转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001111; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023725-RA_Salv SmilChr06G001111 MYB XP_057768512.1 MP00388 AAAGTTAGGTATAA

可能结合的靶基因

9774 个结合位点 6870 个候选靶基因 第 4 / 138 下载 TSV

上一页 4 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003404 Chr01 NC_080387.1:52717507-52717520promoter 内 3964-3977 bp - 24 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 52717544-52721301(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CCTTACCTAACACT
SmilChr02G001409 Chr02 NC_080388.1:26718418-26718431promoter 内 3558-3571 bp + 430 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 26718861-26721403(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AATGTTAGGTCCGG
SmilChr01G004095 Chr01 NC_080387.1:59414734-59414747promoter 内 3417-3430 bp - 571 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 59411201-59414163(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AAAGTTAGGTGGAG
SmilChr02G002966 Chr02 NC_080388.1:50175092-50175105promoter 内 3352-3365 bp + 636 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 50171870-50174456(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TCCTACCTAACTAG
SmilChr01G002780 Chr01 NC_080387.1:46262318-46262331promoter 内 3145-3158 bp - 843 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 46263174-46268254(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CGTTACCTAACTTT
SmilChr03G000431 Chr03 NC_080389.1:4670222-4670235promoter 内 2943-2956 bp + 1045 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 4668593-4669177(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GTATACCTAACCTT
SmilChr02G004647 Chr02 NC_080388.1:68913607-68913620promoter 内 2501-2514 bp + 1487 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 68906280-68912120(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CGGTACCTAACCTA
SmilChr03G001395 Chr03 NC_080389.1:16548993-16549006promoter 内 2312-2325 bp + 1676 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 16545470-16547317(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CCGGACCTAACATT
SmilChr01G004488 Chr01 NC_080387.1:63009410-63009423promoter 内 2075-2088 bp + 1913 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 63011336-63014466(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AGTGTTAGGTACGT
SmilChr03G000430 Chr03 NC_080389.1:4670222-4670235promoter 内 2029-2042 bp + 1959 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 4666578-4668263(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GTATACCTAACCTT
SmilChr02G000708 Chr02 NC_080388.1:11398219-11398232promoter 内 1807-1820 bp + 2181 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 11393227-11396038(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CCGGACCTAACATT
SmilChr02G002986 Chr02 NC_080388.1:50474029-50474042promoter 内 1174-1187 bp - 2814 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 50476856-50479922(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TGATACCTAACTTT
SmilChr01G002508 Chr01 NC_080387.1:42970968-42970981promoter 内 782-795 bp - 3206 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 42964801-42967762(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ATTGTTAGGTAGAG
SmilChr03G000373 Chr03 NC_080389.1:4170886-4170899promoter 内 682-695 bp + 3306 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 4164639-4167580(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTGTACCTAACATG
SmilChr02G000198 Chr02 NC_080388.1:2537468-2537481promoter 内 605-618 bp - 3383 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 2517107-2534085(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AATGTTAGGTCCGG
SmilChr02G003044 Chr02 NC_080388.1:51235335-51235348promoter 内 441-454 bp - 3547 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 51230962-51231788(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AATGTTAGGTCCGG
SmilChr03G001875 Chr03 NC_080389.1:26014646-26014659promoter 内 76-89 bp - 3912 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 26018571-26022345(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CCGGACCTAACATT
SmilChr01G003794 Chr01 NC_080387.1:56335977-56335990promoter 内 3929-3942 bp + 59 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 56335848-56335918(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TCCTACCTAACAAT
SmilChr01G003793 Chr01 NC_080387.1:56335977-56335990promoter 内 3639-3652 bp + 349 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 56334125-56335628(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TCCTACCTAACAAT
SmilChr03G001050 Chr03 NC_080389.1:12226347-12226360promoter 内 3120-3133 bp - 868 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 12227228-12228491(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GTATACCTAACCTT
SmilChr02G002896 Chr02 NC_080388.1:49238498-49238511promoter 内 2493-2506 bp - 1495 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 49240006-49243113(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TCCTACCTAACTAG
SmilChr02G005177 Chr02 NC_080388.1:73066165-73066178promoter 内 2343-2356 bp + 1645 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 73062182-73064520(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ATTTACCTAACTTA
SmilChr01G004185 Chr01 NC_080387.1:60282605-60282618promoter 内 2145-2158 bp - 1843 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 60284461-60287505(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TGATACCTAACTTT
SmilChr01G005914 Chr01 NC_080387.1:74976467-74976480promoter 内 1243-1256 bp - 2745 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 74979225-74984711(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTGTACCTAACATG
SmilChr01G001280 Chr01 NC_080387.1:25588978-25588991promoter 内 1148-1161 bp - 2840 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 25591831-25593134(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CCGGACCTAACATT
SmilChr01G000433 Chr01 NC_080387.1:8664547-8664560promoter 内 1089-1102 bp + 2899 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 8658607-8661648(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CCGGACCTAACATT
SmilChr01G003348 Chr01 NC_080387.1:52237860-52237873promoter 内 894-907 bp - 3094 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 52234547-52234766(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTGGTTAGGTAGGA
SmilChr01G005473 Chr01 NC_080387.1:71713107-71713120promoter 内 447-460 bp + 3541 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 71716661-71719500(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AGAGTTAGGTGCAG
SmilChr01G005017 Chr01 NC_080387.1:68173412-68173425promoter 内 444-457 bp + 3544 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 68167299-68169868(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TCATACCTACCTTG
SmilChr02G004120 Chr02 NC_080388.1:63475538-63475551promoter 内 405-418 bp - 3583 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 63479134-63483294(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 GTATACCTAACCTT
SmilChr02G003341 Chr02 NC_080388.1:54621300-54621313promoter 内 393-406 bp + 3595 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 54624908-54629749(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TAGGTTAGGTACCG
SmilChr01G002483 Chr01 NC_080387.1:42562947-42562960promoter 内 3383-3396 bp + 605 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 42558945-42562342(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ACTTACCTAACTAT
SmilChr02G000177 Chr02 NC_080388.1:2265790-2265803promoter 内 3028-3041 bp - 960 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 2266763-2270938(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CGGTACCTAACTTG
SmilChr03G002432 Chr03 NC_080389.1:38625261-38625274promoter 内 3002-3015 bp - 986 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 38626260-38630452(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CGGTACCTAACTTG
SmilChr01G000903 Chr01 NC_080387.1:19087804-19087817promoter 内 2584-2597 bp - 1404 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 19085731-19086400(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 ATTGTTAGGTAAGG
SmilChr01G005294 Chr01 NC_080387.1:70265519-70265532promoter 内 2525-2538 bp - 1463 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 70266995-70270703(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CGGTACCTAACTTG
SmilChr02G003570 Chr02 NC_080388.1:56865172-56865185promoter 内 2458-2471 bp - 1530 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 56866715-56870048(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CGGTACCTAACTTG
SmilChr01G000012 Chr01 NC_080387.1:276196-276209promoter 内 2391-2404 bp + 1597 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 271082-274599(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CGGTACCTAACTTG
SmilChr02G001032 Chr02 NC_080388.1:18263339-18263352promoter 内 2348-2361 bp - 1640 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 18264992-18268102(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CGGTACCTAACTTG
SmilChr03G001242 Chr03 NC_080389.1:14314493-14314506promoter 内 2263-2276 bp + 1725 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 14309318-14312768(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CGGTACCTAACTTG
SmilChr01G001152 Chr01 NC_080387.1:23474078-23474091promoter 内 2225-2238 bp - 1763 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 23475854-23482002(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CGGTACCTAACTTG
SmilChr03G001480 Chr03 NC_080389.1:17854158-17854171promoter 内 2160-2173 bp + 1828 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 17849127-17852330(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CGGTACCTAACTTG
SmilChr03G000765 Chr03 NC_080389.1:8746911-8746924promoter 内 2106-2119 bp - 1882 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 8748806-8752097(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CGGTACCTAACTTG
SmilChr03G000468 Chr03 NC_080389.1:4992142-4992155promoter 内 2041-2054 bp - 1947 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 4994102-4997403(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CGGTACCTAACTTG
SmilChr03G000639 Chr03 NC_080389.1:7038053-7038066promoter 内 1904-1917 bp + 2084 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 7032952-7035969(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CGGTACCTAACTTG
SmilChr03G000819 Chr03 NC_080389.1:9391820-9391833promoter 内 1837-1850 bp + 2151 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 9386835-9389669(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CGGTACCTAACTTG
SmilChr01G000948 Chr01 NC_080387.1:20065901-20065914promoter 内 1549-1562 bp + 2439 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 20068353-20077899(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 AAGGTTAGGTCCAA
SmilChr02G002183 Chr02 NC_080388.1:39032115-39032128promoter 内 1016-1029 bp - 2972 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 39035100-39037243(+) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CGGTACCTAACTTG
SmilChr01G005688 Chr01 NC_080387.1:73171559-73171572promoter 内 3110-3123 bp + 878 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 73168441-73170681(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 CCTCACCTAACTTT
SmilChr01G005727 Chr01 NC_080387.1:73417919-73417932promoter 内 2991-3004 bp + 997 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 73413251-73416922(-) SMil_00023725-RA_Salv MP00388 TTTTACCTAACTCC