转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 36 / 151 下载 TSV

上一页 36 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005220 Chr02 NC_080388.1:73406746-73406758promoter 内 3931-3943 bp + 58 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 73404859-73406688(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGGAGTAGGTAGC
SmilChr01G003042 Chr01 NC_080387.1:49408978-49408990promoter 内 3786-3798 bp + 203 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 49402652-49408775(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTATTAGGTAAA
SmilChr02G003398 Chr02 NC_080388.1:55119844-55119856promoter 内 3484-3496 bp - 505 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 55120361-55122165(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCAGTAGGTAAG
SmilChr03G002260 Chr03 NC_080389.1:35588002-35588014promoter 内 3430-3442 bp - 559 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 35582928-35587443(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACCACCTACCTCT
SmilChr03G003140 Chr03 NC_080389.1:48619907-48619919promoter 内 3410-3422 bp - 579 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 48620498-48621178(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGGTTAGGTAAA
SmilChr05G001326 Chr05 NC_080391.1:11445470-11445482promoter 内 3314-3326 bp + 675 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 11446157-11452769(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATCACCTACCACT
SmilChr01G005050 Chr01 NC_080387.1:68447071-68447083promoter 内 3258-3270 bp - 731 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 68447814-68451121(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTGTTAGGTAAG
SmilChr03G003792 Chr03 NC_080389.1:57025283-57025295promoter 内 3240-3252 bp + 749 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 57011179-57024534(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGGTAGGTGGT
SmilChr01G003495 Chr01 NC_080387.1:53555126-53555138promoter 内 2947-2959 bp - 1042 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 53550772-53554084(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACCACCTACCACT
SmilChr01G003427 Chr01 NC_080387.1:52933416-52933428promoter 内 2925-2937 bp - 1064 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 52929091-52932352(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATCACCTACCACT
SmilChr02G001400 Chr02 NC_080388.1:26578072-26578084promoter 内 2821-2833 bp + 1168 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 26579252-26582728(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCTACCTACTCTT
SmilChr03G000694 Chr03 NC_080389.1:7743601-7743613promoter 内 2776-2788 bp + 1213 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 7744826-7748324(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTCAT
SmilChr04G002944 Chr04 NC_080390.1:45755640-45755652promoter 内 2776-2788 bp + 1213 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 45752997-45754427(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTGGTAGGTGAC
SmilChr04G002815 Chr04 NC_080390.1:44162261-44162273promoter 内 2773-2785 bp + 1216 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 44163489-44164437(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTCAT
SmilChr01G002032 Chr01 NC_080387.1:35931919-35931931promoter 内 2572-2584 bp - 1417 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 35927524-35930502(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTGCA
SmilChr01G002044 Chr01 NC_080387.1:36176439-36176451promoter 内 2557-2569 bp + 1432 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 36177883-36180840(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTGCA
SmilChr04G002590 Chr04 NC_080390.1:41325874-41325886promoter 内 2461-2473 bp + 1528 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 41321268-41324346(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGGTAGGTGGT
SmilChr01G003875 Chr01 NC_080387.1:57021907-57021919promoter 内 2168-2180 bp + 1821 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 57023740-57024237(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGTACCTACCCCT
SmilChr04G003430 Chr04 NC_080390.1:50881549-50881561promoter 内 2066-2078 bp + 1923 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 50877702-50879626(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGTGGT
SmilChr01G000640 Chr01 NC_080387.1:14385951-14385963promoter 内 1982-1994 bp + 2007 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 14381604-14383944(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGTGGTAGGTGGT
SmilChr02G004452 Chr02 NC_080388.1:66884178-66884190promoter 内 1938-1950 bp - 2051 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 66877644-66882127(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTCGC
SmilChr03G002379 Chr03 NC_080389.1:37547851-37547863promoter 内 1803-1815 bp + 2186 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 37550049-37551242(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTGTA
SmilChr01G001379 Chr01 NC_080387.1:27190497-27190509promoter 内 1552-1564 bp + 2437 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 27187377-27188060(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGGTAGGTGAT
SmilChr03G002378 Chr03 NC_080389.1:37547851-37547863promoter 内 1487-1499 bp + 2502 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 37544591-37545349(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACAGTAGGTAGG
SmilChr05G000291 Chr05 NC_080391.1:2224535-2224547promoter 内 1359-1371 bp + 2630 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 2227177-2232336(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACCACCTACCACT
SmilChr03G002848 Chr03 NC_080389.1:45042886-45042898promoter 内 1356-1368 bp - 2633 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 45038210-45040253(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACCACCTACCACT
SmilChr04G004011 Chr04 NC_080390.1:55417313-55417325promoter 内 1259-1271 bp + 2730 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 55420055-55421017(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATCACCTACCACT
SmilChr02G000801 Chr02 NC_080388.1:13399278-13399290promoter 内 1083-1095 bp - 2906 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 13392078-13396372(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCTACCTACTCTT
SmilChr04G000699 Chr04 NC_080390.1:8153723-8153735promoter 内 567-579 bp - 3422 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 8149885-8150301(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGCACCTACCTCC
SmilChr02G002970 Chr02 NC_080388.1:50220135-50220147promoter 内 478-490 bp - 3511 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 50212510-50216624(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACCACCTACCTCT
SmilChr03G003015 Chr03 NC_080389.1:47052895-47052907promoter 内 457-469 bp - 3532 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 47056439-47059206(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGGGTTAGGTAAC
SmilChr01G001032 Chr01 NC_080387.1:21480812-21480824promoter 内 385-397 bp - 3604 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 21476350-21477208(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTGCA
SmilChr03G002380 Chr03 NC_080389.1:37547851-37547863promoter 内 294-306 bp + 3695 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 37551558-37552934(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTGTA
SmilChr04G002397 Chr04 NC_080390.1:38529862-38529874promoter 内 1875-1887 bp + 2114 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 38524132-38527748(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTGGTAGGTAGA
SmilChr02G005109 Chr02 NC_080388.1:72601907-72601919promoter 内 923-935 bp + 3066 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 72597857-72598841(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAGGTTAGGTAAA
SmilChr01G001031 Chr01 NC_080387.1:21475374-21475386promoter 内 3358-3370 bp + 631 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 21469046-21474743(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAAGTAGGTAAG
SmilChr04G002541 Chr04 NC_080390.1:40697910-40697922promoter 内 3290-3302 bp - 699 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 40698621-40704264(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTGAGTAGGTAAG
SmilChr03G000355 Chr03 NC_080389.1:3975512-3975524promoter 内 2237-2249 bp - 1752 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 3977276-3978322(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAAGTAGGTAAG
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SmilChr03G000286 Chr03 NC_080389.1:3258961-3258973promoter 内 3889-3901 bp + 100 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 3256730-3258861(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGCGGTAGGTGCA
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SmilChr01G005237 Chr01 NC_080387.1:69936496-69936508promoter 内 3386-3398 bp + 603 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 69935416-69935893(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAAGTAGGTAGG
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SmilChr03G002294 Chr03 NC_080389.1:36146573-36146585promoter 内 3080-3092 bp - 909 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 36147494-36149380(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAAGTAGGTAAG
SmilChr05G001895 Chr05 NC_080391.1:19257618-19257630promoter 内 2830-2842 bp + 1159 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 19254953-19256459(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAAGTAGGTAAG
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SmilChr05G000082 Chr05 NC_080391.1:442892-442904promoter 内 2662-2674 bp + 1327 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 444231-446288(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTTAG