转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 40 / 149 下载 TSV

上一页 40 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G002263 Chr05 NC_080391.1:24340496-24340506promoter 内 3978-3988 bp + 13 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 24340519-24344991(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCA
SmilChr06G000052 Chr06 NC_080392.1:423522-423532promoter 内 3978-3988 bp + 13 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 423545-428023(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCA
SmilChr01G004739 Chr01 NC_080387.1:65583489-65583499promoter 内 3966-3976 bp + 25 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 65583524-65588628(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCA
SmilChr01G005677 Chr01 NC_080387.1:73050294-73050304promoter 内 3838-3848 bp - 153 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 73050457-73051714(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAC
SmilChr01G000516 Chr01 NC_080387.1:10612354-10612364promoter 内 3830-3840 bp + 161 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 10611243-10612193(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr02G001018 Chr02 NC_080388.1:17957118-17957128promoter 内 3721-3731 bp - 270 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 17957398-17959035(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAGG
SmilChr03G003439 Chr03 NC_080389.1:52785825-52785835promoter 内 3687-3697 bp + 304 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 52782533-52785521(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr04G000364 Chr04 NC_080390.1:3655148-3655158promoter 内 3574-3584 bp - 417 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 3654240-3654731(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCA
SmilChr01G003588 Chr01 NC_080387.1:54430383-54430393promoter 内 3470-3480 bp + 521 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 54430914-54433917(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCA
SmilChr07G002106 Chr07 NC_080393.1:19161451-19161461promoter 内 3436-3446 bp + 555 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 19156201-19160896(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAGG
SmilChr05G000602 Chr05 NC_080391.1:4534482-4534492promoter 内 3425-3435 bp - 566 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 4531464-4533916(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCTGGCTGTCA
SmilChr01G005860 Chr01 NC_080387.1:74526858-74526868promoter 内 3416-3426 bp + 575 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 74524119-74526283(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr07G002094 Chr07 NC_080393.1:19058615-19058625promoter 内 3367-3377 bp + 624 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 19053381-19057991(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAGG
SmilChr03G002572 Chr03 NC_080389.1:40903716-40903726promoter 内 3361-3371 bp - 630 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 40904356-40905561(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAGG
SmilChr07G003190 Chr07 NC_080393.1:33955503-33955513promoter 内 3339-3349 bp + 652 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 33956165-33958895(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCA
SmilChr07G003189 Chr07 NC_080393.1:33955503-33955513promoter 内 3296-3306 bp + 695 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 33953404-33954808(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr01G002191 Chr01 NC_080387.1:38060434-38060444promoter 内 2969-2979 bp - 1022 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 38061466-38062409(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr01G003758 Chr01 NC_080387.1:55971403-55971413promoter 内 2773-2783 bp - 1218 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 55972631-55975320(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr05G004311 Chr05 NC_080391.1:56797909-56797919promoter 内 2689-2699 bp - 1302 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 56796236-56796607(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCTGGCTGTCA
SmilChr04G000198 Chr04 NC_080390.1:1778186-1778196promoter 内 2646-2656 bp - 1345 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 1773695-1776841(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCA
SmilChr06G001698 Chr06 NC_080392.1:19490672-19490682promoter 内 2536-2546 bp - 1455 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 19487937-19489217(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCA
SmilChr05G003713 Chr05 NC_080391.1:50248158-50248168promoter 内 2469-2479 bp + 1522 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 50249690-50253201(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCA
SmilChr03G000381 Chr03 NC_080389.1:4264635-4264645promoter 内 2383-2393 bp + 1608 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 4261829-4263027(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr04G001402 Chr04 NC_080390.1:22828744-22828754promoter 内 2336-2346 bp + 1655 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 22830409-22832070(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCTGGCTGTCA
SmilChr02G000523 Chr02 NC_080388.1:7178362-7178372promoter 内 2188-2198 bp - 1803 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 7180175-7183488(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr06G002237 Chr06 NC_080392.1:31637050-31637060promoter 内 2114-2124 bp - 1877 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 31638937-31640624(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr01G000524 Chr01 NC_080387.1:10699683-10699693promoter 内 2105-2115 bp + 1886 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 10701579-10702581(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCTGGCTGTCA
SmilChr01G005868 Chr01 NC_080387.1:74622839-74622849promoter 内 2094-2104 bp + 1897 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 74618551-74620942(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr05G004346 Chr05 NC_080391.1:57088470-57088480promoter 内 2073-2083 bp + 1918 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 57090398-57092113(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCA
SmilChr07G000222 Chr07 NC_080393.1:1424909-1424919promoter 内 1995-2005 bp + 1996 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 1421907-1422913(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr03G001892 Chr03 NC_080389.1:26426632-26426642promoter 内 1992-2002 bp + 1999 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 26428641-26428979(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCA
SmilChr04G003573 Chr04 NC_080390.1:52152203-52152213promoter 内 1746-1756 bp + 2245 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 52149441-52149958(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr01G002192 Chr01 NC_080387.1:38060434-38060444promoter 内 1730-1740 bp - 2261 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 38062705-38063397(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr02G002903 Chr02 NC_080388.1:49344590-49344600promoter 内 1585-1595 bp - 2406 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 49347006-49348582(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr01G005708 Chr01 NC_080387.1:73312963-73312973promoter 内 1426-1436 bp - 2565 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 73315538-73316278(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr07G001873 Chr07 NC_080393.1:16213130-16213140promoter 内 1336-1346 bp - 2655 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 16205718-16210475(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCA
SmilChr04G000556 Chr04 NC_080390.1:6223745-6223755promoter 内 1249-1259 bp + 2742 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 6219004-6221003(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr06G002236 Chr06 NC_080392.1:31637050-31637060promoter 内 1249-1259 bp - 2742 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 31633406-31634308(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCA
SmilChr01G002368 Chr01 NC_080387.1:40877540-40877550promoter 内 1235-1245 bp + 2756 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 40872592-40874784(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr05G004345 Chr05 NC_080391.1:57088470-57088480promoter 内 1188-1198 bp + 2803 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 57080259-57085667(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr01G005525 Chr01 NC_080387.1:72122353-72122363promoter 内 1147-1157 bp - 2844 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 72125207-72127564(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr01G003088 Chr01 NC_080387.1:49701463-49701473promoter 内 1111-1121 bp - 2880 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 49704353-49705442(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr04G001635 Chr04 NC_080390.1:27123291-27123301promoter 内 1028-1038 bp - 2963 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 27126264-27131089(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr01G001604 Chr01 NC_080387.1:30207964-30207974promoter 内 948-958 bp - 3043 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 30200381-30204921(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCTGGCTGTCA
SmilChr02G004094 Chr02 NC_080388.1:63261553-63261563promoter 内 541-551 bp - 3450 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 63253781-63258103(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCA
SmilChr07G002411 Chr07 NC_080393.1:22480883-22480893promoter 内 519-529 bp - 3472 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 22476000-22477411(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCA
SmilChr01G004740 Chr01 NC_080387.1:65596888-65596898promoter 内 470-480 bp - 3521 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 65592655-65593367(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTCG
SmilChr04G001634 Chr04 NC_080390.1:27123291-27123301promoter 内 369-379 bp - 3622 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 27117745-27119669(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCA
SmilChr06G000084 Chr06 NC_080392.1:621591-621601promoter 内 263-273 bp + 3728 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 617296-617863(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTT
SmilChr04G001117 Chr04 NC_080390.1:16065279-16065289promoter 内 227-237 bp - 3764 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 16060810-16061515(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCTGGCTGTCA