转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 42 / 128 下载 TSV

上一页 42 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005888 Chr01 NC_080387.1:74796005-74796016promoter 内 905-916 bp - 3085 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 74799101-74807566(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GTCTCTGTTTCC
SmilChr01G005593 Chr01 NC_080387.1:72576145-72576156promoter 内 835-846 bp - 3155 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 72572491-72572990(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAGAC
SmilChr02G003783 Chr02 NC_080388.1:59505146-59505157promoter 内 806-817 bp - 3184 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 59497781-59501962(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGAT
SmilChr02G004067 Chr02 NC_080388.1:62960280-62960291promoter 内 761-772 bp - 3229 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 62950342-62957051(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGAT
SmilChr02G003767 Chr02 NC_080388.1:59376662-59376673promoter 内 698-709 bp - 3292 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 59368358-59373370(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGAA
SmilChr02G004935 Chr02 NC_080388.1:71338299-71338310promoter 内 687-698 bp - 3303 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 71328852-71334996(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAGAC
SmilChr01G002239 Chr01 NC_080387.1:38941659-38941670promoter 内 670-681 bp + 3320 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 38935535-38938339(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTCA
SmilChr01G004630 Chr01 NC_080387.1:64352278-64352289promoter 内 639-650 bp - 3351 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 64342412-64348927(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGAA
SmilChr03G000498 Chr03 NC_080389.1:5316988-5316999promoter 内 639-650 bp - 3351 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 5320350-5320955(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AACTCTGTTTTG
SmilChr03G000792 Chr03 NC_080389.1:9012682-9012693promoter 内 635-646 bp + 3355 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 9008719-9009327(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AACTCTGTTTTG
SmilChr02G005343 Chr02 NC_080388.1:74258327-74258338promoter 内 630-641 bp + 3360 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 74253449-74254967(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATCTCTGTTTCT
SmilChr01G000179 Chr01 NC_080387.1:2944335-2944346promoter 内 608-619 bp + 3382 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 2940477-2940953(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GTCTCTGTTTCC
SmilChr02G000360 Chr02 NC_080388.1:4640062-4640073promoter 内 590-601 bp - 3400 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 4643473-4647673(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTTA
SmilChr02G004840 Chr02 NC_080388.1:70537381-70537392promoter 内 579-590 bp + 3411 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 70524776-70533970(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATCTCTGTTTCT
SmilChr03G000695 Chr03 NC_080389.1:7762568-7762579promoter 内 512-523 bp - 3478 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 7757822-7759090(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGAA
SmilChr02G003812 Chr02 NC_080388.1:59747534-59747545promoter 内 460-471 bp - 3530 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 59740148-59744004(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGAT
SmilChr03G000793 Chr03 NC_080389.1:9012682-9012693promoter 内 418-429 bp + 3572 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 9016265-9021580(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAGTT
SmilChr02G002150 Chr02 NC_080388.1:38712332-38712343promoter 内 384-395 bp + 3606 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 38705392-38708726(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATCTCTGTTTCT
SmilChr01G005566 Chr01 NC_080387.1:72461012-72461023promoter 内 169-180 bp + 3821 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 72451656-72457191(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CCCTCTGTTTCA
SmilChr01G000635 Chr01 NC_080387.1:14276506-14276517promoter 内 3278-3289 bp + 712 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 20 14277229-14280357(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr02G000541 Chr02 NC_080388.1:7451611-7451622promoter 内 2641-2652 bp - 1349 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 6 7452971-7461152(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTG
SmilChr01G001084 Chr01 NC_080387.1:22269843-22269854promoter 内 1922-1933 bp + 2068 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 6 22267275-22267775(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTG
SmilChr02G000078 Chr02 NC_080388.1:1031327-1031338promoter 内 1756-1767 bp - 2234 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 6 1027939-1029093(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr02G001145 Chr02 NC_080388.1:20834116-20834127promoter 内 3909-3920 bp + 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 5 20831301-20834035(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTG
SmilChr02G001146 Chr02 NC_080388.1:20852343-20852354promoter 内 3753-3764 bp + 237 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 5 20849516-20852106(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTG
SmilChr01G000507 Chr01 NC_080387.1:10235202-10235213promoter 内 3042-3053 bp + 948 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 5 10236161-10239270(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr01G000480 Chr01 NC_080387.1:9875318-9875329promoter 内 2413-2424 bp + 1577 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 5 9876906-9879740(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr02G002867 Chr02 NC_080388.1:48846477-48846488promoter 内 1629-1640 bp + 2361 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 5 48826093-48844116(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTG
SmilChr03G001597 Chr03 NC_080389.1:20284063-20284074promoter 内 3906-3917 bp - 84 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 20284158-20287446(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTG
SmilChr03G001596 Chr03 NC_080389.1:20261170-20261181promoter 内 3755-3766 bp - 235 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 20261416-20264053(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTG
SmilChr02G003029 Chr02 NC_080388.1:50996849-50996860promoter 内 3671-3682 bp + 319 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 50997179-51002895(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr02G001884 Chr02 NC_080388.1:34163417-34163428promoter 内 3478-3489 bp - 512 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 34163940-34164729(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTG
SmilChr01G000331 Chr01 NC_080387.1:6760930-6760941promoter 内 3451-3462 bp - 539 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 6759336-6760391(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr02G001840 Chr02 NC_080388.1:33550057-33550068promoter 内 3151-3162 bp + 839 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 33550907-33554160(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr03G000688 Chr03 NC_080389.1:7683319-7683330promoter 内 2892-2903 bp - 1098 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 7680743-7682221(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGTC
SmilChr02G001404 Chr02 NC_080388.1:26632381-26632392promoter 内 2471-2482 bp - 1519 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 26629385-26630862(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGGG
SmilChr02G000191 Chr02 NC_080388.1:2404329-2404340promoter 内 2395-2406 bp - 1595 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 2400809-2402734(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr01G000814 Chr01 NC_080387.1:17596812-17596823promoter 内 2375-2386 bp - 1615 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 17594313-17595197(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr03G001706 Chr03 NC_080389.1:22650930-22650941promoter 内 2293-2304 bp + 1697 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 22652638-22657573(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr01G004823 Chr01 NC_080387.1:66404275-66404286promoter 内 2226-2237 bp + 1764 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 66406050-66412791(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr01G000688 Chr01 NC_080387.1:15391356-15391367promoter 内 2223-2234 bp - 1767 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 15393134-15396782(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTG
SmilChr03G001637 Chr03 NC_080389.1:21111910-21111921promoter 内 1644-1655 bp + 2346 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 21114267-21117392(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr01G001353 Chr01 NC_080387.1:26801671-26801682promoter 内 1623-1634 bp - 2367 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 26804049-26809727(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTG
SmilChr02G004245 Chr02 NC_080388.1:64643240-64643251promoter 内 1300-1311 bp + 2690 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 64645941-64648038(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGGAGCAGAGCA
SmilChr01G001136 Chr01 NC_080387.1:23160136-23160147promoter 内 1262-1273 bp + 2728 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 23153104-23157408(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTG
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SmilChr03G001711 Chr03 NC_080389.1:22893772-22893783promoter 内 394-405 bp + 3596 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 22897379-22900731(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr01G000929 Chr01 NC_080387.1:19677442-19677453promoter 内 286-297 bp - 3704 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 19672530-19673738(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAGCAGAGCA
SmilChr01G000026 Chr01 NC_080387.1:482941-482952promoter 内 3849-3860 bp + 141 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 480225-482800(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTG
SmilChr02G001610 Chr02 NC_080388.1:29968948-29968959promoter 内 3514-3525 bp - 476 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 29969435-29972595(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTCTG