转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 41 / 151 下载 TSV

上一页 41 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000055 Chr01 NC_080387.1:860222-860234promoter 内 2781-2793 bp + 1208 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 861442-864013(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTAAA
SmilChr02G002227 Chr02 NC_080388.1:39622258-39622270promoter 内 2346-2358 bp - 1643 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 39619583-39620615(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAATACA
SmilChr01G001431 Chr01 NC_080387.1:27964199-27964211promoter 内 2307-2319 bp + 1682 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 27959576-27962517(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTAGTAGGTAAA
SmilChr03G001106 Chr03 NC_080389.1:12746675-12746687promoter 内 2216-2228 bp + 1773 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 12748460-12752581(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTGCA
SmilChr02G001634 Chr02 NC_080388.1:30291689-30291701promoter 内 2201-2213 bp + 1788 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 30293489-30297610(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTGCA
SmilChr03G004087 Chr03 NC_080389.1:59777735-59777747promoter 内 2038-2050 bp + 1951 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 59771863-59775784(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTAGTAGGTAGA
SmilChr03G001125 Chr03 NC_080389.1:12950414-12950426promoter 内 1864-1876 bp + 2125 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 12952551-12958573(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTAAA
SmilChr04G002554 Chr04 NC_080390.1:40836252-40836264promoter 内 1794-1806 bp + 2195 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 40831681-40834057(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTAGTAGGTAAA
SmilChr05G000867 Chr05 NC_080391.1:6863094-6863106promoter 内 1609-1621 bp + 2380 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 6865486-6866897(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAATACA
SmilChr03G002570 Chr03 NC_080389.1:40882502-40882514promoter 内 1577-1589 bp + 2412 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 40884926-40889097(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTAAA
SmilChr01G004583 Chr01 NC_080387.1:63869634-63869646promoter 内 1421-1433 bp + 2568 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 63872214-63875822(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTAAA
SmilChr02G004366 Chr02 NC_080388.1:65947420-65947432promoter 内 1419-1431 bp - 2570 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 65950002-65951101(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGGTAGGTGCA
SmilChr01G002626 Chr01 NC_080387.1:44544888-44544900promoter 内 658-670 bp - 3331 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 44548231-44549162(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATATTAGGTAAG
SmilChr04G000831 Chr04 NC_080390.1:10452214-10452226promoter 内 309-321 bp + 3680 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 10455906-10456436(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTAACCTACCTTC
SmilChr01G001685 Chr01 NC_080387.1:31085434-31085446promoter 内 243-255 bp - 3746 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 31080667-31081688(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAATATA
SmilChr05G000904 Chr05 NC_080391.1:7171336-7171348promoter 内 159-171 bp + 3830 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 7164771-7167506(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCAGTAGGTAAA
SmilChr01G000700 Chr01 NC_080387.1:15692384-15692396promoter 内 3775-3787 bp + 214 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 15690510-15692170(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCGGTAGGTAGC
SmilChr03G002834 Chr03 NC_080389.1:44860867-44860879promoter 内 3636-3648 bp + 353 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 44856633-44860514(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCAGTAGGTAGA
SmilChr01G001495 Chr01 NC_080387.1:28806297-28806309promoter 内 3251-3263 bp - 738 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 28804866-28805559(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAATCAC
SmilChr01G001496 Chr01 NC_080387.1:28806297-28806309promoter 内 324-336 bp - 3665 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 3 28809974-28814378(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGATTAGGTAAG
SmilChr03G004058 Chr03 NC_080389.1:59536529-59536541promoter 内 3208-3220 bp - 781 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 59537322-59538837(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGGGGTAGGTACA
SmilChr05G000524 Chr05 NC_080391.1:4022049-4022061promoter 内 3174-3186 bp + 815 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 4016728-4021234(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGGGGTAGGTAAT
SmilChr04G004095 Chr04 NC_080390.1:55941853-55941865promoter 内 2960-2972 bp - 1029 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 55938388-55940824(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACTTTG
SmilChr03G001178 Chr03 NC_080389.1:13532241-13532253promoter 内 1520-1532 bp + 2469 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 13528672-13529772(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGATTAGGTAAG
SmilChr02G005418 Chr02 NC_080388.1:74642673-74642685promoter 内 1465-1477 bp + 2524 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 74637606-74640149(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGATTAGGTAAG
SmilChr03G002426 Chr03 NC_080389.1:38555145-38555157promoter 内 1202-1214 bp + 2787 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 38557944-38559092(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTGCA
SmilChr03G001924 Chr03 NC_080389.1:27005481-27005493promoter 内 981-993 bp - 3008 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 27001881-27002473(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCACCTACCCTA
SmilChr01G005058 Chr01 NC_080387.1:68493971-68493983promoter 内 717-729 bp - 3272 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 68497255-68498694(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGGTAGT
SmilChr04G001182 Chr04 NC_080390.1:17915245-17915257promoter 内 415-427 bp + 3574 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 17918831-17919376(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAACTAG
SmilChr02G004583 Chr02 NC_080388.1:68331985-68331997promoter 内 322-334 bp + 3667 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 68312853-68328318(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAGGGTAGGTAAT
SmilChr01G002941 Chr01 NC_080387.1:48186125-48186137promoter 内 290-302 bp + 3699 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 48189836-48193856(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACTTAT
SmilChr04G003992 Chr04 NC_080390.1:55318494-55318506promoter 内 3909-3921 bp + 80 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 55318586-55320245(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCTACCTACTTAT
SmilChr04G000938 Chr04 NC_080390.1:12271461-12271473promoter 内 3880-3892 bp + 109 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 12271582-12273883(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAACTAG
SmilChr01G003446 Chr01 NC_080387.1:53027118-53027130promoter 内 3830-3842 bp + 159 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 53027289-53033056(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTTGT
SmilChr01G003507 Chr01 NC_080387.1:53647440-53647452promoter 内 3826-3838 bp + 163 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 53647615-53653795(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTTGT
SmilChr05G000509 Chr05 NC_080391.1:3936052-3936064promoter 内 3628-3640 bp - 361 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 3933757-3935691(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACCTTT
SmilChr04G000386 Chr04 NC_080390.1:3917182-3917194promoter 内 3485-3497 bp + 504 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 3917698-3918165(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACCGGC
SmilChr03G003881 Chr03 NC_080389.1:57903361-57903373promoter 内 3371-3383 bp + 618 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 57900534-57902743(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGAGGTAGGTACC
SmilChr03G004685 Chr03 NC_080389.1:64254227-64254239promoter 内 3175-3187 bp + 814 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 64255053-64258501(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACCTTT
SmilChr01G004283 Chr01 NC_080387.1:61057201-61057213promoter 内 2901-2913 bp + 1088 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 61055231-61056113(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGGTAAT
SmilChr03G001321 Chr03 NC_080389.1:15466261-15466273promoter 内 2884-2896 bp - 1105 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 15463229-15465156(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCACCTACCATG
SmilChr04G000289 Chr04 NC_080390.1:2689082-2689094promoter 内 2836-2848 bp + 1153 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 2690247-2693195(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACCTCT
SmilChr03G001427 Chr03 NC_080389.1:16904588-16904600promoter 内 2563-2575 bp + 1426 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 16906026-16907941(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCACCTACCATG
SmilChr01G004473 Chr01 NC_080387.1:62825298-62825310promoter 内 2431-2443 bp + 1558 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 62826868-62826970(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCCGG
SmilChr03G001322 Chr03 NC_080389.1:15466261-15466273promoter 内 1802-1814 bp - 2187 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 15468460-15468531(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATGGTAGGTGCA
SmilChr04G000387 Chr04 NC_080390.1:3917182-3917194promoter 内 1693-1705 bp + 2296 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 3919490-3923807(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACCGGC
SmilChr01G005246 Chr01 NC_080387.1:69973706-69973718promoter 内 1660-1672 bp - 2329 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 69976047-69976967(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACAAGTAGGTAAA
SmilChr02G005247 Chr02 NC_080388.1:73614424-73614436promoter 内 1632-1644 bp + 2357 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 73616793-73625585(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACCTCT
SmilChr04G003312 Chr04 NC_080390.1:49845488-49845500promoter 内 1591-1603 bp + 2398 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 49842026-49843090(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTGTTAGGTAAA
SmilChr02G000694 Chr02 NC_080388.1:11030519-11030531promoter 内 1579-1591 bp + 2410 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 11032941-11043944(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACCCCC