转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 37 / 143 下载 TSV

上一页 37 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002374 Chr01 NC_080387.1:40965030-40965041promoter 内 3169-3180 bp - 821 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 40960406-40964209(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGAC
SmilChr02G002068 Chr02 NC_080388.1:37225775-37225786promoter 内 3114-3125 bp - 876 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 37226662-37228325(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCAA
SmilChr01G003372 Chr01 NC_080387.1:52441802-52441813promoter 内 2936-2947 bp - 1054 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 52436918-52440748(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAGA
SmilChr03G001308 Chr03 NC_080389.1:15368251-15368262promoter 内 2859-2870 bp - 1131 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 15369393-15370731(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCAC
SmilChr02G000514 Chr02 NC_080388.1:7107423-7107434promoter 内 2826-2837 bp - 1164 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 7108598-7108704(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTAAC
SmilChr05G001584 Chr05 NC_080391.1:14545449-14545460promoter 内 2823-2834 bp - 1167 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 14543140-14544282(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTGAC
SmilChr08G002308 Chr08 NC_080394.1:21748528-21748539promoter 内 2347-2358 bp - 1643 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 21750182-21754624(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCAA
SmilChr04G002188 Chr04 NC_080390.1:35386976-35386987promoter 内 2301-2312 bp - 1689 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 35379602-35385287(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCAC
SmilChr03G003541 Chr03 NC_080389.1:54034291-54034302promoter 内 2259-2270 bp + 1731 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 54036033-54038069(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATA
SmilChr07G004723 Chr07 NC_080393.1:60122886-60122897promoter 内 2155-2166 bp + 1835 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 60110203-60121051(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCAA
SmilChr02G000140 Chr02 NC_080388.1:1871606-1871617promoter 内 2117-2128 bp - 1873 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 1873490-1874531(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTAAC
SmilChr01G001780 Chr01 NC_080387.1:32688573-32688584promoter 内 2019-2030 bp + 1971 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 32690555-32691341(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATA
SmilChr06G002542 Chr06 NC_080392.1:36461882-36461893promoter 内 1835-1846 bp - 2155 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 36458841-36459727(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTGAC
SmilChr07G002158 Chr07 NC_080393.1:19737739-19737750promoter 内 1735-1746 bp + 2255 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 19728434-19735484(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCAA
SmilChr03G000162 Chr03 NC_080389.1:1782640-1782651promoter 内 1654-1665 bp + 2336 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 1784987-1786606(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATA
SmilChr03G003211 Chr03 NC_080389.1:49714107-49714118promoter 内 1614-1625 bp + 2376 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 49716494-49725592(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTAGG
SmilChr05G002616 Chr05 NC_080391.1:29433990-29434001promoter 内 1575-1586 bp + 2415 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 29428360-29431575(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTAAC
SmilChr04G003231 Chr04 NC_080390.1:49136727-49136738promoter 内 1535-1546 bp - 2455 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 49139193-49140204(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCAA
SmilChr03G001228 Chr03 NC_080389.1:14162936-14162947promoter 内 1511-1522 bp + 2479 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 14165426-14166550(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTACAGCTGGG
SmilChr07G001533 Chr07 NC_080393.1:12417524-12417535promoter 内 1443-1454 bp + 2547 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 12409619-12414977(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTAAC
SmilChr05G000391 Chr05 NC_080391.1:2950288-2950299promoter 内 1327-1338 bp + 2663 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 2952962-2953927(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATA
SmilChr07G003411 Chr07 NC_080393.1:37156559-37156570promoter 内 1092-1103 bp + 2898 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 37150900-37153661(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCAA
SmilChr01G001982 Chr01 NC_080387.1:35215434-35215445promoter 内 1056-1067 bp - 2934 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 35210483-35212500(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATA
SmilChr01G001781 Chr01 NC_080387.1:32688573-32688584promoter 内 1020-1031 bp + 2970 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 32691554-32693498(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATA
SmilChr08G002451 Chr08 NC_080394.1:23326749-23326760promoter 内 839-850 bp + 3151 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 23317262-23323598(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCAA
SmilChr03G000285 Chr03 NC_080389.1:3253457-3253468promoter 内 774-785 bp + 3216 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 3248378-3250241(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTCCC
SmilChr02G001507 Chr02 NC_080388.1:28096797-28096808promoter 内 448-459 bp + 3542 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 28091874-28093255(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTCCC
SmilChr01G002896 Chr01 NC_080387.1:47662684-47662695promoter 内 394-405 bp + 3596 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 47656766-47659088(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCAA
SmilChr04G003745 Chr04 NC_080390.1:53744053-53744064promoter 内 300-311 bp - 3690 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 53747754-53748552(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCAA
SmilChr01G000090 Chr01 NC_080387.1:1640083-1640094promoter 内 176-187 bp + 3814 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 1643908-1649585(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAGA
SmilChr08G000643 Chr08 NC_080394.1:4793289-4793300promoter 内 173-184 bp + 3817 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 4797117-4798494(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAGA
SmilChr02G004782 Chr02 NC_080388.1:70000813-70000824promoter 内 129-140 bp + 3861 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 70004685-70006856(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTACAGCTGGG
SmilChr05G003024 Chr05 NC_080391.1:37779658-37779669promoter 内 2788-2799 bp - 1202 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 4 37780871-37793984(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAAT
SmilChr01G005016 Chr01 NC_080387.1:68167701-68167712promoter 内 2417-2428 bp - 1573 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 4 68161119-68166128(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGGA
SmilChr07G002844 Chr07 NC_080393.1:28545576-28545587promoter 内 2040-2051 bp - 1950 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 4 28542002-28543626(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGGA
SmilChr01G005121 Chr01 NC_080387.1:69016773-69016784promoter 内 3156-3167 bp - 834 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 69017618-69022027(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTAAT
SmilChr08G001572 Chr08 NC_080394.1:12936957-12936968promoter 内 2556-2567 bp - 1434 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 12938402-12939855(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAAT
SmilChr07G001732 Chr07 NC_080393.1:14730120-14730131promoter 内 676-687 bp - 3314 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 14725952-14726806(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTACAGCTGGT
SmilChr08G000910 Chr08 NC_080394.1:6721105-6721116promoter 内 3903-3914 bp - 87 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 6721203-6725136(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTAAC
SmilChr08G001238 Chr08 NC_080394.1:9910138-9910149promoter 内 3855-3866 bp - 135 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 9910284-9910355(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAAT
SmilChr03G002195 Chr03 NC_080389.1:34576780-34576791promoter 内 3071-3082 bp - 919 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 34574705-34575861(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGGA
SmilChr06G001640 Chr06 NC_080392.1:18494639-18494650promoter 内 3033-3044 bp - 957 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 18495607-18500657(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTAAT
SmilChr05G001596 Chr05 NC_080391.1:14667580-14667591promoter 内 2720-2731 bp - 1270 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 14668861-14673370(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCGC
SmilChr01G000389 Chr01 NC_080387.1:8012327-8012338promoter 内 2634-2645 bp + 1356 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 8008665-8010971(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCGC
SmilChr07G002593 Chr07 NC_080393.1:24932485-24932496promoter 内 2516-2527 bp + 1474 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 24927043-24931011(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTAAT
SmilChr03G004044 Chr03 NC_080389.1:59433138-59433149promoter 内 2476-2487 bp + 1514 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 59430620-59431624(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAAT
SmilChr03G004022 Chr03 NC_080389.1:59190863-59190874promoter 内 2403-2414 bp - 1587 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 59192461-59197626(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTAAT
SmilChr08G001239 Chr08 NC_080394.1:9910138-9910149promoter 内 2348-2359 bp - 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 9911791-9911862(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAAT
SmilChr03G001659 Chr03 NC_080389.1:21536327-21536338promoter 内 2226-2237 bp + 1764 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 21534010-21534563(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCGC
SmilChr05G004034 Chr05 NC_080391.1:54318402-54318413promoter 内 2180-2191 bp + 1810 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 54311911-54316592(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCCG