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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G004246; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021799-RA_Salv SmilChr08G004246 WRKY XP_057780410.1 MP00422 AAAAGTCAACGAT

可能结合的靶基因

9791 个结合位点 6535 个候选靶基因 第 39 / 131 下载 TSV

上一页 39 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003001 Chr01 NC_080387.1:48985210-48985222promoter 内 2778-2790 bp - 1211 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 48986433-48988887(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GACATTGACTTTT
SmilChr02G000089 Chr02 NC_080388.1:1158922-1158934promoter 内 2567-2579 bp - 1422 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 1160356-1161657(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AGGGTTGACTTCA
SmilChr03G000789 Chr03 NC_080389.1:8999642-8999654promoter 内 2449-2461 bp + 1540 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 8992586-8998102(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GGTGTTGACTATT
SmilChr03G001102 Chr03 NC_080389.1:12676742-12676754promoter 内 2446-2458 bp - 1543 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 12678297-12684786(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 CTAGTTGACTATT
SmilChr02G000814 Chr02 NC_080388.1:13628636-13628648promoter 内 2387-2399 bp + 1602 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 13624671-13627034(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCGTTGACATTT
SmilChr01G005498 Chr01 NC_080387.1:71877630-71877642promoter 内 2110-2122 bp + 1879 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 71879521-71881653(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAATGTCAACGAT
SmilChr03G001103 Chr03 NC_080389.1:12695577-12695589promoter 内 2064-2076 bp - 1925 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 12691818-12693652(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 CTTAGTCAACGCT
SmilChr03G000984 Chr03 NC_080389.1:11146541-11146553promoter 内 1949-1961 bp + 2040 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 11148593-11149969(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATAAGTCAACACT
SmilChr03G000510 Chr03 NC_080389.1:5488737-5488749promoter 内 1417-1429 bp + 2572 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 5491321-5492306(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATAAGTCAACACT
SmilChr03G000938 Chr03 NC_080389.1:10670171-10670183promoter 内 1101-1113 bp + 2888 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 10673071-10674949(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATAAGTCAACACT
SmilChr03G000474 Chr03 NC_080389.1:5042572-5042584promoter 内 648-660 bp - 3341 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 5045925-5046758(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AGTGTTGACTTAT
SmilChr01G005794 Chr01 NC_080387.1:74026173-74026185promoter 内 442-454 bp - 3547 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 74029732-74031621(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 TCTGTTGACTTTA
SmilChr01G005497 Chr01 NC_080387.1:71877630-71877642promoter 内 388-400 bp + 3601 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 71870273-71874029(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCGTTGACATTT
SmilChr02G004491 Chr02 NC_080388.1:67411446-67411458promoter 内 334-346 bp + 3655 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 67405402-67407791(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ACGGTTGACTTGC
SmilChr01G003000 Chr01 NC_080387.1:48985210-48985222promoter 内 281-293 bp - 3708 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 48980029-48981502(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAATGTC
SmilChr01G004532 Chr01 NC_080387.1:63498946-63498958promoter 内 267-279 bp + 3722 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 63493513-63495224(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 TTCGTTGACTATA
SmilChr01G003262 Chr01 NC_080387.1:51315259-51315271promoter 内 73-85 bp - 3916 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 51319187-51320931(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GCGGTTGACTTCA
SmilChr01G000792 Chr01 NC_080387.1:17213383-17213395promoter 内 3632-3644 bp + 357 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 17210660-17213026(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GAATTTGACTTTT
SmilChr01G002124 Chr01 NC_080387.1:37240505-37240517promoter 内 3364-3376 bp + 625 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 37236574-37239880(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 TGATTTGACTTTT
SmilChr01G005978 Chr01 NC_080387.1:75444013-75444025promoter 内 3218-3230 bp + 771 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 75438795-75443242(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GAATTTGACTTTT
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SmilChr02G005248 Chr02 NC_080388.1:73632241-73632253promoter 内 2858-2870 bp - 1131 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 73633384-73638666(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AACATTGACTTTT
SmilChr01G002169 Chr01 NC_080387.1:37795215-37795227promoter 内 2085-2097 bp - 1904 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 37793240-37793311(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAATCA
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SmilChr01G001874 Chr01 NC_080387.1:33769916-33769928promoter 内 633-645 bp + 3356 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 33760644-33766560(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 TGCATTGACTTTT
SmilChr01G000551 Chr01 NC_080387.1:11461478-11461490promoter 内 564-576 bp + 3425 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 11464915-11488037(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 CAGAGTCAACTGC
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SmilChr01G005403 Chr01 NC_080387.1:71295666-71295678promoter 内 3819-3831 bp + 170 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 71295848-71297322(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 TAAAGTCAAAGCA
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SmilChr01G004801 Chr01 NC_080387.1:66227942-66227954promoter 内 2993-3005 bp + 996 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 66228950-66232834(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAATCA
SmilChr02G004386 Chr02 NC_080388.1:66200701-66200713promoter 内 2388-2400 bp - 1601 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 66202314-66205202(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GCAGTTGACTCTG
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SmilChr03G000890 Chr03 NC_080389.1:10163337-10163349promoter 内 1989-2001 bp + 2000 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 10165349-10166841(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GATAGTCAACTAT
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SmilChr02G005212 Chr02 NC_080388.1:73339776-73339788promoter 内 1887-1899 bp - 2102 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 73335162-73337674(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 CTAAGTCAACCTC
SmilChr01G004166 Chr01 NC_080387.1:60164783-60164795promoter 内 1297-1309 bp - 2692 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 60157280-60162091(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 TAAAGTCAAAGCA
SmilChr01G001154 Chr01 NC_080387.1:23495505-23495517promoter 内 1272-1284 bp + 2717 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 23498234-23508312(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AGAAGTCAACATC
SmilChr02G001179 Chr02 NC_080388.1:21668101-21668113promoter 内 1243-1255 bp - 2746 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 21661969-21665355(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AGAAGTCAACATC
SmilChr01G004146 Chr01 NC_080387.1:59981102-59981114promoter 内 1222-1234 bp - 2767 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 59983881-59989552(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GGGTTTGACTTTG
SmilChr01G005377 Chr01 NC_080387.1:70998106-70998118promoter 内 1195-1207 bp - 2794 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 70990844-70995312(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 CAAAGTCAAACCC
SmilChr02G002638 Chr02 NC_080388.1:45776256-45776268promoter 内 937-949 bp - 3052 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 45779320-45788747(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ACAGTTGACTCTG
SmilChr03G001689 Chr03 NC_080389.1:22359647-22359659promoter 内 751-763 bp - 3238 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 22362897-22363003(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GTCTTTGACTTCT
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SmilChr02G005124 Chr02 NC_080388.1:72714265-72714277promoter 内 36-48 bp + 3953 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 72706994-72710312(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GAGGTTGACTTGG
SmilChr02G000973 Chr02 NC_080388.1:17013461-17013473promoter 内 24-36 bp + 3965 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 17017438-17018094(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AGAAGTCAACATC