转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 41 / 134 下载 TSV

上一页 41 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004483 Chr01 NC_080387.1:62959219-62959233promoter 内 230-244 bp + 3757 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 62962990-62965431(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAGGAAATGATTAC
SmilChr03G001874 Chr03 NC_080389.1:26000601-26000615promoter 内 110-124 bp - 3877 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 26004492-26007007(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATTATTACTTTA
SmilChr01G001432 Chr01 NC_080387.1:27967646-27967660promoter 内 24-38 bp + 3963 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 27971623-27972426(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAGGAAATGATTAC
SmilChr02G002797 Chr02 NC_080388.1:48064531-48064545promoter 内 23-37 bp - 3964 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 48068509-48076124(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCACAGCC
SmilChr01G001622 Chr01 NC_080387.1:30314289-30314303promoter 内 3-17 bp + 3984 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 30308143-30310305(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTATAAAT
SmilChr02G001470 Chr02 NC_080388.1:27419607-27419621promoter 内 3064-3078 bp - 923 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 7 27420544-27430032(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATGATTACTTTT
SmilChr03G000110 Chr03 NC_080389.1:1214830-1214844promoter 内 506-520 bp - 3481 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 7 1208334-1211349(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAAGTAATCATTGA
SmilChr01G004295 Chr01 NC_080387.1:61146743-61146757promoter 内 3833-3847 bp + 154 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 6 61142915-61146589(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATTATTACTTTC
SmilChr01G004420 Chr01 NC_080387.1:62323560-62323574promoter 内 3457-3471 bp - 530 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 6 62324104-62326616(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATGATTACTTTT
SmilChr03G002985 Chr03 NC_080389.1:46672986-46673000promoter 内 3314-3328 bp + 673 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 5 46673673-46681349(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAAAGTAATAATTAT
SmilChr01G003141 Chr01 NC_080387.1:50247439-50247453promoter 内 3977-3991 bp + 10 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 4 50247463-50250725(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAAACTAATGATTAA
SmilChr02G003131 Chr02 NC_080388.1:52341756-52341770promoter 内 2389-2403 bp + 1598 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 4 52337056-52340158(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATGATTACTTTT
SmilChr02G003878 Chr02 NC_080388.1:60842980-60842994promoter 内 3921-3935 bp + 66 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 60843060-60846333(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAGGTAATGATTGA
SmilChr01G006036 Chr01 NC_080387.1:75870758-75870772promoter 内 3625-3639 bp + 362 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 75871134-75873733(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AGAAGTAATTATGAC
SmilChr01G002130 Chr01 NC_080387.1:37301627-37301641promoter 内 3517-3531 bp - 470 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 37299917-37301157(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAAGTAATCATTGA
SmilChr01G000365 Chr01 NC_080387.1:7559085-7559099promoter 内 3065-3079 bp - 922 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 7560021-7567150(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATGATTACTTTT
SmilChr02G003892 Chr02 NC_080388.1:61014198-61014212promoter 内 2409-2423 bp + 1578 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 61015790-61018966(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATGACAATGATTAA
SmilChr01G005127 Chr01 NC_080387.1:69071692-69071706promoter 内 2100-2114 bp + 1887 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 69064746-69069805(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATCATCACCCAT
SmilChr01G002631 Chr01 NC_080387.1:44613669-44613683promoter 内 1450-1464 bp - 2537 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 44609104-44611132(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TGTCATAATGATTAT
SmilChr01G002134 Chr01 NC_080387.1:37338571-37338585promoter 内 809-823 bp + 3178 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 37333668-37335393(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCGTTATC
SmilChr01G006034 Chr01 NC_080387.1:75870758-75870772promoter 内 197-211 bp + 3790 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 75864334-75866968(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATAATTACTTCT
SmilChr02G000030 Chr02 NC_080388.1:369511-369525promoter 内 3953-3967 bp + 34 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 369559-370816(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAAACTAATGATTAA
SmilChr02G003173 Chr02 NC_080388.1:52837443-52837457promoter 内 3941-3955 bp + 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 52836867-52837397(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATCATCACATGC
SmilChr02G004982 Chr02 NC_080388.1:71704152-71704166promoter 内 3916-3930 bp - 71 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 71701068-71704081(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AGGGACAATGATTAT
SmilChr01G001311 Chr01 NC_080387.1:26065726-26065740promoter 内 3851-3865 bp + 136 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 26065876-26072227(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATGACAATGATTAA
SmilChr01G001185 Chr01 NC_080387.1:23966948-23966962promoter 内 3523-3537 bp + 464 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 23967426-23968862(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAAACTAATGATTAA
SmilChr01G005128 Chr01 NC_080387.1:69071692-69071706promoter 内 3187-3201 bp + 800 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 69072506-69077970(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATGGGTGATGATTAG
SmilChr03G000443 Chr03 NC_080389.1:4760596-4760610promoter 内 3170-3184 bp + 817 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 4750249-4759779(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATGTCG
SmilChr02G002397 Chr02 NC_080388.1:41863393-41863407promoter 内 2832-2846 bp - 1155 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 41864562-41864632(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTGTGTTA
SmilChr01G002632 Chr01 NC_080387.1:44613669-44613683promoter 内 2352-2366 bp - 1635 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 44615318-44617660(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATGACA
SmilChr01G003643 Chr01 NC_080387.1:54921716-54921730promoter 内 2287-2301 bp - 1700 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 54923430-54924421(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCAATCATTGCTGTC
SmilChr01G005375 Chr01 NC_080387.1:70981927-70981941promoter 内 2192-2206 bp - 1795 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 70973790-70980132(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACAAATAATGATGAA
SmilChr01G000430 Chr01 NC_080387.1:8590091-8590105promoter 内 2165-2179 bp + 1822 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 8591927-8592436(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACAAATAATGATGAA
SmilChr03G003074 Chr03 NC_080389.1:47778401-47778415promoter 内 2101-2115 bp - 1886 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 47770895-47776515(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CGACGTAATGATTGT
SmilChr03G002769 Chr03 NC_080389.1:44045226-44045240promoter 内 2066-2080 bp - 1921 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 44043000-44043305(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAAAGTAATAATTGC
SmilChr01G001055 Chr01 NC_080387.1:21893103-21893117promoter 内 2034-2048 bp + 1953 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 21887929-21891150(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTATCCAT
SmilChr01G004132 Chr01 NC_080387.1:59836728-59836742promoter 内 2003-2017 bp + 1984 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 59838726-59842156(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAAAGTAATAATTAT
SmilChr01G004141 Chr01 NC_080387.1:59914369-59914383promoter 内 1170-1184 bp + 2817 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 59900126-59911552(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTGTATAT
SmilChr02G001177 Chr02 NC_080388.1:21635144-21635158promoter 内 1132-1146 bp + 2855 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 21638013-21644647(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CAAACTAATGATTAG
SmilChr02G005516 Chr02 NC_080388.1:75268026-75268040promoter 内 1113-1127 bp - 2874 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 75261693-75265152(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCAAATAATGATTAA
SmilChr01G003644 Chr01 NC_080387.1:54921716-54921730promoter 内 596-610 bp - 3391 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 54925121-54932996(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCAATCATTGCTGTC
SmilChr02G003301 Chr02 NC_080388.1:54290643-54290657promoter 内 3955-3969 bp + 32 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 54286934-54290611(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCAGATTT
SmilChr02G003877 Chr02 NC_080388.1:60842980-60842994promoter 内 3909-3923 bp + 78 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 60841804-60842902(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTACCTAA
SmilChr01G001422 Chr01 NC_080387.1:27830998-27831012promoter 内 3822-3836 bp + 165 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 27831177-27835759(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAGCTAATGATTGA
SmilChr03G000939 Chr03 NC_080389.1:10680465-10680479promoter 内 3636-3650 bp - 351 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 10680830-10685763(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCACGCTA
SmilChr01G000433 Chr01 NC_080387.1:8662002-8662016promoter 内 3633-3647 bp - 354 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 8658607-8661648(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATGACAATGATTAA
SmilChr01G002799 Chr01 NC_080387.1:46478949-46478963promoter 内 3623-3637 bp - 364 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 46479327-46490497(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCCATCATTACCAAG
SmilChr02G004523 Chr02 NC_080388.1:67806812-67806826promoter 内 3575-3589 bp - 412 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 67804210-67806400(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CAATCTAATGATGAG
SmilChr02G000740 Chr02 NC_080388.1:11991425-11991439promoter 内 3478-3492 bp - 509 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 11991948-11992729(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTATTCCT
SmilChr02G002399 Chr02 NC_080388.1:41878614-41878628promoter 内 3443-3457 bp + 544 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 41879172-41880548(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAAAGTAATAATTAT