379-31645182(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCAC
SmilChr05G002696 Chr05 NC_080391.1:30827152-30827163promoter 内 1460-1471 bp - 2530 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 30829693-30831826(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCCG
SmilChr03G004212 Chr03 NC_080389.1:60721441-60721452promoter 内 882-893 bp - 3108 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 60715972-60718333(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCTC
SmilChr06G003153 Chr06 NC_080392.1:44540899-44540910promoter 内 647-658 bp - 3343 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 44533848-44537556(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGAC
SmilChr08G001146 Chr08 NC_080394.1:9046651-9046662promoter 内 635-646 bp - 3355 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 9039284-9043296(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTATA
SmilChr05G001585 Chr05 NC_080391.1:14565825-14565836promoter 内 2821-2832 bp - 1169 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 4 14563514-14564656(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTGAC
SmilChr05G001586 Chr05 NC_080391.1:14565825-14565836promoter 内 321-332 bp - 3669 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 4 14569505-14571332(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTCCC
SmilChr04G000852 Chr04 NC_080390.1:10771694-10771705promoter 内 3106-3117 bp - 884 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 10772589-10778509(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCAA
SmilChr08G000688 Chr08 NC_080394.1:5105272-5105283promoter 内 785-796 bp - 3205 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 5108488-5121556(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAAA
SmilChr08G002240 Chr08 NC_080394.1:20549311-20549322promoter 内 3242-3253 bp - 748 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 20550070-20551079(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAAA
SmilChr02G004113 Chr02 NC_080388.1:63425282-63425293promoter 内 2579-2590 bp - 1411 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 63426704-63431794(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTAAA
SmilChr01G005547 Chr01 NC_080387.1:72268675-72268686promoter 内 2409-2420 bp - 1581 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 72270267-72274502(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAAA
SmilChr08G002442 Chr08 NC_080394.1:23246474-23246485promoter 内 2162-2173 bp + 1828 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 23244575-23244646(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAAA
SmilChr04G000771 Chr04 NC_080390.1:9485547-9485558promoter 内 1971-1982 bp - 2019 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 9478174-9483528(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGGA
SmilChr04G003664 Chr04 NC_080390.1:53096109-53096120promoter 内 1906-1917 bp - 2084 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 53090879-53094025(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGTA
SmilChr07G000167 Chr07 NC_080393.1:1014989-1015000promoter 内 1558-1569 bp - 2432 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 1017432-1025739(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAAA
SmilChr05G004111 Chr05 NC_080391.1:54960703-54960714promoter 内 1430-1441 bp - 2560 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 54956469-54958143(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATA
SmilChr01G001983 Chr01 NC_080387.1:35215434-35215445promoter 内 1214-1225 bp - 2776 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 35218221-35220823(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCAA
SmilChr04G003658 Chr04 NC_080390.1:53062376-53062387promoter 内 1009-1020 bp - 2981 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 53065368-53066314(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTAAA
SmilChr04G001244 Chr04 NC_080390.1:19580277-19580288promoter 内 802-813 bp - 3188 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 19574648-19577089(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGGA
SmilChr04G001245 Chr04 NC_080390.1:19580277-19580288promoter 内 709-720 bp - 3281 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 19583569-19584777(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTAAA
SmilChr08G000664 Chr08 NC_080394.1:4919278-4919289promoter 内 39-50 bp + 3951 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 4914470-4915327(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAAA
SmilChr02G002826 Chr02 NC_080388.1:48364911-48364922promoter 内 3941-3952 bp + 49 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 48358381-48364862(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCAA
SmilChr03G000556 Chr03 NC_080389.1:6014883-6014894promoter 内 3902-3913 bp - 88 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 6014982-6020144(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTAAC
SmilChr01G002897 Chr01 NC_080387.1:47662684-47662695promoter 内 3854-3865 bp + 136 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 47662831-47664594(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATA
SmilChr08G000667 Chr08 NC_080394.1:4933618-4933629promoter 内 3778-3789 bp - 212 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 4926567-4933406(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCAC
SmilChr08G001849 Chr08 NC_080394.1:15846286-15846297promoter 内 3688-3699 bp - 302 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 15846599-15855716(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCAA
SmilChr01G003886 Chr01 NC_080387.1:57174584-57174595promoter 内 3196-3207 bp - 794 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 57175389-57181511(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTAAC